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雕刻的艺术使用自然的天然工具、蛋白质

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生活是由积木:小结构收集、安排和组装成更大的结构。这些结构的生物分子组成的串联为一个特定的生理功能。蛋白质是一个典型的例子这样的构建块。纤维状蛋白质如角蛋白、胶原蛋白和弹性蛋白建立了从单个组件形式结构如肌腱、肌肉纤维和骨头。这是生物的自然规律——汇编的指令是有机的。

当它不再是自然引导构建块,而是科学家吗?

作为一个新化学性质出版物显示,科学和艺术的边界变得模糊。1Sagar d·哈雷,副教授化学与化学生物学系在艺术与科学学院的研究人员已经开发了一个框架,用于工程现有的蛋白质分形图形

分形是什么?

分形是一个永无止境的模式。他们是由重复一个简单的过程在一个持续的反馈循环导致无限复杂的模式。2

分形在本质上是无处不在的

如果你吃过一个菠萝,在森林里散步,遇到了一个树(希望),或有一个雪花落在你的手掌,你就会熟悉自然分形在我们周围存在的事实。


T菠萝水果,巴西南部,是一个分形。来源:Pixabay。

你可能不知道的是,某些分形提供重要的生物功能。“他们提供关键的功能优势,这些形状的物体。例如,我们的肺(分)有一个网球场大小的面积(100 m2)在一个卷6 L,这使有效的气体交换(一种过滤),”哈雷先生说。

说到哈雷和团队的工作性质 生物材料在非整数维 年轻和弗雷泽声称:“分形原理大会最近被编码到DNA和蛋白质与分形几何,然后做一些有用的自组装是一个明显的下一个挑战。”3

绘画与磷酸化

哈雷等人认为,创建分形结构使用蛋白质,nanometer-micrometer长度范围,将使这些定制的材料作为过滤器。哈雷先生指出:“如果我们能控制紧急分形维数的大会通过定义分子结构的变化,我们可以为不同的应用程序开发定制的材料:例如,一个过滤器设备可能需要密集与可控密度(花)程序集。”

但对于哈雷,这都不是关于科学:“创造美丽和视觉上赏心悦目的事物对我也是一个动力。”He elaborates further on the rationale behind the research project in an eloquent博客

哈雷先生和他的团队利用蛋白质工程软件称为罗塞塔设计工程蛋白质组件有一个“坚持”属性,以应对共同的生物刺激:磷酸化。“这需要高昂的交互关联和有限的设计(但不是零)组件之间构象的灵活性。基于这个模型我们开发新软件模拟组件如何看起来像的~ 100年代纳米到微米尺度。因此,原子水平的建模使用的设计方法通知紧急高阶结构更长的长度尺度,“哈雷先生解释说。


花形生物材料使用工程蛋白质构建块。信贷:南希·埃尔南德斯,威廉汉森Manichev Slava


研究人员选择了两个酶——hexameric AtzA和四聚物的AtzC阿特拉津的降解途径,使多个分支结构的组件。
他们融合此处则pY AtzA标签。然后他们融合的高亲和性Src同源性2 (SH2)领域,充当绑定模块pY, AtzC。这使他们能够创建一个响应磷酸化和潜在的寡聚化。
年轻和弗雷泽评论研究者的选择磷酸化作为可逆组装和货物的触发器捕获:“无处不在的生物信号的选择机制为此预测材料的潜在用途,或与活着的生物系统——一个非常激动人心的和即将到来的可能性!”

合成和生物系统的接口

使用的技术研究提供承诺在一个过滤器等新技术的发展对生物修复(除草剂捕获的过程从受污染的水)。应用程序的工作也扩展到医学领域,有可能创建合成矩阵来研究人类疾病,或用于组织工程。
“我们想要追求的设计合成矩阵具有高表面积固定细胞。希望高表面积和生物相容性的蛋白质将使我们能够显示相关的生物分子(如生长因子、药物),以更好地控制细胞命运合成矩阵,为组织工程和bio-printing可能是重要的,”哈雷先生指出。
下一个是什么团队?“短期内我们希望能使分形设计方法更加健壮利用各种构件和其他刺激引起的材料。例如建筑光控总成。光应该允许更大的控制装置的动力学,并导致更有趣的形状。从长远来看,我们希望追求的一些应用程序上面所提到的,“哈雷告诉我们。

Sagar Khare莫莉坎贝尔说,科普作家、技术网络。188金宝搏备用

引用:

1。埃尔南德斯et al . 2019。Stimulus-responsive自组装的蛋白质分形计算设计。化学性质。https://doi.org/10.1038/s41557 - 019 - 0277 - y

2。Fractalfoundation.org。2019年。分形是什么?——分形的基础。(在线)可以在https://fractalfoundation.org/resources/what-are-fractals/(2019年7月25日访问)。

3所示。虹膜年轻和詹姆斯·弗雷泽。2019。生物材料在非整数维。化学性质。https://doi.org/10.1038/s41557 - 019 - 0286 - x



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莫莉坎贝尔
高级科学作家
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