基因组工具Psilocybe cubensis传播

Psilocybe cubensis是一种真菌，合成治疗量的裸盖菇素，裸盖菇素，和其他活性色胺。了解这一合成途径中的遗传变异可以揭示负责特定化学型的变异。为了更好地理解这种多样性，我们首先建立了一个参考级基因组Psilocybe cubensis。利用Pacific Biosciences的HiFi测序和Phase Genomics的近距离连接试验(HiC)，我们构建了一个染色体标度，注释了参考基因组Psilocybe cubensis．利用这一参考基因组，我们对另外81个基因组进行了测序和绘制Psilocybe用于编目该属中常见的遗传多样性和微生物污染物的基因组。设计了多重定量聚合酶链式反应(qPCR)法同时定量大肠杆菌而且沙门氏菌物种污染Psilocybe cubensis物种鉴定。这些工具可以协助物种的定向繁殖，污染物识别和p . cubensis物种的验证。

在本次网络研讨会中，我们将探讨:

• 基因变异Psilocybe cubensis合成途径
• 同时定量的qPCR方法设计大肠杆菌而且沙门氏菌物种污染Psilocybe cubensis物种鉴定