ECLIPSE，用于iPSC神经退行性疾病计划(iNDI)大规模生成细胞模型的自动化CRISPR平台

美国国立卫生研究院领导的iPSC神经退行性疾病计划(iNDI)是最大的iPSC基因组工程项目，其目标是在等基因iPSC系中生成与阿尔茨海默病和相关痴呆(ADRD)相关的100多个单核苷酸变异(SNV)突变的广泛可用和标准化的病变细胞模型。细胞模型的标准化对于在治疗开发中生成可重复和可操作的数据至关重要。作为多机构合作的一部分，Synthego被选中用于候选KOLF2.1 iPSC生产线中25个snv的生成。为了实现这些目标，我们描述了我们的自动化、高通量CRISPR编辑平台ECLIPSE的使用，用于快速生成ADRD的敲入iPSC模型。我们利用最先进的敲入方法和自动化管道进行设计、实验优化，并克隆分离了iPSCs中的23个候选靶突变。对于每个SNV靶点，在6个月的时间内产生3个纯合克隆和6个杂合克隆突变系，共264个克隆细胞系。自动化系统的使用，如我们的ECLIPSE平台，是在大规模疾病计划(如iNDI)中快速开发相关细胞模型的关键催化剂。