PNAS条验证BioMark™数字阵列分析转录因子从单个干细胞

研究发表在《美国国家科学院院刊》上表明BioMark™数字数组从Fluidigm公司,结合PCR,提供一种新的基因调控网络的研究工具。

在这项研究中,数字阵列被用来量化基因在绝对copies-per-cell基础上,在五类鼠骨髓的造血干细胞前体。

结果显示有不同的基因表达模式的类内常见的髓系祖细胞和管家成绩单GAPDH显著差异。

这个分歧凸显了需要测量单个细胞的抄本,为了清楚地理解细胞编程。

“我们相信数字阵列技术将显著影响干细胞研究的步伐,”欧文·韦斯曼博士说该报告的作者之一和弗吉尼亚&位路德维希教授临床研究的斯坦福医学院的癌症研究、干细胞生物学和再生医学研究所。

数字数组有可能克服困难固有PCR检测微型板块平台上实现。

传统的mRNA分析涉及总测量大量的细胞,它可以掩盖监管州决定细胞命运的关键。
数字数组,另一方面,是由单细胞分析。它通过分区的混合样品和检测组件到大约1000 nano-volume反应室。

芯片的体系结构,以及适当的加载稀释样品,确保每个室都包含1份或没有目标基因的拷贝(互补)。

片上热循环后,只有钱伯斯阳性基因的荧光信号,它允许拷贝数的一个特定的细胞为准确计算——数字PCR。