进化和选择大豆抗线虫轨迹

我们已经表明,theRhg1轨迹是一个多基因重复的非规范抗性基因严格串联形成。使用全基因组测序和PCR检测,我们表明,不同大豆种质登记入册包含一个10份衔接着重复单位31.2 kb。个人重复单元分为四种类型,使用单体型定相技术,与一些Rhg1位点携带三个不同类型的重复单元。Rhg1轨迹显示强烈的选择和签名重大连锁不平衡边界周围的基因组中的重复大量的超过15000登记入册。周围的地区重复显示的迹象non-neutral进化和遗传变异性高人口从不同的地理位置。周围的连锁不平衡Rhg1重复登记入册携带不同的重复类型允许Rhg1基因型种质到达使用大型公共推断SNP数组数据,揭示超过800新的潜在的阻力来源。