准确和可靠的固体肿瘤分析

牛津(油气痕迹)最近推出了新的基因技术SureSeq™固体肿瘤小组在临床遗传科学协会在英国伯明翰(acg)会议。

这个新的60-gene下一代测序hybridisation-based浓缩面板提供了研究人员准确和可靠的固体肿瘤分析已知的和新颖的变体。

了解更多SureSeq面板,其关键特征和在acg会议上接受我们采访了斯蒂芬·阿奇博尔德博士的通信主管油气痕迹。

阿瑟:SureSeq固体肿瘤面板提供什么福利?

斯蒂芬·阿奇博尔德博士(SA):SureSeq固体肿瘤小组提供显著的好处在替代门店面板。基因的内容已被公认的癌症专家小组,包括英国癌症研究、西米德兰兹郡威塞克斯地区基因遗传学实验室和国家参考实验室,包括60关键基因已知包含一系列重要驱动突变的癌症类型。此外,与amplicon-based板,通常只分析突变热点,SureSeq固体肿瘤小组目标整个每个基因的编码区,使小说变异的发现以及热点分析。

油气痕迹的诱饵设计确保更加统一和高效捕获所有的目标区域,这样所有在场的变异可以被称为最大的信心。高灵敏度的测定还允许异构样本的准确分析,常见的一种需求在处理固体肿瘤样本。

SureSeq固体肿瘤小组已经优化处理100 ng formalin-fixed的基因组DNA,石蜡包埋(FFPE)样本,允许研究人员打开存档的潜在样本。

阿瑟:最近新闻提到SureSeq最小化PCR偏见和重复,这是为什么重要?

山:SureSeq固体肿瘤面板的一个关键优势是它利用hybridisation-based浓缩,它提供了准确减少重复数据的能力,这意味着只有独特的数据,分析了原始DNA链。这是特别重要的在分析低频等位基因,如异构肿瘤样本中找到。Amplicon-based浓缩容易放大的偏见,特别是在有限样本的情况下或者检测微小等位基因频率的能力是必需的。这种偏见可能导致错过了重要的变体或占绝对优势。

阿瑟:面板带有你的变异分析报告,提供什么信息?

独特的SureSeq固体肿瘤报告为研究人员提供了自由探索和回顾性审查数据和额外的或新的选择标准,而不需要额外的内部生物信息学资源。使用报告,数据可以很容易地过滤通过众多参数,包括基因、深度的报道,体细胞变异和预测对蛋白质的影响。此外,所有变体完全注释与各种数据库(例如dbSNP、宇宙、Genecards和人类)提供上下文。

阿瑟:人民是如何反应小组在最近的临床基因科学协会(acg)会议?

山:SureSeq固体肿瘤小组一直特别推出以来,好评。越来越多的研究人员正在确定hybridisation-based浓缩和带来的好处,因此,对该综合面板的需求正在快速增长。荣誉研究员马修·史密斯博士西米德兰地区遗传学服务,做了一个很好的参加介绍SureSeq固体肿瘤的发展和验证小组在最近acg会议,进一步强调在这一领域的重大利益。

更多信息请访问www.ogt.com。

斯蒂芬·阿奇博尔德博士是阿什利董事会,管理编辑技术网络。188金宝搏备用你可以找到阿什利Google +并遵循技术网络188金宝搏备用推特。