小麦的基因组结构分析零人口隔离电阻与90 k颖污斑ILLUMINA公司SNP芯片
单核苷酸多态性(SNP)标记最近成为小麦遗传分析的高度相关,因为新的SNP基因分型技术像Illumina公司金门化验。SNP标记允许高通量基因分型结果和具有成本效益的,甚至在多倍体小麦基因组中。
我们使用了小麦Illumina公司金门英飞纳姆阵列90 k[1]解开89人口的遗传结构near-isogenic线(28 BC3F8和61 BC3F7)来自特定基因组区域的基因渗入来自Arina(耐)《(敏感)参与定量抵抗Stagonospora nodorum颖满地,necrotophic真菌疾病影响面包小麦上涨[2]。我们想知道的程度和规模基因组片段来自供体行尼尔斯。
从一个数据集的81.587个SNP, 14.158 SNP标记在所有样品(17.35%)失败,留下一共有67.418功能单核苷酸多态性(82.63%)。SNP芯片被确认的再现性的小% non-conclusive SNP(13日0.016%)比较复制来自父母双方的相同的DNA样本。
在功能性单核苷酸多态性,8.407(12.46%)多态Arina和《之间。这是高得惊人,如果相比的百分比和冬小麦Arina之间多态性观察中国春小麦品种春(11.000多态SNPs),两个小麦品种显然非常不同的起源。因此,SNP芯片显示大量的遗传差异,甚至精英之间的冬小麦品种源自相同的繁殖计划。
大多数Arina之间的snp多态和《(8.363 12.40%)多态也在零人口。检查中的多态单核苷酸多态性的等位基因组成的人口,66.63%的snp共享少于6.25%,大约27%的单核苷酸多态性与Arina分享> 25%的等位基因组成。我们还将提供数据,代表名额不足的基因组区域的尼尔斯可能是一些选择在人口发展的象征。此外,我们将分析基因中的特定基因渗入的规模和频率NILs确定分子的本质这样一个人口小麦。
我们使用了小麦Illumina公司金门英飞纳姆阵列90 k[1]解开89人口的遗传结构near-isogenic线(28 BC3F8和61 BC3F7)来自特定基因组区域的基因渗入来自Arina(耐)《(敏感)参与定量抵抗Stagonospora nodorum颖满地,necrotophic真菌疾病影响面包小麦上涨[2]。我们想知道的程度和规模基因组片段来自供体行尼尔斯。
从一个数据集的81.587个SNP, 14.158 SNP标记在所有样品(17.35%)失败,留下一共有67.418功能单核苷酸多态性(82.63%)。SNP芯片被确认的再现性的小% non-conclusive SNP(13日0.016%)比较复制来自父母双方的相同的DNA样本。
在功能性单核苷酸多态性,8.407(12.46%)多态Arina和《之间。这是高得惊人,如果相比的百分比和冬小麦Arina之间多态性观察中国春小麦品种春(11.000多态SNPs),两个小麦品种显然非常不同的起源。因此,SNP芯片显示大量的遗传差异,甚至精英之间的冬小麦品种源自相同的繁殖计划。
大多数Arina之间的snp多态和《(8.363 12.40%)多态也在零人口。检查中的多态单核苷酸多态性的等位基因组成的人口,66.63%的snp共享少于6.25%,大约27%的单核苷酸多态性与Arina分享> 25%的等位基因组成。我们还将提供数据,代表名额不足的基因组区域的尼尔斯可能是一些选择在人口发展的象征。此外,我们将分析基因中的特定基因渗入的规模和频率NILs确定分子的本质这样一个人口小麦。
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