FDA,加州大学戴维斯分校,安捷伦科技和疾病预防控制中心创建公开食品病原体基因组数据库

美国食品和药物管理局(FDA),加州大学戴维斯,安捷伦科技有限公司和美国疾病控制和预防中心(CDC)今天宣布合作创建一个公共数据库100000年食源性病原体基因组来帮助识别速度的细菌负责食源性暴发。

数据库将提供一个路线图开发的测试来识别病原体和提供信息的起源病原体。测试有可能显著降低典型的公共卫生在食源性疾病暴发的响应时间几天而不是几个星期。

开放数据库将允许研究人员开发测试,可以确定样品中细菌的类型在几天或几小时,大大快于大约一个星期现在之间需要诊断和遗传分析。
由加州大学戴维斯分校,安捷伦,FDA和名为“100 k基因组计划”的合作将是一个为期五年的努力,大约100000重要的食源性病原体的基因编码序列,使这个信息在一个自由的公共数据库。的基因组测序将包括重要的食源性致病菌,如沙门氏菌,李斯特菌和大肠杆菌。

”这个重要的项目将利用基因组测序的尖端技术的推进我们的理解和应对食源性疫情,”食品和药物管理局局长玛格丽特•a .汉堡说FDA医学博士”很高兴提供科学和技术专长需要创建和维护这个食源性病原体数据库将完全访问和对保护公众健康产生长期的影响。

FDA提供超过500已经完成的沙门氏菌全基因组序列草案,成千上万的其他重要的食品病原体为测序菌株,与生物的支持。FDA科学家还将参加指导项目并在需要时提供技术援助。

安捷伦提供科学技术、仪器和资金支持加州大学戴维斯分校的一部分活动。

“每年在美国有超过4800万例的食源性疾病,”Mike麦克伦说安捷伦化学分析集团的总裁。“如此严重的问题要求一个同样大的对策。我们看到这个项目来提高很多人的生活质量,同时最小化的一个主要业务风险食品生产商和分销商”。

使食品供应安全的目标消费者,新的数据库将大大加速测试的原材料,成品和环境在食源性疾病暴发的调查样本。这种类型的信息还使科学家能够使新发现驱动开发新的方法来控制致病细菌在食物链中。

疾控中心将提供其食源性疾病专家,测序菌株和其他信息在项目中使用。疾控中心专家还将为项目指导委员会。

“保护美国人口从食源性疾病是一个公共卫生重点和需要公共和私人合作伙伴的共同努力下,”贝思说,医学博士,美国疾病控制与预防中心的国家中心主任新兴和人畜共患传染病。“我们欢迎有机会加入一项显示承诺推进我们的技术能力为食源性疾病监测和疫情应对。”

确定负责食源性疾病和疫情的病原体只有一个公共卫生突发事件应对的一部分。食品安全官员仍然需要能够确定哪些食品或原料被污染,它是从哪里来的。这可能是一个挑战,特别是当multi-ingredient食品相关或相同的成分是来自世界各地的多个供应商。

使用时作为整体的一部分监测和疫情调查系统,新数据库的基因信息,结合地理信息的病原体,将帮助公共卫生官员更迅速地查明污染负责食源性暴发的源头。

美国农业部食品安全及检验局(FSIS)还将合作这个项目。”这一行动显示了巨大的希望我们改善我们的能力识别和追踪的食源性疾病暴发的潜在来源,”美国农业部食品安全副国务卿伊丽莎白哈根博士说。“FSIS打算提交重要的测序菌株从我们的监管测试项目在加州大学戴维斯分校,我们期待利益公共数据库可以提供联邦、州和地方公共卫生机构”。

基因组测序将由加州大学戴维斯分校的协调,也提供其收藏的细菌样本。的测序将新成立BGI@UC戴维斯基因组测序。

“这具有里程碑意义的项目利用加州大学戴维斯分校与华大基因研究院合作,在基因组学的世界领袖,我最致命的信息食源性病原体,”哈里斯列文说,副校长在加州大学戴维斯分校的研究。“这将彻底改变我们基本的了解这些致病微生物。”

序列完成他们将存储在美国国立卫生研究院的国家生物技术信息中心的公共数据库。

作为合作的努力的一部分,加州大学戴维斯分校目前组建一个财团支持100 k基因组计划。该财团参与者将从各种利益相关者包括联邦、州和地方公共卫生实验室,食品制造商、行业和学术组织。有兴趣加入合作组织可以联系巴特魏玛,加州大学戴维斯分校项目主管bcweimer@ucdavis.edu。