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探索微生物之间的关系、精密医学和癌症

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近年来,“微生物”的想法已经从一个深奥的术语在科学界,主流概念受雇于广告出售“microbiome-boosting”健康饮料和补充。增加公共利益已经被一系列的美联储头条研究的突破,以及微生物扮演重要的角色在精密医学的发展。

人体中包含的数以万亿计的微生物是一种个性化的治疗方法的一个关键要素;微生物影响内分泌学、生理学、甚至神经学,并在疾病进展有着至关重要的作用。日益增长的意识微生物群的各种方式影响我们每个人单独在疾病和健康也导致增加的研究。在这一领域这是肿瘤利益增长尤其迅速。

多个出版物表明微生物群在癌症的发病和进展,以及毒性和癌症治疗的反应率。分析1200万年全文出版物,2900万抽象和52.1万拨款申请癌症和微生物群之间的语义关系如图1所示。数据显示相当数量增加的文章链接癌症微生物群数量最多的五种癌症类型的报告。

图1所示。趋势的报告链接癌症微生物群2008 - 2019。信贷:图使用爱思唯尔生成文本挖掘和斯高帕斯。

与癌症发病率总体将增加在世界范围内,目前的兴趣在精密医学微生物及其作用有可能继续,因为它的治疗提供了新的希望。证据表明寻找预测治疗反应的重要性超出了肿瘤通过专注于宿主因素,如微生物群和宿主基因组。1 重要的是,微生物群是一种可改变的因素,并可能不仅可以成为预测标志也是一个潜在的目标,以改善患者的结果。

探索通过黑色素瘤研究的联系


进一步研究微生物和癌症之间的联系,爱思唯尔进行了深入分析当前的黑色素瘤研究的景观。黑色素瘤被选中是因为案件正在上升——全球新的黑色素瘤病例的比例估计近300000年,凸显的重要性进一步调查,形成更全面的理解疾病和潜在的治疗方法。2

黑色素瘤也选择进行进一步的研究,因为有一个新兴黑色素瘤和演示的微生物之间的联系的文学需要进一步探索。最近的研究表明,免疫抑制剂检查站,一种新的药物在黑色素瘤治疗有效,与组成、多样性和功能患者肠道菌群的差异。3

微生物之间的连接和黑色素瘤首先动物模型所示,然后在人类研究中进一步证实。的发现我们的分析显示,2018年,两个被引用得最多的三大研究论文(基于爱思唯尔的斯高帕斯数据)提及黑色素瘤的标题、摘要或关键词探索微生物的影响黑色素瘤患者,与700多名引用。

也正在取得进展的临床试验观察微生物和黑色素瘤。自2018年以来,四个临床试验旨在研究和调节肠道微生物的影响反应在clinicaltrials.gov免疫治疗黑色素瘤的注册。首席科学官马克博士Hurlbert黑色素瘤研究联盟,发现评论:“在报告中指出,爆炸的知识黑色素瘤与日益增加的蛋白质的目标列表。还指出,微生物的作用在黑色素瘤和免疫治疗反应是越来越浓的兴趣。”

精密治疗方法需要进一步研究


我们的研究还发现,在小分子和目标管道有一个专注于增加有针对性的疗法对患者特定的黑色素瘤基因突变,呼应了行业精密药物发展的趋势。总共23个基因与遗传有关黑色素瘤,其中12基因有177个黑色素瘤相关的遗传变异。剩下的11个基因遗传目前没有已知的基因变异与黑素瘤相关。

进一步发展目标精确治疗,现在需要进一步的研究。首先,绘制遗传变异;其次,确定哪些是临床上重要的变体;第三,要理解变异对基因功能的影响,以及是否激活或抑制基因的变化。这是特别重要的增加对特定的理解,精密医学和提高治疗效果。

