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历史数据和新的LIMS


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我最近接到了一个非常好的市政实验室主任的电话,关于LIMS, LIMS实施,好的LIMS实现者的谈话转向了历史数据。我笑了,感谢她提出这篇文章的想法。我真该想到的。几乎每一次LIMS销售,无论是市政当局、商业实验室还是大学,历史数据的问题都会出现。


大多数购买LIMS的实验室,如果他们正在更换旧的LIMS或购买他们的第一个LIMS,已经运行了一段时间。众所周知,根据各种规定,历史数据通常必须保存一段时间,并且经常需要用于一般趋势信息。在许多情况下,这段时间是五年。那么,现在怎么办?


有几个处理历史数据的选项。最常见的方法是保持原样,创建历史数据存储库或将旧数据完全集成到新的LIMS中。我们将在下面详细讨论所有这些内容。


保留旧数据不变:


这往往是实验室不想听到的答案,然而,这往往是最好的答案。当旧的记录保存方式(无论是否在LIMS内)不能满足其要求时,实验室就会寻找LIMS。较新的LIMS在短时间内在功能上取得了很大的进步,远远超过了5到7年或更早的LIMS的功能。通常,为了使旧的数据能够整齐地适应新的LIMS,实验室必须使新的LIMS满足旧的约定和标准。一个常见的例子是方法论。在旧的LIMS中,即使是目前销售的LIMS的旧版本,如果对一个方法有轻微的更改,那么必须创建第二个方法(即EPA方法8260B,通常有8260B, 8260BClientA, 8260BClientAsub, 8260BClientB等)。我经常看到实验室有10多个相同方法的副本。将其乘以许多方法的变体数量,找到一个总共运行80种方法并在其LIMS中列出350多种方法的实验室并不罕见。


在较新的LIMS中,对方法的更改不需要创建新方法。相反,该方法在客户端或项目级别进行修改,允许实验室在只列出一种方法的情况下对方法本身进行多种更改。这不仅使登录和分析人员更容易选择方法,而且还便于质量控制。更新一种方法的MDL研究是一回事,更新10 +是另一回事。


试图将所有历史数据压缩到新的LIMS中通常会导致新LIMS的大部分功能损失。你永远不会买一辆新车,然后要求提高油耗,要求堵塞的喷油器,并影响后面扬声器的高音呜呜声……那么你为什么要对你的LIMS做这些呢?让事情简单通常是最好的。买一个新的LIMS,重新开始。然后,只需在实验室的一台或两台计算机上保存旧LIMS的副本,直到不再需要这些数据,然后将其退役。通常情况下,旧数据必须保留,但很少使用。


创建历史数据存储库:


历史数据存储库是介于保持现状和完全集成旧数据之间的一个中间步骤。在历史数据存储库中,最终确定的数据基本上被移动到一个平面表中,新的LIMS可以在其中访问它。通常,必须以某种方式组合这些最终确定的数据,以使其适合新的LIMS。使用上面的例子,如果一个特定的方法从被列出10次下降到2到3次,并且变化,那么来自10个不同方法的数据必须以一种逻辑方式“压缩”,以适应现在列出的2到3个方法。此外,只有最终数据的部分原因是没有两个商业上可用的LIMS是完全相同的。你不能简单地把零碎的东西带过来;你只能全部修改,然后把它带过来,或者最终的数据必须符合。


在新的LIMS中充分集成历史数据:


坦率地说,在一个新的LIMS中完全集成历史数据并非易事。由于没有两个LIMS是完全相同的,因此需要将数据分解为最细粒度的形式,然后将数据重新输入到新的LIMS中。这可能吗?就像IT世界中的许多事情一样,是的,它是。需要多长时间?可能是最初报价的三倍,这个报价“以防万一”已经被夸大了。除了花费的时间外,其成本往往令人望而却步。虽然实验室事先要求这样做很常见,但当时间和金钱的现实暴露出来时,他们很少选择这条路线。在确实发生的情况下,它通常是作为LIMS公司和实验室之间的联合项目,在更长的时间内完成。理论上这似乎很简单。 The reality though is that every result reported is the result of an analytical run; That analytical run potentially had a prep batch, has taken place on a calibrated, verified instrument (initial verification, MDL study, etc.) by an approved analyst after being sampled (all field data) and logged in (date/time stamped, cooler temperature verified, etc.). Each one result can have 10 to 50 associated details. When that is multiplied out over all of the individual results for five years, one can image the immense task at hand. True, some tables may be directly imported and some details easily brought over, many eventually have to be done one by one and matched.

如何决定处理历史数据?


成本是与历史数据相关的主要考虑因素;如何处理历史数据的成本,包括数据的易用性、数据的转换以及财务需求。虽然保留旧数据或将其保存在历史数据存储库中可能对许多实验室(如果不是大多数实验室的话)都非常有效,但有些实验室确实需要对历史数据进行全面集成,而不是采取变通措施。实验室应该仔细评估他们需要什么,并与他们潜在的LIMS供应商交谈。请注意,如果没有仔细查看和访问数据的后端和前端,LIMS供应商可能不得不给出数据迁移方面的总体估计,或者可能直接拒绝。还需要评估历史LIMS的使用条款,以确保现有程序的一个稳定的、未经编辑的副本可以在所需的时间内使用。


事实上,在新LIMS的销售过程中,这种对话几乎总是在某种程度上发生。有时实验室对这些选项了如指掌,有时则不然。这是一个应该在过程早期进行的对话,这样任何人,无论是实验室还是LIMS供应商,都不会基于不切实际的假设和期望来处理令人不快的意外。


如需更多信息,请联系:

Robert Benz, rbenz@khemia.com, 843-810-2075

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