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量化在慢性粒细胞白血病微小残留病

液滴数字PCR足够敏感检测bcr - abl融合基因等罕见的DNA序列。左起:样品划分为20000 nanoliter-sized滴;每个液滴进行PCR扩增端点,液滴含有目标DNA发出荧光;积极的滴数使绝对和精确的量化目标序列。

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由于引入酪氨酸激酶抑制剂(TKIs),慢性粒细胞白血病(CML)已经从一种致命的癌症治疗的慢性疾病。CML是由两个基因的融合,这产生了一个基因产物bcr - abl。这bcr - abl基因融合进而产生bcr - abl激酶,促进骨髓细胞的失控的增长。TKIs抑制bcr - abl激酶活性,使90%以上的CML患者诊断后存活至少五年。1

虽然TKIs很有效,患者必须经常忍受一生的治疗,因为当前的监测方法bcr - abl转录水平在血液中,索引的治疗效率,不够敏感,不再需要给医生信心TKI治疗(见表12)。更具体地说,监控循环bcr - abl的黄金标准定量PCR (qPCR),它可以检测到bcr - abl成绩单在浓度降至10000年的一份正常的患者样本册。3、4低于这个阈值,然而,测试可能返回一个“负面”的结果即使残余癌也称为最小残余疾病仍然存在。结束他们的患者TKI治疗基于察觉qPCR测量在两年内复发近50%的时间。5为了防止这种复发,医生通常保持病人药品的整个生命周期。

表1:定量PCR循环监测是当前的标准bcr - abl

方法 目标 灵敏度 优势 缺点
形态 细胞形态 5% 标准 可怜的敏感性
细胞遗传学 染色体结构 1 - 5% 广泛使用

低灵敏度

骨髓只

荧光原位杂交(鱼) 特定的遗传标记 0.1 - -5% 快(1 - 2天) 不检测其他克隆事件吗
定量聚合酶链反应 RNA序列 0.001 - -0.01% 非常敏感的

可怜的标准化

实验室的

不仅是在这些低水平的qPCR不够准确bcr - abl,也可以不可靠。具体的反应条件和引物的身份,调查和参考基因的使用会导致显著的变化bcr - abl测量。一项研究中,调查了bcr - abl在38个实验室水平和比较他们的结果从一个集中的实验室发现,只有58%的qPCR-based实验室方法实现了平均水平bcr - abl区别±1.2倍的参考方法。6

病人可以大大受益bcr - abl监控工具,可以检测到低水平的成绩单和更高的精度。TKI治疗产生的副作用,如疲劳、恶心、痉挛,在严重的情况下,肝脏损伤和充血性心力衰竭。2、5、7、8TKIs也昂贵:治疗成本之间的病人每年59000美元和76000美元(美元)。9

幸运的是,一个新的测试目前正在FDA审查,这可能会作为qPCR更敏感和可靠的替代品。这个测试,基于液滴数字PCR (ddPCR)技术,可以使医生停止病人的TKI治疗与确定性CML不会返回。这ddPCR-based测试使用相同的PCR试剂、寡核苷酸引物和荧光探针qPCR放大核酸样本。但与qPCR, ddPCR涉及到20000年nanoliter-sized滴样本的分区,在一个单独的PCR反应发生在每个液滴。每滴都只包含几个核酸链,如果其中一个是目标序列,如bcr - abl成绩单,液滴会发出荧光。因为每个核酸链分别放大,数量的一个计数荧光水滴将指示目标序列的数量包含在整个样本。这将使一个病理学家绝对量化目标序列,不需要参考曲线。

ddPCR可以量化bcr - abl浓度低至100000年一份参考副本,一个数量级比qPCR更敏感,且远低于传统的微小残留病的临床截止1000年在CML治疗1参考副本。4使用ddPCR分析bcr - abl记录从CML患者表现出更高程度的精度比通过使用qPCR。10

