测试COVID-19
COVID-19以来第一个病例被确定在2019年12月,在武汉城市,中国,这种疾病已经在全球迅速蔓延,夺去了成千上万人的生命。努力控制疾病和降低感染者的数量,包括旅行限制和社会距离学校关闭检疫等措施。
然而,博士Tedros Adhanom Ghebreyesus,世卫组织总干事,在一个新闻发布会上说2020年3月16日,国家需要做更多的通过增加率的测试,隔离和接触者追踪,他被称为“反应的支柱。”
在他的演讲中,他补充道:“你不能打一场火蒙住眼睛。我们不能阻止这个大流行,如果我们不知道谁是感染。所有的国家我们有一个简单的信息:测试,测试,测试。”
测试能告诉我们什么?
“传统上有两种类型的传染性生物诊断测试——测试的存在病毒感染(当前)和测试抗体病毒(之前感染),“免疫学教授埃莉诺·莱利和传染病,爱丁堡大学。
测试来识别一个人是否感染了SARS-CoV-2病毒在那个时间点(测试活动感染)是很重要的:
- 确保病人得到适当的治疗。
- 支持快速隔离受感染的病人进行追踪接触者,以防止该病毒的进一步传播。
- 确定在给定的一天有多少人感染。
测试显示如果一个人已经感染了SARS-CoV-2病毒在过去可以用来:
什么类型的测试方法?
检测病毒的存在
聚合酶链反应(PCR)
目前PCR病毒诊断测试的“黄金标准”。
在感染早期“PCR测试是很重要的,因为它可以帮助我们隔离感染者和控制疫情。PCR检测在爆发之后也很重要,因为它向我们展示了病毒是如何传播通过人口的比例,我们可以计算发展严重的并发症,它揭示了这种病毒有多危险对于不同的人来说,“伯明翰大学博士Zania Stamataki,病毒免疫学家。
现有的大多数COVID-19诊断是基于这种技术,包括:
- 第一诊断试验发表的世卫组织的指南COVID-19诊断检测。测试是发达的德国感染研究中心2020年1月。
- 疾病预防控制中心的检测协议(疾病预防控制中心2019 -新型冠状病毒(2019 - ncov)实时rt - pcr诊断面板),收到紧急使用授权(协会)的诊断和检测COVID-19 2月4日,2020年。
这样的PCR检测特定SARS-CoV-2病毒检测遗传物质(RNA)病人样本。
第一,获得样品从拭子从病人的鼻子或喉咙。如果存在,然后孤立SARS-CoV-2遗传物质使用DNA提取设备和免费(互补)复制由病毒RNA模板。引物放大这些病毒的DNA序列。一系列的引物可用于特定于SARS-CoV-2基因组目标核酸序列。
序列特定探测器是用来绑定的下游引物和荧光信号在反应。探针的一端与荧光报道分子标记,同时另一个冷却器分子。当他们身体上的接近,荧光较低,但如果目标序列存在于样本,调查结合和聚合酶裂解的反应。这分离荧光记者和饮料冷却器不再抑制了荧光信号。然后发出荧光检测到在每一个PCR循环,存在多个目标cDNA,探针裂解,信号就会变得越强大
如果没有礼物,SARS-CoV-2 cDNA探针不发出荧光,表明病人没有COVID-19。
pcr方法可以检测到病毒RNA的含量非常低,所以是高度敏感的并且可以使COVID-19的早期诊断几天后感染,甚至在临床症状出现之前。然而,他们需要人才和成熟,往往昂贵的设备,回车场时间经常超过24小时(包括批样品)意味着他们不适合快速的即时情况。抽样技术差的问题也可以引起假阴性率相对较高。试剂短缺造成瓶颈在许多国家,限制数量的测试,可以执行。
另类分子方法的发展
冯,奥马尔Abudayyeh,乔纳森Gootenberg最近开发的开放获取夏洛克研究协议和设计资源,可以用来开发一个CRISPR-based COVID-19测试使用纸带。
其他几个研究小组目前也在这个领域致力于开发测试,和数量预印本最近被提交。预印本是尚未同行评议的文章。因此被视为初步结果,应该解释为这样的。
- 刘博士的实验室长春康涅狄格大学健康中心提交了详细描述一体化双CRISPR-Cas12a预印本测定方法快速、超灵敏、特异和视觉检测的病毒核酸。
- 另一个预印本描述潜在的逆转录Loop-Mediated等温扩增(RT-LAMP)用作更快、更便宜的即时测试。
这样的方法可以提供优势包括更快和更适合的即时使用,不需要昂贵的设备。然而,可能的局限性包括需要不同的反应系统和多个手动操作。
抗原检测
而不是检测病毒RNA的存在,检测病毒抗原测试蛋白质,如发现病毒的表面。这些测试会发现如果一个人正在感染了病毒,一旦感染了,抗原也消失了。
