软件工具使疫苗研发更快和更准确

德克萨斯州的一个新的软件工具开发的生物医学研究所和合作者可以帮助科学家和疫苗开发人员快速编辑病原体的基因蓝图,让它们更少的有害的。

该工具,叫做代码——短密码子反优化——允许用户进行精确编辑基因代码来减少基因功能——换句话说,反优化基因。

通常,疫苗开发人员想要优化或出现的某些基因的表达,并且有许多的软件工具来帮助。但对于某些类型的疫苗,这是反优化的关键,或者拒绝,某些基因,使疫苗安全有效。

“没有工具来帮助反优化直到现在,”德州生物医学解释道Luis Martinez-Sobrido教授,博士领导团队的代码。

博士Martinez-Sobrido病毒学专家和疫苗的发展。他与生物信息学专家在印度理工学院,马德拉斯和动物研究中心的病毒学家在西班牙建立代码。他们最近在《华尔街日报》描述了他们的工具生物信息学的发展。

拒绝基因表达可用于广泛的研究,并且是特别重要的发展中减毒活疫苗。这种类型的疫苗包括完整的基因序列的病毒,而不是仅仅一小部分的病毒。但病毒减毒或调整,不会引起疾病。平台,这是一种常见的疫苗已被用于流感,天花,黄热病、流行性腮腺炎、麻疹和风疹。

这种类型的疫苗旨在引起持久的,强大的免疫力,当务之急是病毒已经足够减毒,它不能恢复到原来的形式。

“代码我们可以精确成千上万的核苷酸变异在一个单一的基因,这使得它病毒恢复非常困难,”Martinez-Sobrido博士说。“它还使我们调节基因表达的部分,而不是把整个基因完全。这非常有助于疫苗设计以及基础研究”。

用户告诉代码反优化基因序列。程序确定特定的核苷酸,或信件,遗传编码的改变导致功能,但无害的版本的病毒。

整洁的程序的功能:它可以自动转换所需的编辑减弱疫苗设计为不同的物种。例如,一个流感疫苗对猪和鸡和人类不同。

而专为病毒,代码可以很容易地改编成其他生物,如细菌。

“科学家一直在等待这样的工具,因为他们这样做,”特蕾西先生解释说,德州博士,生物医学的创新管理器。“这将帮助他们做出编辑速度,避免潜在的错误比可以通过人为错误发生。”

参考:Sharma D, T先生,诺加利斯一,Martinez-Sobrido L, Gromiha毫米。代码:密码子反优化的基于web的工具。Bioinform睡觉。3 (1):vbac102。2023;doi:10.1093 / bioadv / vbac102。

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