推进与dPCR分子诊断

数字PCR (dPCR)是一种越来越受欢迎的表现时提供了大量的独特优势的PCR应用于临床前研究,特别是用于检测罕见突变和核酸的精确量化。与许多新的研究方法,dPCR潜在临床应用场景也被越来越多的描述。¹

最近发表的研究在分析化学着手探索dPCR的临床效用。21个独立实验室量化一个罕见的单核苷酸变异使用数字PCR实验室之间的重现性高,证明方法的常规临床潜力测试。这项研究是第一个看的再现性和突出了几个潜在的优势技术在测量临床重要的突变。

找到更多关于dPCR和这项研究意味着我们向吉姆•Huggett首席科学家,LGC,萨里大学的高级讲师。

是什么促使LGC进行这项研究,你会发现什么?

本研究进行的欧洲计量研究计划署资助项目,BioSITrace,专注于发展(SI)的量化生物实体通过枚举的概念。dPCR有潜力成为一个高度可再生的方法量化的DNA和这个研究调查了再现性通过比较21的性能实验室当量化DNA包含突变与癌症有关的材料。研究表明,dPCR的确是高度可再生的在缺乏校准器时测量这些序列;绝大多数的实验室得到了相同的结果。三个,不,这显然是由于分析的结果而不是乐器。

这项研究有什么意义的采用数字PCR在临床测试?

这些发现表明,量化使用dPCR可以重现在本例中没有校准。这使它更简单的实验室获得类似的结果是至关重要的一个临床试验应用大量的病人在不同的实验室;一个重大的挑战在执行定量分析使用qPCR校准,确保实验室之间的协调。这项研究表明dPCR可以有一个重要的角色在推进分子诊断通过支持qPCR校准或本身作为一种诊断方法。我怀疑更先进的诊断方法要求改善灵敏度或量化性能需要如果精密医学是最大化的承诺。

决策者需要提供所有的证据吗?

虽然我不是一个医生临床决策很少是我的理解,在一个单一的结果。然而,对于这样一个方法论是临床上有用的贡献这样的决定它理想必须准确、可靠和可再生的。这些发现有助于越来越多的证据我们集团和其他人来说,表明dPCR是一个健壮的和可再生的方法,可能有助于在未来支持精确的诊断。

展望未来你能看到任何数字PCR的应用程序可以支持的方式qPCR未能吗?

是的,地区,那里qPCR目前无法竞争,在罕见的遗传变异在脱细胞DNA的检测,如分析在这项研究。另一个重要的问题是,下一代测序将eclipse包括dPCR在内的其它方法。上天让你测量比pcr方法和更多的突变基因分型结果已经选择的方法在许多临床实验室。然而,挥动时仍处于开发阶段量化或更敏感分析的必要性。我们的研究表明,dPCR可能是一个健壮的选择。dPCR也可能是一个有价值的工具,用于确保定量测量与门店是准确的,即使后来变得更成熟。

有任何领域你认为仍将与qPCR扎根?

考虑到临床试验的变化可以比作一艘油轮改变方向然后在短期到中期qPCR肯定是留在这里。相对便宜,快,已开发的高吞吐量的格式以及保健和,至关重要的是,是自动化的,它是一个主要的优势时。而qPCR和dPCR发明在同样的时间,正是qPCR广泛开发而dPCR不得不等待超过10年的微流体和乳剂化学的进步使它成为一个实用的方法。没有这种情况然后我怀疑dPCR将使用更经常由于特征证明了我们的研究;所以我认为dPCR有很多提供推进分子诊断在未来几年。

吉姆Huggett杰克拉德说,高级编辑技术网络。188金宝搏备用

参考

1。Huggett, j·F。考恩,S。& Foy c . a (2015)。考虑数字PCR作为一个精确的分子诊断工具。临床化学,61 (1),79 - 88。