综合分析小分子核糖核酸展示他们普遍对在高档浆液性卵巢癌癌基因表达的影响
文摘
小分子核糖核酸(microrna或大鹏)~ 22元非编码rna为转化目标互补基因转录镇压或mRNA乳沟。已经涉及人类癌症的发生和发展,microrna调节过程,如细胞生长、分化和凋亡。多产的microrna:信使rna相互作用可以发生在连续6个核苷酸,通过5′之间的配对microrna的种子(位于核苷酸2 - 7日)和序列主要是局部的3′未翻译区(utr)的mRNA目标;因此,给定的microrna的数百个基因可能影响内部和跨不同信号通路。
microrna与基因拷贝数变化和基因启动子区域的甲基化,在全球范围内影响基因的表达,最终决定细胞行为。癌症基因组图谱(TCGA)项目是一个大规模的合作旨在全面目录各种癌症的分子畸变。而最近TCGA的初始报告489高档浆液性卵巢腺癌有相应的microrna的数据(487)提出了一个广泛的分子的疾病,很多的microrna还有待阐明。这里,我们全面调查中的microrna TCGA卵巢数据集,利用各种分子配置文件数据类型,microrna特别是mRNA,都为同一组生成肿瘤。以前的microrna的表达分析研究卵巢癌的定义差异表达microrna在癌症相对于相应的正常控制虽然在现在的研究中,如此大的数据集(n = 487名患者)让我们更充分地探索microrna的多样性在单个卵巢癌亚型。
在这里,我们提出一个microrna在卵巢癌的研究结果,从不同的集成分析。这些分析围绕着基本的问题是否microrna的行为的一般规则,根据我们目前的理解,可以支持通过确凿的模式在人类癌症。我们的研究有助于增强我们目前基本microrna的生物学的概念,说明当前在硅片miRNA-gene定位预测可以通过综合分析、提炼和演示,TCGA的丰富资源识别microrna的候选功能针对癌症。我们的研究也提供了分子生物学家二级数据挖掘结果更深入探索特定miRNA-associated通路在卵巢癌。
这篇文章发表在PLoS ONE和免费的网络访问。
