2017年ASMS的软件介绍聚焦于工作流程和自动化分析
在ASMS年度会议上，一款功能强大、用户友好的软件旨在帮助简化工作流程，并帮助自动化数据分析，这突出了工作流程解决方案在仪器仪表和耗材之外的重要性。会议于6月4日至8日在印第安纳波利斯举行，会议包括用户详细介绍了重要进展，特别是在蛋白质分析方面，有针对性的软件解决方案正在他们的实验室中实现。
一项由安捷伦委托Frost and sullivan进行的对700名实验室经理的调查显示，一半的实验室经理将数据管理列为他们面临的五大挑战之一。“当你把这一点与近一半的实验室经理也表示他们每周处理更多样本的巨大压力结合起来时，这只意味着有更多的数据。作为一个痛点，数据管理的压力只会越来越大，”安捷伦质谱仪部门副总裁兼总经理Monty Benefiel说。在会议期间，安捷伦宣布了生物制药应用BioConfirm软件的更新，其中包括五个不同的工作流程选项。它允许用户确认他们试图分离的蛋白质的存在或不存在，而不需要MS专业知识。新的功能包括定量糖型和识别释放聚糖的能力。
布鲁克在展会上介绍了一些新的硬件，但明星是软件，以及它如何推动生命科学和转化研究，以及制药和应用市场。
SCiLS云和SCiLS实验室，与Bruker公司的rapifleX高通量MALDI-TOF/TOF系统和maldi -磁共振质谱(MRMS)超高分辨率系统一起使用，用于药物和代谢物组织成像，提供基于web的工具来简化工作流程。数据和分析结果可以通过web浏览器共享、查看和操作。SCiLS实验室为Bruker MALDI成像数据集提供用户友好的数据处理、可视化和计算分析。Bruker Daltonics执行副总裁罗汉·塔库尔(Rohan Thakur)说:“如果你要查看数千个组织样本，你需要一种软件，在你试图理解数据的时候，它会一直跟着你。”马斯特里赫特大学的多模态分子成像研究所正在使用SCiLSLab将质谱作为肿瘤、神经病学和心血管医学个性化医疗的诊断和预后工具。
MALDI成像越来越多地用于药物开发、组织分辨生物标志物研究和转化病理学研究，作为免疫组织化学的补充。Richard Drake博士，教授，南卡罗来纳医科大学蛋白质组学中心主任，讨论了他的实验室如何应用n -聚糖MALDI-MS组织成像来可视化肿瘤微环境。虽然癌症的转生与糖的降解有关，但由于糖是如此复杂，这一过程尚未得到充分研究。德雷克博士说:“你需要大型仪器和大型软件解决方案来开始这一切。”“这些聚糖与细胞表面相互作用的方式是一个复杂的场景。它们附着在不同的蛋白质上，它们附着在脂质上，它们附着在自己身上，其他东西也附着在它们身上。当癌症形成时，这一切都改变了。”他补充说，SCiLs实验室的软件在整理这些问题方面是“无价的”。
Bruker还介绍了MetaboScape 3.0，其中包括一种新的算法，以区域完整的方式自动提取样本队列中的所有相关信息。ProteoformProfiling 1.0分析完整的蛋白质，这是“被忽视了太长时间，因为它本质上是不可实现的，”布鲁克公司总裁兼首席执行官弗兰克·h·劳金博士说。他补充说，传统的自下而上的蛋白质组学分析消化蛋白质“扰乱”关键的生物学信息。
沃特斯推出了最新版本的Progenesis®QI蛋白质组学软件，使科学家能够在更短的时间内生成更准确的结果。该版本旨在保持Progenesis QI蛋白质组学兼容目前的MS方法，同时也增加了灵活性和可用性。“蛋白质组学和生物制药应用在不断变化，”沃特斯信息学副总裁史蒂夫·史密斯说。Progenesis QI用于蛋白质组学软件的最新迭代具有额外的集成、连通性和功能，以跟上这些科学家在数据集中寻找见解的新方法。”在其他新功能中，光谱库搜索选项使研究人员不必花费时间识别已经验证过的肽和蛋白质，而SONAR，最近为Waters高分辨率质谱仪(HRMS)引入的数据独立采集(DIA)模式，为DIA实验提供了额外的特异性和清晰度。