在职(零星)黑色素瘤,分析显示有752个基因遗传零星的黑色素瘤及其亚型,和449个基因的遗传变异与零星的黑色素瘤及其亚型。的449个基因变异,其中有395人来自78个基因,基因与黑素瘤相关。其余失踪54目前不遗传变异在任何已知的黑色素瘤基因的平台;这可以是一个潜在的区域进行进一步的研究。

了解是否存在特定的基因变异和/或导致黑色素瘤的严重性和人群中患病率将有助于研发(R&D)工业发展和盈利的治疗更有效。这些类型的数据将为研发社区提供一个更深入的了解和增加的达到目标的可能性。通过我们的分析,我们发现增加的药物靶向基因突变的发生率在过去的十年里,特别是针对蛋白激酶和生长因子受体。

对所有的癌症研究


分析所有癌症研究黑色素瘤研究是有益的。拥有一个更好地了解微生物的影响疾病进展和治疗效果,以及药品安全,会明显影响治疗的成功。有一个复杂的宿主免疫反应和微生物之间的相互作用,导致一个错综复杂的平衡共生和发病机理。

它是一个有吸引力的未来的研究途径识别病人的微生物的基因组,共生和致病性,能极大地影响治疗方案和结果。积极影响微生物组的患者需要进一步研究,可能会导致令人兴奋的机会对于病人和药物发现。治疗的管道,将是有益的,理解不了这些host-microbiota交互和方法积极平衡朝着改善治疗结果。

另一个有趣的未来考虑在所有癌症的药物开发微生物在treatment-induced不良事件的影响,以及临床和post-clinical不良事件是否与病人的微生物组成。它添加了一个水平的复杂性疗法的疗效,可能不容易被认为是,和潜在的可能会考虑在未来的临床试验。

数据科学在未来突破的角色


黑色素瘤研究景观的分析显示,数据科学是必不可少的装备研发行业的深度信息来帮助对抗疾病和行业问题。进行深入研究的整合、协调和跨制药公司生命周期的分析数据可以帮助确定我们在知识方面,以及未来最有潜力的研究领域。数据驱动的决策将加速科学和使研究人员能够很快地找到预防和治疗干预措施。

此外,在当前COVID-19时代,面对面的和病人互动减少,许多研究实验室仍无法满负荷运转。进行研究的能力,把样品和研究目前真正的病人是有限的,所以看详细的现有文献支持研发和数据是一个重要的途径。它将继续研发功能和帮助他们直接具有巨大潜力的努力。2021年将是全球研发预算减少的一年——这种类型的数据洞察力将赋予未来的研发是至关重要的。

引用

1。McQuade杰,丹尼尔CR, Helmink英航。&沃戈农协。调节肠道菌群改善癌症治疗反应。《柳叶刀》。肿瘤防治杂志。2019;20:e77-e91。doi:10.1016 / s1470 - 2045 (18) 30952 - 5

2。皮肤癌的统计数据。世界癌症研究基金会。https://www.wcrf.org/dietandcancer/cancer-trends/skin-cancer-statistics。8月22日,2018年出版。2021年1月29日通过。

3所示。保Matson V, Fessler J, R, et al。共生的微生物与anti-PD-1转移性黑色素瘤患者的疗效。科学。2018,359 (6371):104 - 108。doi:10.1126 / science.aao3290

汤姆写的威廉姆斯博士生命科学专业服务。

汤姆的生命科学集团经理项目管理、知识管理和研究的科学家。他有着丰富的经验作为一个学术研究人员在神经退化和阿尔茨海默氏症。他还擅长生物物理化学、痴呆疾病,和生物化学。他的作者是许多出版物领域的蛋白质膜的相互作用,蛋白质错误折叠和阿尔茨海默氏症。在爱思唯尔他为客户提供解决方案,并实现了信息。

汤姆在黑色素瘤研发讨论研究和未满足的需求,在这里,与马克•Hurlbert博士首席科学官黑色素瘤研究联盟。


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