简化外化世界中的分析性知识转移
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如今,大部分生物制剂和化学品的研发工作都外包给了外部机构。随着外部化和研究虚拟化的不断发展,基于知识交换机制的缺陷,挖掘实时和遗留分析化学数据集的任务将变得更加困难。随着更大、更广泛的合作伙伴关系的发展,这些缺陷将变得更加普遍,这将成为未来十年及以后需要关注的关键数据管理和信息学挑战。
我们采访了ACD/Labs全球战略总监Ryan Sasaki,详细讨论了这些挑战,以及ACD/Labs提供的系统如何使数据共享和分析更简单、更安全。
AM:关于数据管理的挑战,我们能否首先问一下,目前制药客户和他们的CRO合作伙伴之间是如何共享和沟通数据的?
RS:首先我想说的是,这当然取决于环境、数据的重要性以及制药公司与CRO合作伙伴的关系。但总的来说,目前共享合作伙伴生成的分析数据集最常见的方式是通过电子邮件、PDF文件、Word文档、电子表格等。许多公司将在门户网站或团队平台(如Microsoft Sharepoint)上管理他们的项目,或者简单地使用FTP服务器共享数据。然而,似乎很少有公司有一个强有力的机制来共享这些数据。
问:为什么目前的合作模式有缺陷,甚至是危险的?
RS:现实情况是,科学家并不需要他们的CRO合作伙伴生成的每一条分析数据。然而,当他们需要实际数据集时,通常需要通过电子邮件或打电话给合作公司的代表,要求他们提供原始数据的副本。有时由于时区问题或响应时间较慢,这可能需要半天甚至一天的时间。现在,人们比以往任何时候都更希望按需获得数据。
我不知道我是否会说目前的合作模式是危险的,但它确实是有风险的。任何时候,您都需要采取额外的预防措施,以确保这些过程以正确的方式进行,并得到正确的科学决策的支持。我曾经有一个来自大型制药公司的高级主管告诉我,在一天结束的时候,他们需要确保他们向市场提出的东西确实是他们在临床试验过的东西。他们还需要了解、监测和控制与产品相关的代谢物和杂质等物质。将这些事情联系在一起,隐藏在这些决策背后的是分析数据。其中一些工作是在外部网络中完成的,即使在合作关系结束后,大部分数据仍然保留在CRO站点。
AM:这种合作和数据共享模式必须是双向的吗?需要评估什么样的安全风险和注意事项?
RS:在理想的情况下,共享模式应该是双向的,不仅鼓励数据共享,还鼓励研究合作。然而,数据口袋也需要安全,有些数据并不是每个人都能看到的。这就是为什么在为此目的构建协作平台时,像软件多租户这样的东西是如此重要。这是一种确保只有特定的人和特定的团队才能看到特定的东西或拥有特定的特权的方法。
AM:云计算对未来的外包和外部化有多重要?这项技术与当今制药和生物技术的IT部门有多相关?
舒马赫:我认为这是非常重要的。它确实是在内部和外部网络共享全球数据的理想平台。几年前,我会说它不太相关,因为云中的数据安全仍然存在很多问题和担忧,特别是当他们处理机密和专有信息时。我并不想说这些担忧已经完全消失,但可以肯定的是,云在IT路线图和数据管理与协作方面的战略中扮演着巨大的角色。
AM:最后,你们的软件和相应的技术如何应对或帮助应对这一挑战?
RS:在描述与CRO代表联系并询问数据的过程时,有一件事我没有提到,那就是数据的可用形式。在分析领域,数据共享的一个主要问题是,数据是为各种各样的分析技术和更广泛的分析仪器供应商生成的。例如,您的一个CRO合作伙伴可能不运行与您相同的HPLC系统。因此,如果他们以他们专有的格式发给你原始数据,你无法打开,更不用说使用它了。这个例子涉及从NMR到LC-MS到IR和拉曼等所有技术。我们的软件旨在消除这种负担。由于我们与分析化学领域的仪器供应商建立了牢固的关系,我们的软件平台使我们的客户能够采取与供应商无关的方法来分析化学。我们的系统可以为用户提供从几乎任何供应商格式查看、处理和分析“实时”分析数据的访问权限。这确实使它成为与合作伙伴共享数据的理想平台,克服了不兼容和不一致的文件格式和软件支持的传统限制。
最后,我们不只是帮助同质化和管理这些不同的数据。我们用它做一些非常科学有趣的事情。我最喜欢的一个例子是我们的自动结构验证(ASV)技术。利用这项技术,我们可以自动监控CRO网络中的NMR仪器,提取数据文件,自动执行一些自动化处理和分析例程(包括质量检查,以确保数据与结构匹配),并将结果交付给制药公司的代表。正如我之前强调的,确保公司从cro中获得的数据和化合物的质量是非常重要的,所以我认为这是一个非常好的用途,我们的许多客户都对此感到兴奋。
AM:关于数据管理的挑战,我们能否首先问一下,目前制药客户和他们的CRO合作伙伴之间是如何共享和沟通数据的?
