和其他病毒一样，严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)会随着时间的推移而突变和进化，导致B.1.1.7、首先在英国被发现2020年12月。在大多数情况下，微小的基因变化“最终都是无关紧要的，”PerkinElmer的阿尔温德·科桑达拉曼(Arvind Kothandaraman)说188金宝搏备用．然而，“在其他情况下，这些突变可能导致病毒变得更具传染性，对宿主构成威胁，”他补充说。
SARS-CoV-2变种是不断地监控由世界卫生组织(世卫组织)SARS-CoV-2病毒进化工作组和几个国家主管部门合作，以便能够快速识别相关突变，并研究其对病毒传播能力和疾病严重程度的潜在影响。当前对策的有效性，如诊断，治疗而且疫苗还进行了评估，并对如何减少负面影响进行了调查。
对B.1.1.7变异的研究发现，该谱系包含编码spike (S)蛋白的基因的多个突变，这可能会影响一些诊断测试的有效性。Kothandaraman说:“据报道，英国[B.1.1.7]变异S基因的69-70缺失导致了阴性结果，这是由于某些RT-PCR检测所针对的遗传区域完全缺失。”
什么是RT-PCR检测?
RT-PCR是逆转录聚合酶链反应的缩写。它是一种广泛用于检测病毒和其他病原体遗传物质的分子方法。
Kothandaraman评论说:“RT-PCR检测是COVID-19诊断的金标准，因为这种分子检测方法提供了一种高度可靠的方法来检测人类样本中是否存在SARS-CoV-2。”
测试样本通过口咽拭子或鼻咽拭子或唾液获得。样本中存在的任何SARS-CoV-2遗传物质都被分离出来，并通过逆转录将RNA转化为互补DNA。以SARS-CoV-2基因组特异性核酸序列为靶点的引物被用于定义病毒DNA中被放大的部分．
1月8日，美国食品和药物管理局(FDA)发出警报向临床实验室工作人员和医疗保健提供者强调，“任何用于检测SARS-CoV-2的分子检测都可能出现假阴性结果，如果该检测评估的病毒基因组部分发生突变。”
对于B.1.1.7变体，主要关注的领域是针对S基因的测试。Kothandaraman评论说:“使用针对刺突蛋白的检测方法的实验室应该密切审查性能，并观察假阴性结果。”针对病毒其他基因组区域的测试，如ORF1ab基因和包膜(E)基因不受S基因突变的影响，因此它们对抗B.1.1.7变异的性能不应降低。
由于大多数SARS-CoV-2 PCR检测使用多个遗传靶点而不是单一靶点，B.1.1.7变异对诊断的影响如下这并不是世卫组织预期的．FDA也建议检测模式除了其他目标外，针对S基因的测试可以帮助早期识别患者的新变异。显示S基因缺失的样本可以通过基因测序进一步表征。
这种变异对其他诊断方法(如用于快速大规模筛查的诊断方法)的影响如何?大多数抗原测试的目标是N蛋白的c端，由N基因编码，因此应该受到最小的影响。英国公共卫生部报告说，评估证实了这一点横向流动装置是有效的尽管所有测试的设备都是检测N蛋白而不是S蛋白。抗体分析的性能尚未评估，但检测S蛋白抗体的分析可能会受到影响．
除了B.1.1.7之外，其他SARS-CoV-2变种正在全球传播包括在南非首次发现的B.1.351病毒，以及在四名巴西旅行者身上首次发现的P.1病毒。很可能会出现更多感兴趣的变异，这可能会在基因组的其他区域引入突变，这可能会影响当前诊断方法和其他对策的性能。许多诊断提供者正在积极监测SARS-CoV-2变体，通过检查病毒基因序列和测试真实样本，确保他们的检测保持有效。
“英国和南非的变种只是病毒进化的两个例子。科学界将继续跟踪突变，研究病毒进化，并相应地调整检测、治疗和疫苗，”Kothandaraman总结道。
PerkinElmer的专业诊断总经理Arvind Kothandaraman正在与技术网络的科学作家Anna MacDonald交谈。188金宝搏备用
