流感病毒蛋白质如何倾斜,“呼吸”

的潜在“tripledemic”流感,SARS-CoV-2 RSV感染(呼吸道合胞体病毒)仍然是一个问题。保持最好的防御COVID-19和流感疫苗、流感疫苗主要针对两个病毒的表面蛋白。现在,研究人员在ACS中央科学报告,模拟显示蛋白质可以倾斜和波的“气息”运动,可以利用更好地抵御流感。点击这里观看视频的蛋白质。

流感感染的人偷偷溜过去他们的免疫防御系统,进入细胞,然后复制。数以百计的血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)蛋白覆盖病毒粒子,帮助粒子进入细胞并帮助新的病毒粒子离开。但研究人员了解这些蛋白质的移动有限体内——信息可以帮助科学家们开发一个通用流感疫苗和抗病毒药物更有效。所以,Rommie Amaro加利福尼亚圣地亚哥大学和他的同事们想要模拟整个甲型流感病毒粒子和看蛋白质的运动和交互潜在的弱点。

研究人员进行了详细的模拟1.61亿个原子的甲型流感H1N1病毒粒子,通常被称为猪流感,发现血凝素和神经氨酸酶是相当灵活的。这里有详细的安排:

NA蛋白质有球状头部的细茎,头可以倾斜超过90度,像weedwhacker旋转轴。从这些数据,研究人员意识到头部倾斜,底部的蛋白质就可以访问人类单克隆抗体,NDS.1。

从病毒HA蛋白突出膜,由柔性铰链连接,也可以倾斜,但不完全一样。有趣的是,一些HA蛋白似乎“呼吸”——蛋白质转移从一个封闭的顶部位置部分开放的结构和回来。在开放状态下,蛋白质是访问一个广泛的保护人类抗体,FluA-20,表明保持在那个位置可能有一种方法来开发更有效的抗流感病毒药物。

最后,仿真表明,血凝素和神经氨酸酶蛋白能够聚集附近5公顷和/或NA蛋白质,然后形成更大的聚集涉及的蛋白质。通过聚类,两种蛋白质可以争同一宿主细胞受体,可能影响病毒的进入或退出细胞,研究人员说。他们的结论是,这些最早建立的一个可视化显示许多新的脆弱的流感病毒,这可能提高未来的疫苗和抗病毒药物。

参考:Casalino L, C塞茨,Lederhofer J, et al。呼吸和倾斜:中尺度模拟照射流感糖蛋白漏洞。ACS分Sci。2022;8 (12):1646 - 1663。doi:10.1021 / acscentsci.2c00981