使用蛋白生物标志物在临床试验中增加了成功的机会

这不是秘密,临床试验是最贵的一块市场带来一种新药。虽然早期临床研究可以成本的范围1 - 7百万美元,后期试验代表最大的成本比例从12美元至5300万美元。¹然而十之八九药物在临床开发从未被批准。这是一个很多钱花没有达到一个成功的结果,很多新疗法,将永远不会达到需要的病人。²

许多治疗失败在临床试验中由于缺乏有效性。尽管这可能是由于一些可怜的目标选择在药物发现过程中,变得越来越清楚,只有当别人不特定病人对治疗的反应。匹配正确的病人正确的治疗基于分子生物标志物-一种方法称为精密医学是一个潜在的强大的方法来增加成功的机会带来新疗法的临床试验和市场。^3、4

精密医学需要可靠的生物标志物

而不是把疗法视为“一刀切”,精密医学旨在把病人当作个人或分层组与不同的分子概要。识别和验证相关的生物标记物在药物开发的早期管道确保新疗法的测试可在患者的目的是,在临床试验中减少流失率和保存药物开发成本。

试验使用生物标记选择的病人更有可能进入下一个发展阶段。例如,10.7%的试验新癌症药物,使用生物标志物来分层患者获得市场认可,相比之下,只有1.6%的病人治疗没有测试(图1)。^{2 - 4}使用生物标志物在早期试验也可以告知决定后试验应该如何设计来最大化他们的成功的机会。^3、4尽管精密医学的兴趣增长,目前只有大约7%的试验患者使用生物标记。²

图1所示。临床试验成功的概率,没有肿瘤生物标志物²

寻找完美的生物标志物

虽然基因组和转录组的方法选择的方法分层生物标志物的发现,他们天生的能力有限的全貌的在一个组织或更广泛的身体。毕竟,大多数生物活性与蛋白质,蛋白质和药物通常目标不是核酸。

识别和测量的临床相关的生物样品中的蛋白质水平提供更深层次,更多的功能了解病人的疾病,帮助选择最合适的治疗和监测工作。

生物体液,如血液,尿液,唾液和脑脊液提供一个更容易和微创的样本来源蛋白质组分析而难以获得组织切片。

在过去,重现性差、深度不足使蛋白质组学在biofluids不是一个选择的方法。由于质谱分析和数据分析的最新进展,现在可以克服这些挑战,临床蛋白质组学成为一个地区的生物制药公司的强烈兴趣。

可靠的生物标志物识别从生物体液现在是可能的

的一个关键技术驱动蛋白质组学领域的一个创新的方法来测量大规模蛋白质。方法是由苏黎世联邦理工学院,Biognosys和AB Sciex早在2012年,现在已经取得了广泛的认可和验证。这项被称为data-independent收购(DIA)质谱分析,与传统的猎枪蛋白质组学的不同之处在于,每个肽在样例并行分散和分析中,在一个单一的测量。结果全面、公正、可靠和定量蛋白质组学分析,揭示健壮且可再生的生物标记物,即使是在生物体液。^5、6

深入的血浆蛋白质组

血浆是首选的液体生物标志物的发现,因为它很容易收集,包含一组蛋白质可能表明病人的体内发生了什么。除了蛋白质分子所必需的交通、体内平衡和免疫反应,它包含来自组织的蛋白质所培育的血液流动,这使得它对身体的窗口。因此,作文可以改变不断的生物过程。

从雀巢和Biognosys研究人员最近的一项研究表明,大规模的血浆蛋白质组学和生物标志物发现现在是一个可以实现的现实。使用DIA技术,团队量化565蛋白质从1508年血浆样本肥胖患者参加了一个减肥的临床研究。⁷

他们发现,271年的水平蛋白质,其中就包括19个蛋白质脂肪的身体,改变显著减肥后,呈现大量的潜在生物标志物的候选人。已知的临床生物标志物分析表明,体重减少炎症和改善患者的新陈代谢。结果与之前的研究一致减肥后血浆蛋白质组的变化,表明一个健壮的方法和高质量的生物标志物的候选人。⁷

血浆蛋白质组的关键

血浆是一个富有的和可访问的生物标记物来源临床研究和患者分层。然而,许多等离子体的低丰度蛋白质使其成为一个具有挑战性的蛋白质样本量化。下载这个应用程序报告发现PQ500克服这些挑战。

下载应用程序注意

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结婚hypothesis-free和目标量化

通过测量相对蛋白质丰度在整个蛋白质组,DIA为小说提供了一个hypothesis-free方法生物标志物的发现。现在这个公正的方法可以结合目标分析感兴趣的特定蛋白质的绝对可以得到量化。这是通过强化与参考多肽样品,通常这些稳定同位素标记肽,作为绝对的量化标准。

最全面的血浆蛋白质组学肽参考工具,PQ500™,是由Biognosys。工具包提供的绝对量化500年血浆蛋白质,其中49肽已被FDA批准的评估主要疾病和生理条件。⁸使用的设备已经大量的生物制药公司在生物标志物发现努力在等离子体以及其他生物液体。

准备下一代的临床试验

高通量蛋白质组学的最新进展现在允许强大的识别和量化分析成千上万的蛋白质在一个生物样品,使蛋白质生物标记物的常规使用临床研究的一个现实。

生物体液,如血液,尿液,唾液和脑脊液提供一个访问和微创的样本来源分析寻找合适的生物标记物。蛋白质组学提供了一个具有成本效益的方式识别和验证生物标志物在临床研究成功的机会最大化。反过来,这意味着巨大的储蓄在时间和金钱方面,和一个更大的机会带来新疗法的病人需要他们。

引用:

1. Sertkaya,。黄,h。杰塞普,,。& Beleche t(2016)药品临床试验的关键成本动因在美国。临床试验,13 (2),117 - 126
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2. Wong h、Siah K.W.、&罗托(2019)临床试验成功率估计和相关参数。生物统计学,20 (2),273 - 286
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3. 做饭,D。、棕色、D.G.亚历山大,R。et al .,(2014)教训阿斯利康的毒品管道的命运:一个五维框架。Nat。启药物越是加大,13日,419 - 431doi: 10.1038 / nrd4309
4. 摩根,P。、棕色、D.G.林纳德,S。et al .,(2018)五维框架对研发生产力的影响在阿斯利康。Nat。启药物越是加大,17岁,167 - 181
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5. 一个德国人。et al。(2019)蛋白在Non-depleted血清生物标志物发现光谱图书馆Data-Independent收购质谱。:布朗,V。滑道值,y (eds)蛋白质组学的生物标志物的发现。分子生物学方法》,1959卷。胡玛纳出版社,纽约
   doi: 10.1007 / 978 - 1 - 4939 - 9164 - 8 - _9
6. Biognosys——新一代可再生的和精确的蛋白质定量蛋白质组学技术。
   www.biognosys.com/technology
7. Bruderer, R。Muntel, J。穆勒,S。et al .,(2019)分析1508血浆样品的毛细管渗流Data-Independent收购概要蛋白质组学的减肥和维护。摩尔细胞蛋白质组学。18 (6),1242 - 1254
   doi.org/10.1074/mcp.RA118.001288
8. PQ500™参考多肽
   www.biognosys.com/shop/pq500-reference-peptides