在过去的六年里,几个研究小组已经开始使用数字开发方法PCR来衡量bcr - abl10、11、12这样的研究成果将有助于为数字PCR CML监测成为一个新的标准。实现这一点,不过,ddPCR-based测试仍然需要获得广泛认可的诊所。因此,一些努力来评估的有效性ddPCR在临床的设置。停止TKI研究后的生活,例如,是一个前瞻性临床试验旨在研究CML患者的复发的速度停止TKI治疗后发现是缓解使用qPCR(定义为< 0.01%bcr - abl两年的成绩单浓度)。13这些病人将与ddPCR同时被监控,允许调查人员来比较这两种方法。这个试验,这是第一的,预计完成2019年9月,年底可能还会增派更多TKI停止研究。

ddPCR获得临床验收,其灵敏度和可靠性将使医生确定病人的血液以更大的确定性,bcr - abl水平促进聪明决定患者的疗程。随后,该工具将允许医生更自信地停止病人的治疗和防止癌症诊断后,他们的余生生活。

引用

1。Druker B。5年随访的患者接受伊马替尼治疗慢性粒细胞白血病。新英格兰医学杂志》上2006 355 (23),2408 - 2417。10.1056 / NEJMoa062867

2。Radich, j .我如何监测慢性粒细胞白血病的残留病。血。2009 114:3376 - 3381。doi 10.1182 / - 2009 - 02 - 163485血。

3所示。莫理,a .量化白血病。新英格兰医学杂志》上。1998 339 (9):627 - 9。doi: 10.1056 / NEJM199808273390911。

4所示。吴作栋,H。敏感的定量在慢性粒细胞白血病微小残留病使用微流体数字化聚合酶链反应测定。白血病和淋巴瘤。2011 52 (5),896 - 904。doi: 10.3109 / 10428194.2011.555569

5。森。。年龄和dPCR可以预测复发在CML患者停止伊马替尼:ISAV研究。美国血液学杂志》。2015 90 (10)910 - 914。doi: 10.1002 / ajh.24120

6。布兰福德年代et al。理想的性能特征bcr - abl测量在国际报道规模,使其一致的解释个别病人反应之间的响应率和比较的临床试验。。2008 112 (8),3330 - 3338。doi: 10.1182 / - 2008 - 04 - 150680血

7所示。里,我。肌肉骨骼疼痛患者停药后慢性粒细胞白血病的伊马替尼:一种酪氨酸激酶抑制剂戒断综合症?临床肿瘤学杂志2014 (25),2821 - 2823。doi: 10.1200 / JCO.2014.55.6910

8。酪氨酸激酶抑制剂(TKI)治疗的副作用(在线)。Rye Brook,纽约州:白血病和淋巴瘤协会,2018。可以在:www.lls.org/leukemia/chronic-myeloid-leukemia/treatment/side-effects。2018年9月14日通过。

9。Padula W。成本效益的酪氨酸激酶抑制剂治疗慢性粒细胞白血病的策略在慢性阶段后一般进入伊马替尼在美国。美国国家癌症研究所杂志》上。2016 108 (7)。Doi: 10.1093 / / jnci / djw003。

10。詹宁斯。检测和量化数字PCR bcr - abl1融合转录本的液滴。分子诊断学杂志。2014 15 (2)147 - 140。doi: 10.1016 / j.jmoldx.2013.10.007。

11。。液滴数字PCR BCR / ABL (P210)检测慢性粒细胞白血病:微小残留病的高敏感方法和疾病进展。欧洲血液学杂志》上。2018 101 (3),291 - 296。doi: 10.1111 / ejh.13084

12。麦尔。优化数字滴bcr - abl PCR。分子诊断学杂志。2019年21 (1)27-37。doi: 10.1016 / j.jmoldx.2018.08.012

13。Atallah E。设计和理由停止后的生活酪氨酸激酶抑制剂(去年)研究,前瞻性,单一群体纵向研究在慢性粒细胞白血病患者。BMC癌症,2018 18 (1),359。doi: 10.1186 / s12885 - 018 - 4273 - 1。

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