他们可能是设计用于拭子样本,可以用在现阶段的PCR等分子测试。
然而,根据迈克尔•斯金纳博士在病毒学伦敦帝国学院读者:“确定的复杂性和生产所需的抗体测试工具包意味着发展远远落后,抗体。”
一群欧洲科学家光子学目前正在开发一种超灵敏的激光传感器,检测SARS-CoV-2抗原在几分钟内从唾液或鼻拭子。
测试之前感染
抗体测试
基于抗体的测试显示如果一个人已经暴露于病毒通过检测人的血液或血清抗体。他们是快速和简单的测试,适合即时使用。
与抗体测试所面临的挑战是知道何时做测试。IgM抗体产生,免疫球蛋白抗体遵循几天后。一个测试可以区分IgM和感染的免疫球蛋白可以给信息阶段。
现在仍不清楚一个人自身的抗体将从SARS-CoV-2保护他们免受再次感染,如果是这样,这种保护将持续多久。
大量的抗体测试目前正在追求:
- 一个预印研究人员伊坎医学院的细节ELISA测定的发展能够检测SARS-CoV-2抗体最早3天出现临床症状。
- EUROIMMUN的基于抗体的COVID-19诊断测试最近收到了CE标志。
- 贝克曼库尔特是开发测试冠状病毒检测IgM抗体和免疫球蛋白。
加速COVID-19诊断测试的可用性
全球正在努力增加测试,通过扩大和克服瓶颈在当前方法,以及推动研究开发新的,优越的测试。欧盟配额等措施可以帮助加快这一过程。
欧洲大学协会允许未经批准的医疗产品和医疗产品中使用未被批准的用途的美国在紧急情况下,当没有足够的,批准和现实可用的选择。的美国卫生和人类服务部部长决定2月4日,2020年,COVID-19突发公共卫生事件,随后宣布的情况下合理的授权 紧急使用在体外诊断 检测和/或导致COVID-19的病毒的诊断。2020年2月29日, FDA发布的指导 使实验室认证下执行高测试CLIA使用他们验证COVID-19诊断测试之前收到FDA授权。指导进一步更新 2020年3月16日, 包括政策使国家授权实验室在其国家或地区开发自己的COVID-19测试和执行样品测试,如果没有提交一个欧洲大学协会请求。
当前欧洲大学协会COVID-19诊断包括:
- 疾病预防控制中心2019 -新型冠状病毒(2019 - ncov)实时逆转录酶聚合酶链反应(RT)诊断面板(CDC)
- 纽约SARS-CoV-2实时rt - pcr诊断面板(中心、NYSDOH)
- cobas SARS-CoV-2(罗氏分子系统,Inc。)
- TaqPath COVID-19组合套装(热费希尔科学,Inc .)
- 黑豹融合SARS-CoV-2 (Hologic, Inc .)
- COVID-19 rt - pcr测试(美国实验室公司)
- 莱拉SARS-CoV-2化验(Quidel corp .)
- 追求SARS-CoV-2 rrt - pcr(探索诊断传染病,Inc .)
- 雅培实时SARS-CoV-2化验(雅培分子)
- Simplexa COVID-19直接(DiaSorin分子公司)
- ePlex SARS-CoV-2测试(GenMark诊断,Inc .)
- Primerdesign有限公司COVID-19 genesig实时PCR试验(Primerdesign有限公司)
- 爱视宝Xpress SARS-CoV-2测试(造父变星)
- BioFire COVID-19测试(BioFire防御,LLC)
- Accula SARS-Cov-2测试(台面生物技术有限公司)
- PerkinElmer新的冠状病毒核酸检测设备(PerkinElmer, Inc .)
- AvellinoCoV2测试(Avellino实验室美国公司)
- 实时荧光rt - pcr设备检测sars - 2019 ncov (BGI基因组学有限公司)
- 现在ID COVID-19(雅培诊断斯卡伯勒,Inc .)
- NxTAG浸扩展板试验(Luminex分子诊断公司Luminex分子诊断,Inc .)
- NeuMoDx SARS-CoV-2化验(NeuMoDx分子公司)
- QIAstat-Dx呼吸SARS-CoV-2面板(试剂盒GmbH)
- Cellex Inc . qSARS-CoV-2免疫球蛋白/ IgM快速测试(Cellex Inc .)
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COV-19 IDx试验(Ipsum诊断,LLC)