Sage-N魔法师™的特色是开源的蛋白质组学工具相集成

Sage-N研究公司和系统生物学研究所(自己的特色)已宣布ISB Trans-Proteomic管道(TPP)的集成分析平台Sage-N研究,Inc .)魔法师设备。

这种集成研究实验室和核心设施可以复制自己的特色的权力和能力的高通量蛋白质组学分析工具不需要广泛的信息技术(IT)支持或昂贵的集群计算机。

魔法器具可以插入任何网络提供高分辨率、高通量数据分析通过web界面。

TPP的整合,一个统一的基于网络的工具套件可以有效地识别、描述和量化蛋白质在复杂混合物中使用任何供应商的质/ MS数据。

质/ MS技术继续变得越来越强大和广泛使用的工具来识别和量化复杂样品中的蛋白质,蛋白质组学研究相关社区面临着两个关键的挑战等产生的大数据集的分析研究。

首先,蛋白质组学实验室需要构建复杂的IT基础设施有足够的计算能力来处理收集到的数据,第二,获得的结果从序列数据库搜索引擎需要统计验证来确定搜索结果的误差率。

博士Ruedi Aebersold,系统生物学研究所的创始人和首席研究员TPP项目,“蛋白质组学的研究团体和蛋白质组学社区作为一个整体将大大受益于交通便利和高吞吐量的系统分析与透明质/ MS蛋白质组数据提供错误的估计算法和数据获得的。”

“魔法系统的吞吐量和易用性和易于维护与Trans-Proteomic管道的支持将有助于解决这些需求。”

Sage-N研究声称,使用新模式匹配加速器™硬件和系统技术,蛋白质鉴定的魔法师设备提供处理吞吐量,否则可能需要数百个计算节点。

魔法师设备目前支持SEQUEST®算法,使用额外计分模块在计划之中。

Trans-Proteomic管道系统生物学研究所是一个开放源码的分析平台,统一存储和串联质谱数据的分析基于开放的XML文件格式。