的人类基因组计划、国际合作研究为了整个人类基因组序列,于2003年完工,比原定计划提早两年。它标志着“基因组时代”的诞生,一个时期下一代测序技术(门店)将极大地提高能力和速度,同时降低成本。
近20年计画完成后,基因组时代的影响是可见的在现代社会和科学研究。基因组测序已经不可或缺农业研究,个性化医疗,研究人类的历史和最近一次是在浏览我们的应对COVID-19大流行。
十五年计画完成后,科学家们盯上了一个新的目标:地球BioGenome项目(EBP)。描述作为生物学的“月球探测器”项目,它旨在序列,目录和描述的基因组命名的180万种植物、动物和真菌-和单细胞真核生物——在地球上,在10年。
“EBP的想法是我策划的,罗宾逊教授基因和教授约翰·克雷斯2015年,“Harris Lewin奥斯本,罗伯特和Rosabel赋予椅子和特聘教授的进化与生态加州大学戴维斯在一次采访中解释道188金宝搏备用技术网络。“主要的激励因素是我们都遇到障碍在我们的研究由于缺乏高质量的真核物种的基因组序列。”
为什么EBP必要吗?
三人一个探索性会议举行史密森学会2015年,参加了一些世界上最著名的基因组科学家和美国主要资助机构的代表,对项目的可行性进行调查。
会议得出的结论是,全球倡议,如EBP,为保护生物多样性和维持人类社会是必要的,它现在必须发生。列文解释道:“威胁世界的生物多样性、生态系统、农业和能源供应,由于气候变化、栖息地的破坏和其他人为因素是现在最重要的。”
了解生物多样性危机
地球上的生物多样性正在迅速下降——这就是所谓的生物多样性危机。一些科学家认为保护生物多样性表现为一个更大的挑战比应对气候变化。
根据联合国,本地物种的平均丰度在陆基栖息地自1900年以来已经下降了超过20%。超过40%的两栖动物物种,33%的造礁珊瑚和超过三分之一的海洋哺乳动物受到威胁。至少有680种脊椎动物物种灭绝以来16th世纪,超过9%的哺乳动物的驯化品种利用粮食和农业是在2016年前灭绝。
在项目开始之前,只有0.6%的已知的真核生物基因组测序。因此,基础知识和生物基础设施缺乏解决这些全球问题。一个内有DNA库为所有真核生活将极大地帮助保护工作在全球范围内,列文说:“保护基因组学是一个相对新的学科产生和利用基因组信息威胁和濒危物种的保护的目的。理解剩下的人群艾滋病的基因多样性物种管理计划的发展。”他指出,加州保护基因组学项目作为一个典型的例子,这样的管理计划。
EBP的诞生
未来两年,一系列的会议之后最初的讨论史密森学会——包括2017年第一次国际生物多样性会议基因组学和测序计划所有真核生物。在2018年的夏天,EBP宣言发表在美国国家科学学院院刊》上《美国科学院学报》(PNAS)杂志上。不久之后,该项目正式启动在秋天在伦敦的威康信托基金会。
宣言中概述了关键绩效指标和严格的EBP的时间框架。“我们必须为未来奠定基础通过完成这个项目在10年内,我们提出,以免为时过晚节省多达50%的基因组信息地球生物多样性的过程中可能会丢失正在进行第六次大灭绝地球上的生命,”列文说。
宣言还概述了EBP的逻辑顺序每个物种——而不是一个代表每一个家庭的成员或属。EBP背后的领导认为抽样每属一个物种或家庭不会提供一个现实的评估进化这些组织的复杂性。“虽然认识到它可能不是可行的获取样本为每一个物种,实用主义不否定的主要科学和社会需要试图这样做,”宣言读取。
当前进展和未来的观点
EBP正式启动了在伦敦的威康信托基金会在2018年的秋天。从2018年到2020年,该项目是在一个“启动”阶段,即重点是放在开发标准,策略,组织跨地区和国家转化项目和建设社区。bet188真人
“EBP将彻底改变进化的领域,并将对农业产生重大影响,医学和环境科学,”——哈里斯列文。
EBP由国际“网络的网络”,它作为其他的包罗万象的核心“大型”等达尔文的生命之树。迄今为止,43个附属机构和49个项目正在研究真核生物类群,和个人的科学家参与多个项目。哈里斯解释道:“我们数约100个国家的5000名科学家,现在参与EBP活动。这个国际社会积极参与这个项目的所有方面,从收集样本,生成和组装基因组和分析数据。”他预测,许多出生的合作通过网络将继续远远超出过去的基因组的测序。
2022年1月,EBP宣布它已经进入了一个新的阶段,过渡从试点到全面生产排序。该声明是伴随着一系列的论文发表在PNAS概述项目的一些重要成就迄今为止。
将生成的数据开放获取的财富,列文强调:“EBP的一员,每个机构和项目必须致力于自由和开放存取的数据,需要把原始数据和基因组装配到公共数据库,如基因库。”成员还必须承诺遵守生物多样性公约,多边条约有三个目标:保护生物多样性、可持续使用的组件的公正和公平分享的好处来自于遗传资源。
现阶段的目标——第一阶段是创建参考基因组~ 9400家庭分类,其中200已经产生。预计到2022年底,超过3000个序列将会完成。列文相信EBP的进步在未来几年将“彻底改变”进化的研究,有“重大影响农业、医学和环境科学,”他总结道。
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