小说框架重构神经网络与高通量的工具

大脑映射的传统方法基于透射式电子显微镜(显微镜)可能需要几十年才能拼凑图片。在本周的《PLoS生物学,犹他大学的研究团队和科罗拉多大学博尔德分校的报告技术进步,将大大加快高速“颜色”超微结构大脑的过程映射。研究进展包括软件构建和查看t级从传统显微镜获得的图像。“我们的目标是释放一个电子显微镜及web提供图像的全球网络营的大脑网络分析师,”罗伯特·马克说研究主任莫兰在犹他大学眼科中心。“这改变了竞技场为构建大脑地图年代从几专业实验室的台式电脑全世界生物学家。”

新开发的自动化工具科罗拉多大学博尔德分校,3 d电子显微镜中心每周允许捕获25000 TEM图像。在平行,科学计算和犹他大学的成像研究所开发的软件自动将成千上万的图片合并到gigabyte-scale马赛克,马赛克排列成t级卷。最后,团队在莫兰眼科中心开发TEM-compatible分子探针和分类标记每一个细胞的分子签名软件,创建“颜色”TEM成像。

研究验证自动化算法、分子标记和影像工作流通过研究神经网络在正常哺乳动物视网膜变性的视网膜和遗传模型。作者还详细地图项目的所有连接在一个大视网膜体积。超过92%的400000 -图像体积已经建成,应该在4月中旬完成。作者詹姆斯·安德森解释说,“这项技术让神经科学领域构建电路健康的神经组织的蓝图。我们可以比较病变组织这些蓝图来了解他们的大脑,用它们来评估治疗的有效性,不与其他方法所察觉。”

框架克服了之前的大规模TEM壁垒,使公共可视化与web-compliant观众。这是一个新方法探索创伤性脑损伤,神经退行性疾病,癫痫。这也使得筛选遗传模型的实用性。通过结合这些工具与先进的图像处理,可以通过TEM研究的问题只能由生物学家的想象力可能有限。

http://biology.plosjournals.org/perlserv/?request=get-document&doi=10.1371/journal.pbio.1000074