不同解释策略在MS/MS肽片段数据中发现PTM的评价

摘要
获得的高质量MS/MS谱在典型的序列数据库搜索中无法解释的现象是众所周知的。虽然蛋白质鉴定是成功的，但手工操作非常费力，在大多数情况下甚至不可能将这些光谱与任何建议的蛋白质序列相匹配。

为了克服这一问题，开发了二遍搜索程序。在这里，我们报告了我们内部开发的工具PTM-Explorer (Protagen AG，多特蒙德，德国;Bruker Daltonik GmbH，柏林，德国)。两个重组激酶蛋白的LC-MS/MS数据集(MAPK 12和MAPK 13)已用于评估。