使个性化的癌症治疗成为现实

使癌症突变检测和量化的诊断和预后价值在不同癌症类型是肿瘤学最热的地区之一。一个新技术是blood-based基因组分析测定,称为液体活检。液体活检有能力检测预测生物标记物对癌症治疗不需要组织样本。这种非侵入性分析、癌症诊断和个性化的护理可以用一个简单的抽血量身定做。但是,挑战仍然存在。

液滴数字™PCR是一种有用的技术和显示承诺为侵入性和非侵入性(液体活检)实体肿瘤的基因分析和实时监控。它已经被广泛应用于转化研究的早期检测突变产生耐药性的标准治疗。液滴的一个重要限制数字™PCR,然而,是跟踪循环肿瘤DNA通常需要个性化的化验。这些化验需要突变和野生型探针检测单核苷酸变异(SNVs),是昂贵的,尤其是当多个突变需要跟踪。

了解前沿研究克服这些限制,我们采访了Miguel狱吏研究助理,西蒙弗雷泽大学和最近的Bio-Rad滴创新者奖得主。

我们开始,你能告诉我关于你的工作追踪癌症相关的基因突变在液体活检?

莫林实验室非常关注发展的超灵敏的体细胞突变的检测和量化的技术在不同的癌症诊断和预后价值。例如,早期发现subclonal变异耐标准治疗治疗从液体活检标本对癌症患者的管理有很大的影响。无创性基因分型的实体肿瘤也可能引导患者分层和某些药物的选择,以抵消激活基因突变在关键驱动的影响肿瘤的生长和发展。跟踪循环肿瘤DNA水平还通过个性化的分析使我们能够监控肿瘤负荷和早期治疗反应,包括微小残留病的检测。循环tumor-derived基因畸变往往高度稀释的背景和野生型分子,因此,超灵敏的发展和高度特异性的支持日益增长的个性化医疗领域是必须的。

这个研究的意义是什么?

我们最近研究液滴数字™PCR (ddPCR),被广泛认为是一个“黄金标准”的稀有等位基因检测在复杂混合物的科学界,纳入关注小说的分析,进一步利用样本的巨大好处,分区。从本质上讲,我们已经表明,ddPCR™使歧视,在单一碱基对的分辨率,同时量化两个突变体和野生型等位基因的一个调查。标准ddPCR™化验通常依赖于两种水解与染料有不同的发射光谱探针共轭同时量化突变体和野生型等位基因。通过克服这个限制,现在可能在两个独立的基因筛查突变位置在一个单一的分析,降低总体成本和宝贵的临床样本的数量需要找到支持的存在(或缺乏)和相对丰富的某些突变。

此外,我们的“反向”ddPCR™化验允许多个突变的检测和量化的帮助下一个水解探针,模拟该地区的野生型等位基因的序列。这一发现不仅有重要意义对探测器的数量需要运行一个给定的试验,但也可能使小说突变的检测,否则将错过了通过探测目标最常见的突变等位基因。

什么挑战需要克服,使广泛采用ddPCR™在液体活检?

液滴数字™PCR技术有一个光明的未来在临床应用中被广泛采用。然而,只有少数预先设计分析能够筛查多个突变一个分析目前可用(包括商业)的临床和科学社区。试验设计和优化往往是昂贵和费时的。的多路复用功能ddPCR™(即我们的能力来检测多个临床信息的突变一个化验)也与其他技术相比非常有限等有针对性的杂交捕获加上上天。必须指出的DNA来自等离子体通常是相当低的,和一个可能需要使用完整的DNA样本,以保证最高的灵敏度。此外,许多病人不会显示在任何最广泛的调查癌症相关的突变热点。对于这些情况,我们需要设计个性化的探测跟踪ctDNA水平。水解探测器运行这些化验的费用是昂贵的,一个可能需要使用多个探测每个病人控制干扰肿瘤的异质性和克隆进化。我们希望我们的新组化验帮助减少这些限制在不久的将来通过减少总成本和提高的多路复用功能ddPCR™。

基于你的发现,你觉得未来滴分区技术?

在我看来,工具依赖于液滴分区技术将成为一个重要组成部分的任何临床实验室在世界各地使低成本和简单的筛选常见和罕见的基因畸变在癌症患者的诊断和预后价值。周转时间,最重要的一个因素在临床设置,明确支持ddPCR™相比与其他超灵敏的稀有等位基因检测的技术。滴数字™PCR分析针对不同类型的癌症和疾病有关的突变,如单核苷酸多态性,indels,结构变异和拷贝数改变将定期执行,加上新颖应用的出现,比如支持单细胞组学。

米格尔狱吏和杰克陆克文,资深编辑技术网络188金宝搏备用