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基因-环境相互作用研究为饮酒与结直肠癌风险提供了新的见解


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由Fred Hutchinson癌症研究中心(华盛顿,美国)和国家人类基因组研究所(马里兰州,美国)领导的一个大型多中心,多国研究合作使用来自结肠癌家族登记处(CCFR)和结肠直肠癌遗传与流行病学联盟(GECCO)的大型数据集进行全基因组相互作用分析,以确定候选snp。然后对正常和癌组织中已识别的基因进行了基因表达研究。

结直肠癌是世界范围内男性第三大常见癌症,女性第二大常见癌症。自2007年以来,全基因组关联研究(GWAS)仅确定了一小部分导致CRC遗传的变异;Gong、Hutter等研究人员和其他研究人员正在转向分析基因与环境风险因素之间的相互作用(全基因组相互作用分析),以发现更多的结直肠癌风险变异。

与之前的研究一致,研究小组观察到轻度至中度饮酒者与CRC风险呈负相关,但与非/偶尔饮酒者相比,重度饮酒者与CRC风险呈正相关。使用传统的逻辑回归,研究小组确定了9q22.32/HIATL1位点的11个snp与轻度至中度饮酒之间的全基因组显著相互作用。最显著的SNP是rs9409565,位于HIATL1下游28kb的基因间区。其他10个全基因组显著snp均与rs9409565存在强烈的连锁不平衡,其中一些位于HIATL1内。

HIATL1的基因表达分析表明,所鉴定的snp影响HIATL1的表达,HIATL1参与CRC相关的信号通路,HIATL1在正常和肿瘤CR组织中的表达不同,HIATL1在结肠组织中的表达因饮酒而异。

需要进一步的复制和功能研究来证实这些发现,并了解这种相互作用的生物学意义,并可以进一步了解结直肠癌的病因,确定潜在的易感亚群。

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