通过加速更有效疗法的开发来改变药物发现

约翰•巴尔多尼目前是葛兰素史克公司(GlaxoSmithKline)药物研发部门的负责人。自1989年加入GSK以来，John在公司内担任过多个职位，并领导了许多重要的跨职能战略举措。他在生物制药行业拥有令人印象深刻的37年工作经验。

最近成立的加速治疗为医学带来机遇(ATOM)这个财团是由约翰构想的，其使命是“加速对患者更有效的治疗方法的开发”。原子源于癌症的月球探测器这是一项旨在改善癌症治疗的可用性、加强癌症早期检测并提高我们预防癌症能力的倡议。

劳拉·梅森(LM): 2016年6月，葛兰素史克公司、美国能源部和美国国家癌症研究所宣布，他们打算创建ATOM联盟，作为癌症登月计划之一。ATOM的任务是什么?它如何补充癌症登月计划?你们的主要目标是什么?

约翰·巴尔多尼(JB):该联盟的目标是创建一种新的药物发现范式，将从确定的药物靶点到临床候选药物的时间从目前的大约6年缩短到仅12个月。癌症是被选择来探索这种方法的典型疾病。ATOM旨在通过将癌症药物研发从耗时、连续、线性和高风险的过程转变为一种快速、综合且对患者疗效更好的方法来实现这一目标。ATOM正在创建一个开放和共享的平台，该平台集成了高性能计算、来自公共和行业来源的共享生物数据以及新兴生物技术，以极大地加速有效癌症疗法的发现。ATOM的目标与21^圣世纪治愈法案其部分目的是让更多的疗法更快地惠及更多的患者。

LM:你能告诉我们更多有关财团的情况吗吗?

简森-巴顿:ATOM的创始成员是能源部的劳伦斯利弗莫尔国家实验室美国国家癌症研究所弗雷德里克国家癌症研究实验室，葛兰素史克公司,加州大学旧金山分校．虽然这些是创始成员，但ATOM要取得成功还需要来自其他组织的代表，比如组织(国家/国际实验室、癌症研究机构、制药公司和学术界)，以及具有深度计算能力(硬件和计算专业知识)和尖端实验室和软件技术的组织。每个创始成员组织都为该联盟提供了人力和财力资源。

劳伦斯利弗莫尔国家实验室(LLNL)在高性能计算以及如何使用这些计算机解决多维复杂挑战方面具有深厚而广泛的专业知识。ATOM与国家实验室的使命保持一致，即在对政府重要的应用程序中利用高性能计算，在这种情况下，通过加速治疗方法的发现和对生物安全的贡献。

弗雷德里克国家癌症研究实验室(FNLCR)将贡献其在精确肿瘤学、计算化学和癌症生物学方面的丰富科学专业知识，以及对数据集开放共享、预测建模和模拟的支持。

加州大学旧金山分校(UCSF)是一所致力于通过先进的生物医学研究、生命科学和健康专业的研究生教育来促进全球健康的领先大学。它为联盟带来了基础、生物医学、转化和人口科学方面的全国知名项目;也是一家卓越的生物医学研究企业。ATOM集线器位于UCSF Mission Bay校园，因此提供了访问其基础科学实验室和在药物发现和开发相关的所有学科具有深厚专业知识的工作人员。

葛兰素史克(GSK)是全球领先的研究型制药和医疗保健公司之一，致力于提高人类生活质量，让人们做得更多、感觉更好、寿命更长。葛兰素史克已经向该联盟提供了大约200万种化合物及其相关的化学和生物数据。这些数据代表了一项重大举措，为分子如何与生物学相互作用提供了见解，并为此类研究提供了最大的初始私人数据来源。这些数据(以及其他公共领域中可用的数据)是ATOM实现其目标所需的算法集成的基础。ATOM正在寻求其他行业合作伙伴来进一步扩展这个重要的数据集。

LM:你目前在哪些关键领域工作?自2017年10月ATOM成立以来，你们取得了哪些进展?

简森-巴顿:自10月以来，ATOM一直专注于理解可用的私有和公共数据源的内容，管理和注释GSK数据，吸收公共资源，并汇集美国加利福尼亚州旧金山Mission Bay的人员和专业知识。ATOM已经确定了完成其使命所需的综合能力，目前正专注于预测吸收、分布、代谢、排泄和毒理学(ADMET)的能力和算法——脱靶效应，癌症生物学的潜在调节剂。ATOM还将增加额外的工作人员，以实现我们的时间表。

Atom是一个开放的联盟。许多其他私人和公共组织表示有兴趣了解更多关于ATOM的信息，以确定是否愿意加入。ATOM正在与这些组织合作，就每个组织可以为ATOM做出什么贡献和从ATOM获得什么建立灵活的相互协议。

约翰·巴尔多尼接受了科技网络科学作家劳拉·伊丽莎白·梅森的采访。188金宝搏备用