克里斯蒂·亨特谈靶向蛋白质组学

AB SCIEX蛋白质组学应用总监Christie Hunter博士在最近于日本举行的2013年HUPO会议上获得了2013年科学技术奖，以表彰她对靶向蛋白质组学突破性方法的开发和商业化的贡献。

靶向蛋白质组学最近被Nature Methods评为“年度方法”，我们利用这个机会与Christie交谈，了解更多关于这一领域的知识，以及AB SCIEX系统如何促进研究。

AB:你能介绍一下靶向蛋白质组学吗?
克里斯蒂·亨特(CH):在有针对性的实验中，你要问一个非常具体的问题，并设计你的整个实验，以得到这个具体问题的答案。在有针对性的MS实验的情况下，使用QTRAP系统上的多反应监测工作流程来做这件事的优点是很多的。在这里，我们可以专注于量化感兴趣的蛋白质子集，并以高精度量化它们，并在许多样本中重复地做这件事。此外，对于大型研究，数据分析和信息学很好地简化了生产力。

AB:靶向蛋白质组学是如何改变蛋白质组学领域的?
CH:由于这种技术的敏感性和特异性，我们可以使用更快的方法来继续提高分析的吞吐量。我们已经看到越来越多的研究正在进行，样本数量越来越多，这让我们能够更好地了解我们正在研究的生物学。

AB SCIEX QTRAP®系统如何促进靶向蛋白质组学研究?
CH:QTRAP系统在蛋白质组学领域被定性工作流程主导的时候进入市场，但开始理解定量工作流程将是该领域成功的关键。由于该仪器是一种混合仪器(三重四极线形离子阱)，它既能进行多重反应监测的定量工作流程，也能提供定性分析的离子阱功能。它使我们能够将这项技术推进到蛋白质组学实验室，并提供独特的工作流程，这是高度可行的。下一波靶向蛋白质组学将使用SWATH采集，这是一种数据独立采集策略，在我们的生物学研究中对大量蛋白质进行靶向定量。

AB:您认为您2006年发表的《主要血浆蛋白的定量质谱MRM测定》的关键影响是什么?
CH:有许多论文表明，使用MRM技术可以定量少量的多肽。此外，三重四极杆仪器已经是医药行业执行目标定量的行业标准。我认为这篇论文最引人注目和最有影响力的地方在于，我们展示了可以在生物基质中量化更多的多肽，这是非常有趣的。我们评估了一些社区中最重要的关键问题，并表明该技术确实是一个可行的选择，可以改善我们接近蛋白质肽定量的方法。

AB:靶向蛋白质组学的未来如何?
CH:在过去的10年里，我们在靶向蛋白质组学领域取得了很大的进展。仪器仪表有了显著的改进，我们的软件和试剂工作流程也有了很大的发展。下一步将继续朝着越来越高的通量前进，这样我们就可以在我们的研究中测量大量的样本，以更好地验证发现蛋白质组学发现的一些有趣的蛋白质。这将涉及样品制备的改进和LCMS的创新。

克里斯蒂·亨特接受了技术网络执行编辑阿什利·博登的采访。188金宝搏备用你可以找到阿什利谷歌+并关注科技网络188金宝搏备用推特．