在我们的污水检测SARS-CoV-2的秘密

SARS-CoV-2最具挑战性的方面之一是其在无症状和pre-symptomatic个人传播的能力。如果没有外在COVID-19的迹象,病毒引起的疾病,我们如何知道谁来测试,隔离并联系跟踪?原因有很多,包括成本、个人合规和实验室物流、不可能每个人定期测试。相反,该行业正在寻找方法来提高理解COVID-19蔓延,,目的是更有效地防止暴发。最有前途的解决方案之一是成功实现今天是wastewater-based流行病学(business events)。business events帮助公共卫生官员发现COVID-19病毒RNA在废水的量化水平。这个系统可以帮助识别SARS-CoV-2社区人们表现出症状之前。在大学这样的设置,这是一个改变,让流行病学家拦截COVID-19病例和大规模的疫情发生之前采取行动。政府可以发行限制和分配资源来帮助管理疾病及其传播。

当一个人感染了SARS-CoV-2,导致COVID-19的病毒,它可以通过病毒RNA,检测到环境中。来源:NIAID。

废水的基础知识测试

人感染SARS-CoV-2后,他们开始释放到环境中的病毒RNA通过他们的粪便好几个星期。研究表明,将存在于病毒RNA27日至89%人的粪便在浓度0.8到7.5的日志₁₀基因复制每克SARS-CoV-2感染者。当流到污水,病毒RNA似乎是稳定的一周。重要的是要注意这一点一个人将病毒RNA即使他们是无症状,可能继续他们不再测试后积极呼吸道化验。一旦样品被,他们可以使用各种方法进行了测试。因为稀释后低丰度率和复杂的样本矩阵,方法具有灵敏度高、抑制剂宽容,如液滴数字PCR (ddPCR),准确的检测至关重要。ddPCR方法可以是单个或多路复用对不同SARS-CoV-2病毒标记建立疾病预防控制中心以及各种过程控制用于这些研究。

根据抽样法和ddPCR测试使用的类型,污水测试可以检测SARS-CoV-2感染的存在只有少数的个人在一个大楼,宿舍或城镇。早期的研究丹麦一家医院发现这种病毒可以检测到10000年只有两个病毒棚友。这个积极的测试可以引发一连串的事件识别受感染的个人和确定进一步传播的感染是可以预防的。

business events测试在实践中

有许多方法可用于废水样品收集。一系列规模较小的样本可以获得24小时(复合抽样),或一个示例可以在高峰流(抓取采样)。以其广泛的时间表,复合抽样通常比一次性快照提供了更好的总体情况。然而,抓住抽样可以更好地确定快速变化的事情,比如细菌的水平。

许多研究小组和社区开始实施business evebet188真人nts和看到了可喜的成果。

流行病学家可以使用污水处理厂收集废水从整个社区更好地理解病毒的流行,SARS-CoV-2等。信贷: 切萨皮克湾项目 。

在2020年9月,圣母大学开始使用business events在选择宿舍来减轻负担的测试管理。凯尔·毕比博士,圣母大学的副教授,获得了快速反应的研究得到美国国家科学基金会的资助,收集废水样品,进行测试。圣母大学的管理与毕比上安装一个连续autosampler主要污水通风孔。autosampler设置为2小时每30分钟收集废水。然后样品分析与ddPCR每周两次。到目前为止,已经符合疾病负担的数据已经通过其他测试报告来源。结果显示高水平在一个特定的宿舍时,宿舍的所有成员,然后需要测试作为一个预防措施。通过了解有多少居民真正阳性记录在business events监测水平相比,毕比进一步能够确认潜在的这种类型的测试和改进这种方法,以供将来使用。

科罗拉多州立大学,研究人员把17泵在校园里。泵是用来捕获85毫升样品每15分钟。样品进行分析使用ddPCR每周两次,有时在24小时内返回结果的集合。的高灵敏度和绝对量化这种方法,研究人员可以对结果和理解如果只有一个人在一个建筑有病毒。

研究人员在维吉尼亚州也将这一想法付诸实践21-week研究覆盖一个地区的170万人。抓住和复合样本收集每周从九个不同的废水植物和随后与ddPCR测试。研究人员能够检测水平的10之间的病毒RNA¹到10⁴副本100毫升⁻¹。他们使用这项研究有助于优化协议,考虑等因素和病毒回收率试验用于各种工作流的研究。

一起工作

COVID-19大流行提供了一个机会让我们了解如果business events可以作为一个方法来管理社区内感染。bet188真人一些研究人员提出全球合作共享数据和协调方法作为团体继续学习更多的知识。此外,定量控制和标准可以帮助确保cross-lab可比性和数据安全性。

污水分析欧洲核心小组(分数),全球水病原体项目和别人联手启动COVID-19 WBE协作。这一行动努力帮助集中和协调COVID-19 WBE努力。除了关于活动有关的各种通信WBE测试,网站还将包含协议帮助协调方法和一个非正式的聊天论坛成员可以讨论信息或问题WBE测试。的协议,包括信息,如样本存储或提取技术,将有助于研究人员产生类似的结果,因此产生强大的和有用的数据集。

我们了解更多关于business events,这将是重要的看一下这两个城市的基础设施设置,集中污水设施,农村和低收入与分散式污水系统设置。这些基础设施之间可能会有变化,所以应该考虑到这个协议获取样本。这是一个原因,共享数据和协议可以帮助推动该领域。

虽然business events是一个较新的研究领域,其战斗COVID-19大流行的潜力是革命性的。随着越来越多的用例出现,该领域的专家必须共同努力,分享发现和协议的价值最大化business events在我们的社区。bet188真人