生成无间隙的,Telomere-to-Telomere植物基因组装配

重建植物基因组是一个艰巨的任务由于其不寻常的倍性,大量的重复元素现在和他们通常大的规模。测序技术能够生产的长阅读,如牛津纳米孔,有希望获得更加完整和准确的基因组装配。这里的关键的第一步是提取高分子重量DNA使用适当的协议。在纯合子基因组的情况下,这种技术可以产生叠连群,代表完整的染色体,揭示复杂地区的建筑,如着丝粒,rDNA集群,或集群paralogous基因。

在这个演讲中,卡洛琳将专注于香蕉基因组的测序,并重建完整的染色体端粒,端粒使用纳米孔测序技术。

• 生成无间隙的,telomere-to-telomere植物基因组装配与纳米孔技术
• 使用长和超长纳米孔读取解决高度重复序列