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改进的癌症生物标志物分析


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上周Labcyte宣布了一项来自国家癌症研究所的100万美元奖励(NCI)创立了一种创新的方法来检测样本中的癌症相关蛋白质。与金丝雀中心和弗雷德·哈钦森癌症研究中心的合作最初将专注于乳腺癌检测。

我们采访了Labcyte的高级研究员Joe Olechno,以了解更多关于合作、其研究以及Labcyte被选中的原因。

AB:与金丝雀中心和弗雷德·哈钦森癌症研究中心的合作是如何开始的?
Joe Olechno (JO): Mark Stolowitz博士是斯坦福大学Canary癌症早期检测中心蛋白质组学核心设施的主任,他意识到Labcyte声学技术具有将小体积液体直接转移到表面的能力。与传统的液体处理器不同,这种材料永远不会与移液管或喷嘴发生物理接触。相反,它被声能从容器中喷射出来,液滴传播到适当的目的地。液滴很小,在他使用的系统中,它们是160 pL.(一皮升,pL,是一升的百万分之一。160pl的墨滴直径约为60微米。这大约是人类头发的直径,比这句话末尾句号的直径小得多。)虽然很小,但该系统可以以每秒500滴的速度快速喷射液滴。Stolowitz博士第一次意识到我们的技术是通过他对成像质谱的兴趣。Labcyte仪器已经很好地用于将MALDI基质、酶和试剂的微小液滴转移到组织样本中,为成像研究做准备。(http://www.mc.vanderbilt.edu/root/vumc.php?site=ims而且http://www.maldi-msi.org/).斯托罗威茨博士很快意识到,我们的技术可以很好地配合他的想法,改进癌症生物标志物分析。

AB:这项研究的目的是什么?
JO:我们的目标是用最先进的MALDI质谱仪在5 kHz激光下运行的自动化平台将同时快速定量96个样本中的癌症生物标志物。我们计划证明吞吐量至少比目前使用多反应监测(MRM)的LC-MS/MS方法快10倍。在显著提高通量从而降低成本的同时,我们将获得与使用三重四倍质谱分析相当或更好的灵敏度、可重复性和动态范围。

AB:为什么选择Labcyte ?
JO:最初选择Labcyte是因为我们现有的Portrait spot能够满足Stolowitz博士转移液体的要求。声学技术非常精确。由于没有任何物质接触液体,因此没有交叉污染的机会,也没有化合物从塑料尖端渗出的机会。声波技术可以传输各种流体,而不受表面张力的影响。它很容易转移饱和MALDI基质的流体。我们的标准仪器可以立即改变用途以满足他的需要。

AB:目前在样本中检测癌症相关蛋白的问题是什么?Labcyte仪器如何帮助克服这些问题?
JO:目前最好的生物标记物定量技术具有出色的灵敏度、可重复性和动态范围。然而,他们使用液相色谱作为固有步骤。液相色谱法(HPLC)是一种相对较慢的技术,需要几分钟。新技术消除了高效液相色谱步骤,提高了一个数量级的产量。这不仅会对实时分析产生影响,例如外科手术,而且还意味着单个实验室可以轻松地提高产量,而无需额外的人力,从而降低实验室的成本,并最终降低消费者的成本。这项新技术也非常适合自动化,并提供了全天候运行分析的可能性。

Joe Olechno接受了技术网络执行编辑Ashley Board的采访。188金宝搏备用你可以找到阿什利并关注科技网络188金宝搏备用推特

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