探索蛋白质组分析的第四维度

仅仅几年前,这是一个成功的壮举的蛋白质组学研究人员识别蛋白质、肽和译后修改在一个或少量的样本。快进10年,这个领域已经发生了巨大的变化。

现在,科学家想要在大范围内进行分析,与样本数据扩展超出了数百到数千。这种分析必须的高质量、高灵敏度和特异性,然而高效——尤其是考虑到个性化医疗和生物标志物检测的蛋白质组学的应用空间。

因此,质谱(MS)仪表上得以持续发展。而液相色谱-光谱法(质)仍然是”黄金标准”技术可用于蛋白质的高通量表征,科学家在这个领域不断追求的方法来获得一个深入的分析样本。¹

最近的事态发展在技术使一个第四维度的分析:女士离子流动分离。创建了“4 d蛋白质组学”这个术语来描述分析,包含四个维度。

添加第四维

在一个典型的自下而上的质实验中,肽从LC消化他们洗提列。这里,所花费的时间一个溶质通过注射后列被称为保留时间(RT)。RT是一维的分析确定。肽是第二,获得的质量和峰的光谱的强度是第三。

第四维度的分析是通过使用离子流动分离(IMS),分析化学方法可以与标准质/女士工作流耦合形成离子迁移spectrometry-mass谱(IMS-MS)。

蛋白质组学的博士,副总裁Gary Kruppa力量Daltonics Inc .)告诉我们:“困离子迁移谱法的发明(蒂姆)力量使得离子迁移率的常规使用蛋白质组学成为可能。”

多个肽co-elute nano-LC列,其独特的碰撞截面(CCS)允许蒂姆斯细胞进一步气相分离,允许更多的多肽。这气相分离的蒂姆是第四维除了保留时间,质荷,和强度,称为4 d匹配,”他补充道。

4 d匹配使研究人员能够识别低丰度的蛋白,如信号蛋白,灵敏度高。CCS值可以利用额外的识别数据依赖分析。在数据独立分析,CCS技术的价值是一个独特的签名一致的特性。

最近,我们采访了两位研究人员在蛋白质组学领域的前沿,尤尔根•考克斯教授,组长马克斯植物生物化学研究所和罗马菲舍尔博士的负责人发现蛋白质组学工具的目标发现研究所了解更多关于如何4 d蛋白质组学方法提高他们的研究。