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新的生物标记物可能为癌症研究提供重要的线索


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一个独特的战略研究计划在瑞典,叫做BioCARE癌症医学(生物标记物),目前正在瑞典隆德和哥德堡大学的,正在深入研究在癌症研究中生物标志物的角色。

生物标志物是任何特征,可以客观地测量和评价的指标正常的生物过程,致病过程,或药物治疗干预的反应。

虽然生物标志物是相对较新的,这些特征已经用于临床前研究和临床诊断相当一段时间。

例如,现在血压通常用于确定中风的危险。

也广为人知,胆固醇值可以作为生物标志物(和风险指标)对冠状动脉和血管疾病,c反应蛋白(CRP)是一种炎症标记物和前列腺癌的前列腺特异性抗原(PSA)。

当分子方面的研究,这些生物标记描述”的子集标记可能会发现使用基因组学,蛋白质组学技术和成像技术”。

这样看待,生物标志物可以药用生物的主要作用,有助于早期诊断,疾病预防,药物目标识别,药物反应和更多。

因此,基于基因生物标记被广泛认为是研究人类疾病的一种有效方法。

使用生物标志物在药用生物

几十年来,生物医学科学家们一直在寻找新的方法来诊断癌症在早期,可治愈的舞台,也为个别病人选择最佳疗法。

目前,癌症治疗是有效的只有一些接受治疗的患者,和许多癌症患者仍在确诊太晚了,一旦癌症已经太先进。

尽管存在这些挑战,研究人员目前正在探索如何独特的生物标志物可以帮助改善癌症患者提高检测结果和治疗方法。

当发现在早期阶段,生物标志物可以提供诊断疾病的一个重要工具类型和阶段,预测的结果不同的治疗方法,以及监测制药的发展。

因此,BioCARE项目集中在不同肿瘤为了追求生物标记物的鉴定和验证诊断和治疗靶点,并促进癌症的识别亚种群在肿瘤根据临床表现和治疗反应。BioCARE拥有强大的关注将新知识纳入医疗保健行业。

为此,BioCARE使用尖端的组学平台,广泛的生物银行,和高级癌症研究人员之间的密切合作来识别和分析新的生物标志物与癌症有关,随着复杂网络,这些生物标记物居住。结果,BioCARE计划希望在路上产生重大影响癌症诊断,治疗和管理在未来的五到十年。

基因签名的作用

使用一个非常简单的类比,基因签名可以用来识别癌细胞的国旗可以识别一个特定的国家。尽管每个国旗是由几个不同的颜色和形状,当这些东西放在一起,以某种方式排列,形成一种独特的模式——或签名——有助于区分不同的国旗。

当研究基因数据,人员本质上是寻找这样的可识别的模式。然而,他们面临的挑战,试图从巨大的数组中提取这些“形状”的基因,蛋白质或RNA分子。

的分析是一个令人难以置信的,几乎不可能想象的数据量。如果是打印出来,这些发现将运行数千页。

因此,它已成为越来越难以确定哪些基因相关,和到什么程度,特别是在处理成千上万的数据点生成的数百种不同的病人。

让事情更有挑战性,研究小组工作在这个领域通常由一个训练有素的专家的集合,每个人都有一个独特的技能。

结果,每个人的研究团队——不论是病理学家、分子生物学家和/或生物——通常是如此专业,没有一个人完全理解他或她的同事正在做什么。

软件支持简单分析

尽管存在这些挑战,它对科学家来说是非常重要的工作在这个领域来获取、探索,并分析这些海量数据有效,因为这些信息是至关重要的,如果他们将他们的研究成果应用到现实世界的情况。

幸运的是,在这一领域最新的软件现在是帮助加速和促进理解的背景和关系信息包含在大型数据集,以图形方式显示它们。

现在这种交互的简单性使研究人员与强大,以全新的方式统计分析。不仅如此,更快的分析意味着科学家往往有更多的时间来测试更有创造性理论,进而导致更好的研究成果。

当分析本研究数据,科学家往往依赖于主成分分析(PCA)方法,可用于项目高维数据降至较低的维度。

通过使用主成分分析,专业软件可以用于情节产生的低维数据通过PCA在二维电脑屏幕,以便全彩3 d图像旋转和更容易用肉眼检查。

应用程序可以用来操纵不同PCA-plots -实时交互和完成所有的注释和其他集成链接,以及许多强大的统计功能,如错误发现率(罗斯福)和假定值。

数据可视化有助于揭示新生物标志物吗?

在癌症研究中使用时,在3 d可视化数据的能力代表了一个非常强大的工具,科学家们寻找新的生物标志物,因为人类的大脑是非常擅长发现的结构和模式。

因此,这种信息可视化提供了一种方法将原始数据转换成易于理解的图形格式,因此,科学家们可以根据信息作出决定,他们可以更容易理解。

可以创建的3 d图形在这个领域最新的软件都是惊人的和非常有用的。研究人员收集测量分从成千上万的生物变量,例如,这种级别的数据可视化可以在几秒钟内产生的结果,即使研究者并不是一个训练有素的统计学家。

同样,如果数据批处理效果,或者是搭配不必要的依赖性,这些变量可以删除几个鼠标点击,这样可以实时传递和分析结果。因此现在可以调查大型临床试验的输出非常快,因此测试不同的假设和探索在几秒内的替代方案。

结果,科学家们寻找新的生物标记现在可以大大缩短分析时间试图找出相关结构的数据。

未来

这是一个已知的事实,癌症的发病率随着年龄的增加,这意味着癌症的临床管理仍将是一个重大挑战的科学和医学社区。bet188真人因此它将识别的关键管理和治疗癌症的新策略,并研究生物标志物的重要作用。

在过去的三年里,主要的努力已发展成熟的软件,不仅是极其强大的,但它也可以帮助科学家们探索和分析高维数据集交互和实时。通过这种方法,研究人员已经能够分析和探索超大数据集——即便是那些拥有超过1亿个数据样本在常规电脑。

更重要的是,最新,最直观的软件在这个领域将使实际的研究人员参与——大多数生物的见解的人研究数据和寻找模式和结构,而不必是一个统计数据或计算机专家。

因此,这种软件将帮助提供前所未有的洞察力BioCARE等癌症研究项目,并将因此发挥宝贵的作用在生物标志物的研究。

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