解决小分子分析的挑战

从识别新药物靶点和癌症治疗提高中药标准,小分子的研究涉及到许多领域。然而,该协议在执行小分子鉴定和识别往往不如他们应该。

188金宝搏备用高级主管Andreas Huhmer与组学、生命科学质谱热费希尔科学学习新的热科学Orbitrap IQ-X Tribrid质谱仪可以帮助解决小分子识别和描述的复杂性。

灰板(AB):关键特性的Orbitrap IQ-X Tribrid使它适合对小分子的研究呢?

Andreas Huhmer(啊):的Orbitrap IQ-X Tribrid质谱仪是一种进化的热科学Orbitrap ID-X Tribrid质谱仪,几年前推出,改善ID-X的主题,我们开始。小分子在化学上是非常多样化的,这意味着你必须能够解决这些分子以不同的方式而言,它们是如何分析。新仪器有能力片段小分子与不同的方法使用不同的能量,这已经被添加我们所说的温和改善捕获功能。如果有不稳定分子会分崩离析的过程中分析,他们现在保存下来,这样你就可以得到更多的结构信息的真正脆弱的分子。

另一个特点,我们添加到化学多样性IQ-X地址。有很多的小分子芳香结构或双键,尤其是脂质。这些可以解决不同分散技术,在这种情况下使用紫外线光离解(UVPD)激光。这使得能量分子,使其分解以独特的方式,为用户提供了一个额外的能力看结构不同的分子。

另一种方法我们已经改善了IQ-X是看能力非常复杂的混合物。当我们介绍了仪器,我们推出了所谓的热科学AcquireX智能数据采集工作流程。这个工作流开始为仪器提供一些信息集中在样品或样本无关。一个简单的例子是溶剂的引入作为背景。仪器商店信息,这样当样品注入,仪器简单地忽略了所有的东西,没有任何的样品。基本上,我们已经改善了,智力与我们所说的先进的深度扫描工作流。在这里,你可以将信息从不同的样本集。这使它更有效地发现的结构信息,可能是重要的。还有许多其他的改进,你会期望从一个下一代的乐器。这些包括,加强低质量范围,质量更好的过滤和先进的分段四极峰确定功能。

阿瑟:添加另一个特点是实时库搜索,你能告诉我更多吗?

啊:如果你看一个典型的药物发现的努力,试图了解药物的候选人,你可能与一个特定的化学结构,研究复合,当引入一个鼠标或人类代谢和通常转换为其他化合物。在传统的方法需要大量的努力算出会发生什么,所以人们假设,寻找预期质量。IQ-X这都是做,实际上,在真实的时间。你说你要做的就是,这里是感兴趣的分子,药物分子,例如然后请看任何碎片光谱获取和了解有关这个特殊的药物分子。想象,药物分子分解成三个部分;他们有特殊的分子特征在一个特定的m / z。这些出现在一个分裂事件,每次你说,给我更多的信息,触发MS3或花更多的时间在这个高峰。这是一个非常优雅的方式来找到更多关于这些未知的样本可能与药物候选。仪器做所有的努力工作而获得数据是一个突破。

阿瑟:必须为研究人员节省大量时间。你有时间储蓄人设法达到的例子吗?

啊:是的,当然。在一个特定的示例中,这个团队在看一个典型的药物发现场景类似于上面所述的我。在传统的方式,例如ID-X,他们能够找到11代谢物。与IQ-X及其实时库检索能力,他们能够增加17代谢物。这是一个很好的例子,如何利用这种能力更多相关的方式取得进展。

另一个很好的分析物的思考是天然产品,通常药物分子还脂质。这是一个领域,我们认为会有很大的激动。给另一个例子,药物分子通常glucuronidated作为人体新陈代谢的一部分,因为这是一种药物在粪便中排出。这增加了一个双键,所以你现在可以使用UVPD源。因此,如果你发现药物分子,或一个药物分子的部分部分,你可以看看是否有glucuronidated形式。您可以快速添加glucuronidation组的质量,然后寻找特定的质量在你的分析。这是一个巨大的节省时间,使事情更有效。

AB: AcquireX和Met-IQ工作流提供实验室吗?

啊:想象这样一个场景:你对三组大鼠或小鼠的药物。在这种特殊情况下,你想了解这些不同类型的老鼠是否对药物有不同的反应,或如果他们有不同的代谢药物的方法。通常在研究现在,你有转基因老鼠,所以他们有特殊的表型。通常,您将运行这些作为三个独立的实验,然后尝试在分析有意义的数据。与先进的扫描,可以结合信息从这些三组的老鼠,然后提交到深度扫描。如此之深扫描可以考虑特定的差异源自每个动物组,分析他们在同一时间。例如,您可以运行第一和第二组老鼠,然后把这两个之前的信息分析第三组。

阿瑟:根据热费希尔科学网站AcquireX使公正的解释。你能解释一下是什么意思的解释和AcquireX帮助研究人员如何实现这一目标?

啊:我们所说的公正的解释是从样本中提取更多的信息的能力。想象有100种代谢物在一个特定的示例中,但你只能通过你的努力识别30到50人;你基本上忽略了另一半的这种药物的信息。你自动偏见的结论。能够挖掘更深,你会得到更少的偏见的结果。

阿瑟:IQ-X新auto-ready离子源,使人行道校准。你能跑我通过这个和它提供的好处?

啊:这可能是更令人兴奋的特性之一的效率。通常情况下,客户需要时间休息源,穿上另一个特定的源校准系统每隔几天,因为他们希望能够做ppm型精度的小分子分析。更好的质量精度,更精确的解释数据将为小分子。实际上IQ-X,源自动校准仪器。这不是随机的方式完成的。IQ-X可以识别当没人使用它,例如,因为之前刚刚结束和下一个跑不预定,并将利用这段时间来检查校准。这并不意味着它总是需要校准;它可能只需要刷新的校准。它是自动设置。因此,当再次所需的仪器,它是新鲜的校准和准备好了。 It is possible to schedule calibration in many different ways between instruments in different conditions. This is another very good example of how this instrument drives efficiency for the users. And the more accurate your measurements are through strong calibration, the better results you will achieve.

阿瑟:IQ-X包含UVPD来源,你能给我介绍一下,提供什么?

啊:能够激发分子通过UVPD激光使您能够片段并最终确定小分子有双键或三键。一个很好的例子是脂质具有双键的脂肪酸。如果你让他们UVPD片段方式的特点。脂类是特别具有挑战性的,因为如果他们没有一个双键,他们不轻易片段。使用非化学术语,本质上与UVPD脂肪酸组切半激光,然后看看部分允许您看看甘油三酯或双甘酯和理解哪些脂肪酸甘油三酯集团的一部分。UVPD提供了一个更好的方法来评估这些脂肪酸组的长度是非常有用的,因为没有其他方法。

Andreas Huhmer是灰板,编辑主任技术网络。188金宝搏备用