研究表明使用基因组监测告知疫苗设计的价值

开拓基因组监测研究提供了迄今为止最明确的图片之间的军备竞赛链球菌引起的肺炎,细菌负责一系列的疾病,例如肺炎和脑膜炎,和疫苗旨在保护最主要的类型。一个叫做GPSC10应变被发现一个特定的威胁,由于其毒性增加,结构转型能力逃避疫苗和几种常见抗生素的抵抗。

今天(8月16日)发表的这项研究柳叶刀的微生物由Wellcome桑格研究所,国家参考中心的肺炎双球菌,法国,和医院桑特琼德德吴,西班牙,作为全球肺炎球菌测序(GPS)项目。研究结果表明基因监测告知疫苗设计的价值和突出所带来的挑战“变形”像GPSC10菌株。

链球菌引起的肺炎,也被称为肺炎球菌,是一种细菌病原体引起的疾病从耳部感染到肺炎、败血症和脑膜炎。它负责在九百万年全球每年感染,老年人和儿童特别容易受到影响。每年有超过300000名儿童死于肺炎链球菌感染,主要发生在低收入和中等收入国家(LMICs) 1。

自2000年以来,一系列的肺炎球菌结合疫苗(生活)有针对性的部署肺炎链球菌血清型负责infants2大多数疾病病例,导致全球减少疾病。目前,PCV-13目标13种血清型和生活在针对多达25种血清型发展。然而,有超过100个不同的血清型,他们以不同的方式可以影响儿童和成人。知道哪一种血清型与生活在目标,以及可能的影响将在疾病和更广泛的肺炎球菌人口,是在设计有效的全球疫苗接种战略至关重要。

自2011年以来,通过GPS的工作项目的图片肺炎链球菌血清型在流通已经建立,允许细菌数量的趋势。一个血清型,24 f,一直在上升,国家参考中心记录的肺炎双球菌,法国和许多其他国家,如加拿大、丹麦、德国、以色列、意大利、日本、黎巴嫩、挪威、西班牙和英国。

在这个新的研究中,来自威康基金会桑格研究所的科学家对419个样本进行全基因组测序肺炎链球菌血清型24 f,收集来自个人在法国国家参考中心在2003年和2018年之间的肺炎双球菌(NRCP)和协会倩碧等Therapeutique小儿du Val-de-Marne(活性),和91年肺炎链球菌血清型24 f分离收集来自个人桑特琼德德吴在西班牙的医院。提供一个全球比较,一个国际的集合肺炎链球菌基因组添加了从全球肺炎球菌测序(GPS)项目数据库。

斯蒂芬妮·罗博士威康基金会桑格研究所的这项研究的第一作者,说:“在一个微生物实验室,分类和检测耐药性菌株耗费大量的时间和资源。全基因组测序可以可靠地推断出血清型和抗生素耐药性资料、确定疫情可能会出现和跟踪调节血清型菌株替换。这是一个测试可以回答很多问题。”

分析表明,24 f主要出现在许多国家,由于三个菌株的传播:GPSC10, GPSC16 GPSC206。GPSC10,一个应变是负责快速增长在24 f在法国大约四年后PCV-13的引入。它被发现有高疾病潜在的耐多种抗生素治疗。

这些发现支持最近的研究显示,GPSC10开车后增加24 f的引入PCV-13在西班牙,这24 f是肺炎球菌病的最常见原因之一,儿童在不同的国家。在印度,该国约有肺炎球菌病的最大负担,研究人员预测,GPSC10有可能逃避PCV-13。这些和其他的研究从GPS的合作伙伴在全球范围内收集到的问题微生物基因组学。

也许最大的担忧引发的研究是GPSC10表达17个不同血清型的能力,其中只有6个都包含在当前PCV疫苗。

博士Emmanuelle瓦伦而言,这项研究的资深作者肺炎双球菌的国家参考中心,中心医院完成社团之间的德,法国,说:“链球菌引起的肺炎应变GPSC10是一种变形的过程,能够表达多种血清型和多药耐药性模式。肺炎球菌病监测,如实现在法国自2001年以来,是我们最好的工具来评估疫苗政策的影响,将使我们能够检测其他非疫苗血清型的出现。”

在某种程度上,病原体和疫苗生产商之间的进化军备竞赛是不可避免的。如果一株死亡,因为它已成为一种疫苗,其他菌株可能取而代之。压力也可能发展足够的疫苗将不再有效。重要的是疫苗生产商和公共卫生组织的最佳信息保持同步,最终,挽救生命。

教授斯蒂芬•宾利Wellcome基金会桑格研究所的这项研究的资深作者,说:“这是令人兴奋的,基因监测现在允许我们有真正的影响,改善肺炎球菌疫苗,最重要的是,帮助减少儿童死于相关的疾病在低收入和中等收入国家。整个全球肺炎球菌调查财团也应该骄傲的巨大的合作进入生成这些数据。”

参考:瞧西南,Mellor K,科恩R, et al .出现耐多药和致命的肺炎链球菌沿袭介导PCV13后替代血清型:一个国际全基因组测序研究。柳叶刀的微生物。2022年。doi:10.1016 / s2666 - 5247 (22) 00158 - 6

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