大麻基因组映射打败人类基因组计划基准
2011年,药物基因组学成为了大麻基因组测序的第一家公司。当时药物基因组学的首席执行官,凯文麦凯南表示他的灵感来源于他的几个朋友被诊断出患有癌症和遵循药用大麻的发展研究。麦凯南认为完整的大麻基因组测序和开放获取出版可以使研究人员在植物材料本身的国家是非法的研究药物和创建这个大池的知识可以加快发展的小说以大麻为基础的疗法。
基因组映射记录
虽然麦凯南公司确实创造历史的大麻的基因组进行测序,研究人员由于测序设备当时,大麻基因组低于设定的标准人类基因组计划(HGP)十年前。这些标准通常报告为一个基因组的将军,这是一个统计的表达一组的平均时间序列。为例子,计画报告500 kb的将军,这意味着50%的基因片段在HGP序列的长度超过500000个碱基对。
直到现在,这500 kb将军标准高不可攀了大麻科学研究者在试图大麻基因组序列相同级别的细节。2018年8月初,药物基因组学和他们的财务支持者,破折号,宣布他们成功地在640 kb将军大麻基因组测序,代表28%的改善计画的标准。使用技术太平洋生物科学,药物基因组学团队预测,1 mb的将军在一年之内是可以实现的。
为什么基因组片段长度有关系吗?
拥有更长的DNA序列是非常有用的分析时存储在基因组的信息准确。采访中破折号的公共新闻服务,缓冲力的新闻麦凯南说明接触的重要性,准确的解释。
“想象一下,试图读一本书的章节都打乱。你可以赚很多虚假的故事。举例来说:“的”,“他们的”,“美国国税局”。三种非常不同的意思。扩大这个段落和章节,这是一个大问题。我们使用基因组连续足以使2 - 3000个字母单词,但现在我们可以全额640000章。”
能够阅读大麻基因组在这些长“章节”时是非常有用的处理在基因组多态性。与年长的基因组测序技术无法实现尽可能大的将军,在基因组的多态性是一个主要因素是多么困难的一个基因组序列。在人类中,你会发现一个多态率1 1000年基地,但在大麻基因组中这是一个数量级较大,给多态性的1 100年基础差距巨大的困难时测序大麻。扰乱正常基因多态基因基地从母亲和父亲基因组序列预期,因此,很容易影响计算机系统可以识别从重建的模式。建立一个大麻序列与一个更大的将军最小化多态基因的统计效应,使它更容易为计算机解析和重构大麻的基因组。
实验室之外的影响
随着大麻的准确性测序的增加,也会潜在的应用程序的数量。最初开始作为一个任务让大麻研究也更容易现在改革的大麻菌株是专利。精度通过这种改进的排序可能允许大麻育种者更容易证明他们产生了独特的菌株获得专利申请过程中压力。也有权限使用这个更精确的分析来对抗不公正的发表专利通过测序菌株培养小规模大麻饲养者,加剧现有的专利。基因组测序可以提供一种明确证明如果两个菌株足以挑战专利是相似的。
这个创业的支持是一个关键的目标冲刺,目标是谁彻底改变当前科学出版市场通过使用他们的cryptocurrency平台创建一个crypto-incentivized和crypto-recorded同行评审系统。通过使用crypto-incentivized模型希望评论家与一个良好的声誉会更公平补偿他们的工作比在当前科学出版模式。crypto-recording系统将确保与大麻基因组相关研究数据仍将在公共档案馆多年来没有数据腐烂的风险。
