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确定的基因变化,开关”“癌症基因

正常的染色体(蓝色)显示与染色体(绿色和红色)已经改变了使用CRISPR-Cas9基因组工程和融合在一起。
当基因突变引起染色体分裂和以不同的方式融合在一起,正常细胞癌变。在这幅图像中,正常的染色体(蓝色)显示与染色体(绿色和红色)已经改变了使用CRISPR-Cas9基因组工程和融合在一起。信贷:索尔克研究所

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癌症引起的异常增生的细胞,是世界上第二大死亡原因。索尔克研究所的研究人员已将目光锁定在特定的机制,激活癌基因,基因的改变会导致正常细胞变成癌细胞。


癌症是由基因突变引起的,然而结构变异等特定类型的影响,打破和加入DNA,可以相差很大。研究结果,发表在自然2022年12月7日,表明这些突变的活动之间的距离取决于一个特定基因和调节基因的序列,以及监管的水平的活动序列。


这项工作进展的预测和解释能力发现癌症基因组的基因突变导致疾病。


“如果我们能更好地理解为什么一个人有癌症,以及特定的基因突变是什么驾驶它,我们可以更好地评估风险和追求新疗法,”索尔克physician-scientist说杰西·迪克森助理教授,论文的资深作者和基因表达的实验室。


大多数基因突变没有影响癌症的分子事件导致致癌基因的激活比较少见。Dixon的实验室研究基因组是如何组织的三维空间,试图理解为什么这些变化发生在一些,但不是多数,环境。团队也想确定可能的因素区分当这些事件发生的地方。


“一个基因是像一盏灯,调节它就像电灯开关,”迪克森说。“我们看到,因为癌症基因组结构变异的有很多的开关,可以把”的一个特定的基因。”


使用CRISPR-Cas9基因编辑、研究团队介绍了基因突变通过削减的基因组DNA在特定的位置。他们发现的一些变体他们创造了重大影响邻近基因的表达,最终可能导致癌症,但大多数基本上没有影响。一些基因似乎发疯当他们进入小说的环境监管序列,和其他人不受影响。序列的类型,介绍了似乎有一个巨大的影响是否细胞变成癌细胞。


“我们的下一步行动是测试基因组中是否有其他因素导致致癌基因的激活,”徐说志超,博士后研究员沙克和论文的co-first作者。“我们也兴奋一个新的CRISPR基因组编辑技术我们正在开发这种类型的基因组工程工作更有效。”


参考:徐Z,李DS, Chandran年代,et al。结构性变异驱动上下文相关的癌基因激活癌症。自然。2022:1-9。doi:10.1038 / s41586 - 022 - 05504 - 4


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