GeneGo发布新版本数据挖掘平台
GeneGo, Inc.宣布其旗舰数据挖掘平台MetaCore 3.0的新版本。新版本的设计允许科学家根据几乎任何类型的实验数据来计时构建联合信号/代谢网络。
认为这一突破可能为基因表达功能分析、蛋白质组学、代谢组学、高含量筛选(HCS)、siRNA等类型实验数据的分辨率提供一个量子飞跃。
MetaCore 3.0还提供了一个解析器,用于在网络、规范通路、细胞过程和人类疾病之间的连接通路的背景下可视化代谢组学数据。
新版本还增加了企业范围的数据管理和用户访问系统以及特定疾病网络。
“我们相信在这个新版本中,我们解决了功能数据分析中的一个主要问题,即信号和信号之间的解耦
GeneGo首席科学官、总裁兼创始人Tatiana Nikolskaya博士说。
“活细胞对刺激的反应主要是通过改变其核心生物化学,许多代谢物充当信号分子和介质。从受体-配体相互作用到某些代谢途径激活的整个过程的全基因组正式化是理解疾病或药物作用等复杂情况的关键。
然而,到目前为止,即使对研究得最好的酵母来说,信号传递和代谢途径在很大程度上也是不可连接的。现在,我们已经为人类和其他哺乳动物完成了这个项目。通过整合代谢和信号网络,以及受体-配体相互作用,MetaCore的分辨率光谱涵盖了从细胞过程到单个蛋白质小分子相互作用的所有水平。”
GeneGo业务发展副总裁Julie Bryant说:“实际上,这意味着我们的客户现在可以在一个系统中分析在任何其他环境中不兼容的多个数据集,例如临床试验中通过临床前大鼠表达阵列和细胞培养siRNA实验产生的人类血液的质谱代谢数据。”
“考虑在动物系统和筛选数据中研究代谢生物标志物和药物作用模式的交叉验证。MetaCore 3.0是生物学家和化学家在整个药物发现过程中共同使用的环境。
我们还通过一个复杂的企业账户和实验管理系统解决了实验、知识和分析的共享问题,该系统通过电子笔记分级访问共享账户、数据和结果交换以及注释。”