CRISPR屏幕识别基因,帮助细胞抵抗西尼罗河,Zika病毒

UT西南研究人员今天报告第一次使用CRISPR全基因组筛选来确定一个基因,帮助细胞抵抗黄病毒感染。的一类病原体包括西尼罗病毒、登革热、Zika病毒和黄热病。

在发表的一项研究微生物学性质John Schoggins博士领导的研究小组,助理教授微生物学,使用尖端CRISPR技术识别IFI6基因作为一种强有力的抗病毒基因打靶黄病毒。研究人员然后使用传统的细胞培养的研究证实在防止感染Zika病毒基因的作用,西尼罗河病毒、登革热和黄热病病毒。

“其他研究用CRISPR基因所需的屏幕识别细胞基因黄病毒感染。我们的研究是第一个使用这种技术来识别细胞基因抑制感染,”南希Schoggins博士说该隐和杰弗里·a·马库斯在医学研究学者,为了纪念法案s瓦维尔博士和克莱顿基金会研究员。

“在哺乳动物中,细胞通过干扰素自然抵御病毒感染,一个分子,预警系统,发现一个病毒和细胞需要他们的病毒防御系统。细胞通过激活数以百计的干扰素刺激基因,”他说。“黄病毒导致重大人类疾病,干扰素是参与人体的先天免疫反应这些病毒。”

Schoggins博士说该团队使用最近开发的全基因组CRISPR筛选技术来确定干扰素诱导的基因发挥了重大作用,抑制黄病毒感染。他赞扬了研究生和博士布莱克·理查森和第一作者的合著者Maikke Ohlson,高级研究科学家在实验室。“布莱克执行所有的表型和机械的工作如何IFI6抑制黄病毒和Ohlson博士CRISPR屏幕允许我们发现IFI6强有力的抑制黄病毒感染,”他说。

“CRISPR屏幕,我们使用人类肝细胞和淘汰基因组中每一个基因一次——约19000个基因。然后我们与干扰素刺激细胞,知道这刺激通常会允许细胞抵抗病毒感染。不抵抗感染的细胞——因为他们缺失的基因由于CRISPR淘汰赛,我们使用新一代测序的身份相关的基因,”他说。

Schoggins博士解释说,CRISPR基因编辑技术作出这样极其有效的一项研究中,发现突出flavivirus-inhibiting IFI6的角色。

“辉煌的技术是所有这些CRISPR-targeted细胞汇集在一起,几大细胞培养的菜肴。细胞也贴上条码,让你知道该基因缺失从每个细胞,当你观察他们如何应对干扰素,”他说。

“技术是超级酷,”他补充道。

在细胞培养的研究中,IFI6基因——显然工作通过蛋白质产品,也称为IFI6——抑制黄热病、黄病毒感染肝脏。细胞工作IFI6基因也抑制了登革热,Zika病毒,和西尼罗河病毒,他说。研究人员证实这些结果在肾肝细胞通过重复实验和皮肤细胞和神经元。

未来的工作将需要钻入IFI6蛋白质的分子机制,希望这些知识为开发治疗可能会提供一个基础,目标黄病毒感染。

零星的西尼罗河病毒病例报告今年夏天在美国,他说,并补充道,“Zika病毒已经减弱,但我想人们仍然记得它很好;登革热是一个持续存在的问题在热带气候,还有目前在巴西黄热病病毒的爆发。”

在早期的研究中,Schoggins博士和其他研究人员发现了其他可能的抗黄病毒蛋白质使用non-CRISPR筛查技术,但CRISPR技术使IFI6似乎发挥更重要的作用,他说。

问题仍有待回答包括CRISPR屏幕其他细胞是否会给不同的结果。这项研究集中在肝细胞,因为它开始作为一个黄热病的调查,这是已知的攻击肝脏。Zika病毒是影响细胞在大脑中但CRISPR遗传筛查在神经元呈现后勤挑战,他解释说。

这篇文章被转载材料所提供的UT西南医学中心。注:材料可能是长度和内容的编辑。为进一步的信息,请联系引用源。

参考:
理查森,r . B。、Ohlson m B。Eitson, j·L。库马尔,。麦克道戈尔,m . B。男孩,i N。,。Schoggins, j . w . (2018)。CRISPR屏幕识别IFI6 ER-resident干扰素效应,块黄病毒复制。微生物学性质。doi: 10.1038 / s41564 - 018 - 0244 - 1