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让CRISPR朝着正确的方向前进


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CRISPR可以说是生命科学中最热门的话题,它继续成为头条新闻。CRISPR廉价、快速、易于使用,已经进入世界各地的实验室,被一些人视为颠覆了一切。

为了解决与当前系统相关的一些问题,IDT最近推出了一种新的CRISPR方法,该方法已被证明可以提高基因组编辑的效力。题目告诉我们Alt-RTM CRISPR-Cas9系统为研究人员提供了许多好处,包括提高效力和安全性。

为了了解更多关于这个新系统以及它如何帮助研究人员,我们采访了Mark Behlke医学博士。IDT首席科学官。

AB: IDT的Alt-RTM CRISPR-Cas9系统是如何克服嵌合单导rna (sgRNAs)的问题的?

Mark Behlke (MB):单导向rna工作得很好,但也有一定的局限性。它们的设计是为了有效地从表达载体中获得单个功能的CRISPR指南,而不是必须依赖于两个单独的rna被合成,然后必须退火后合成(很像shRNA和siRNA的情况,当从表达载体中合成时)。该系统的局限性包括需要克隆/测序表达结构或需要自己的体外转录(IVT) sgrna。IVT sgrna可以工作,但需要在长凳上花费时间和劳动。自制的IVT sgrna很难进行质量控制,研究者必须相信所制备的转录产物质量良好。也许更重要的是,长IVT sgrna是先天免疫系统的强触发器,可以杀死某些类型的细胞。这在塑料适应性细胞系如HeLa或HEK293细胞中不是问题,但在研究原代哺乳动物细胞时可能是一个重大问题。

IDT-Alt-R-CRISPR-Cas9-Syste.png

Alt-RTM产品采用合成RNA寡核苷酸,可以在试管或平板中使用,这意味着现在实验室不需要人工来制作或控制CRISPR指南——它们可以立即使用,就像PCR引物一样。此外,IDT优化了CRISPR RNA (crRNA)和反式激活crRNA (tracrRNA)序列,并仔细添加了化学修饰,以提高功能活性并限制触发免疫反应的风险,从而产生更健康的细胞。

AB:使用你们的Alt-RTM CRISPR-Cas9系统的研究人员有望看到哪些改进?

MB:更快,更少的劳动密集型实验,更高的编辑效率,更低的毒性。

AB:你认为CRISPR/Cas9可以继续从“正确方向的巧妙推动”中受益吗?这种方法在未来的治疗应用中有潜力吗?

MB:是的,这仍然是一项非常年轻的技术,我们应该期待不断的改进。多家制药和生物技术公司已经在研究CRISPR技术的治疗应用。我完全预计,第一个体外和后来的体内医学方法将有助于治疗人类疾病。

AB:我们最近听说了另一个具有巨大潜力的CRISPR系统,CRISPR/Cpf1。这一发现对CRISPR/Cas9意味着什么?

现有的化脓性链球菌(Spy) CRISPR/Cas9系统可以工作,并且有多种来源的工具供研究人员使用。新编辑平台的发现并不能改变现有Spy Cas9系统运行良好的事实。相反,新系统扩展了工具箱并增加了新的可能性。Acidaminococcus (As) Cpf1系统最重要的区别是具有“TTTN”PAM序列与Spy Cas9的“NGG”PAM序列。这扩大了可靶向的序列空间,以包括例如疟疾等富含at的基因组,或能够靶向哺乳动物基因组中富含at的位点。新的CRISPR系统不会使Spy Cas9过时,而是会为研究人员提供更多的选择。

Mark Behlke医学博士接受了Ashley Board的采访。阿什利是技术网络的执行编辑。188金宝搏备用
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