RS:首先我想说的是,这当然取决于环境、数据的重要性以及制药公司与CRO合作伙伴的关系。但总的来说,目前共享合作伙伴生成的分析数据集最常见的方式是通过电子邮件、PDF文件、Word文档、电子表格等。许多公司将在门户网站或团队平台(如Microsoft Sharepoint)上管理他们的项目,或者简单地使用FTP服务器共享数据。然而,似乎很少有公司有一个强有力的机制来共享这些数据。
问:为什么目前的合作模式有缺陷,甚至是危险的?
RS:现实情况是,科学家并不需要他们的CRO合作伙伴生成的每一条分析数据。然而,当他们需要实际数据集时,通常需要通过电子邮件或打电话给合作公司的代表,要求他们提供原始数据的副本。有时由于时区问题或响应时间较慢,这可能需要半天甚至一天的时间。现在,人们比以往任何时候都更希望按需获得数据。
我不知道我是否会说目前的合作模式是危险的,但它确实是有风险的。任何时候,您都需要采取额外的预防措施,以确保这些过程以正确的方式进行,并得到正确的科学决策的支持。我曾经有一个来自大型制药公司的高级主管告诉我,在一天结束的时候,他们需要确保他们向市场提出的东西确实是他们在临床试验过的东西。他们还需要了解、监测和控制与产品相关的代谢物和杂质等物质。将这些事情联系在一起,隐藏在这些决策背后的是分析数据。其中一些工作是在外部网络中完成的,即使在合作关系结束后,大部分数据仍然保留在CRO站点。
AM:这种合作和数据共享模式必须是双向的吗?需要评估什么样的安全风险和注意事项?
RS:在理想的情况下,共享模式应该是双向的,不仅鼓励数据共享,还鼓励研究合作。然而,数据口袋也需要安全,有些数据并不是每个人都能看到的。这就是为什么在为此目的构建协作平台时,像软件多租户这样的东西是如此重要。这是一种确保只有特定的人和特定的团队才能看到特定的东西或拥有特定的特权的方法。
AM:云计算对未来的外包和外部化有多重要?这项技术与当今制药和生物技术的IT部门有多相关?
舒马赫:我认为这是非常重要的。它确实是在内部和外部网络共享全球数据的理想平台。几年前,我会说它不太相关,因为云中的数据安全仍然存在很多问题和担忧,特别是当他们处理机密和专有信息时。我并不想说这些担忧已经完全消失,但可以肯定的是,云在IT路线图和数据管理与协作方面的战略中扮演着巨大的角色。
AM:最后,你们的软件和相应的技术如何应对或帮助应对这一挑战?
RS:在描述与CRO代表联系并询问数据的过程时,有一件事我没有提到,那就是数据的可用形式。在分析领域,数据共享的一个主要问题是,数据是为各种各样的分析技术和更广泛的分析仪器供应商生成的。例如,您的一个CRO合作伙伴可能不运行与您相同的HPLC系统。因此,如果他们以他们专有的格式发给你原始数据,你无法打开,更不用说使用它了。这个例子涉及从NMR到LC-MS到IR和拉曼等所有技术。我们的软件旨在消除这种负担。由于我们与分析化学领域的仪器供应商建立了牢固的关系,我们的软件平台使我们的客户能够采取与供应商无关的方法来分析化学。我们的系统可以为用户提供从几乎任何供应商格式查看、处理和分析“实时”分析数据的访问权限。这确实使它成为与合作伙伴共享数据的理想平台,克服了不兼容和不一致的文件格式和软件支持的传统限制。
最后,我们不只是帮助同质化和管理这些不同的数据。我们用它做一些非常科学有趣的事情。我最喜欢的一个例子是我们的自动结构验证(ASV)技术。利用这项技术,我们可以自动监控CRO网络中的NMR仪器,提取数据文件,自动执行一些自动化处理和分析例程(包括质量检查,以确保数据与结构匹配),并将结果交付给制药公司的代表。正如我之前强调的,确保公司从cro中获得的数据和化合物的质量是非常重要的,所以我认为这是一个非常好的用途,我们的许多客户都对此感到兴奋。
![Ryan Sasaki ACDLabs.jpg](http://www.dile1000.com/images/videos/Ryan%20Sasaki%20ACDLabs.jpg)
Ryan Sasaki接受了采访
安娜玛丽麦克唐纳
技术网络编辑。188金宝搏备用
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