开发出一种新的低成本癌症检测方法
新加坡国立大学(NUS)的科学家们发现了一种新的低成本癌症检测方法。这项新测试被称为Heatrich-BS检测,它对经过加热的临床样本进行测序,以分离出在患者血液中发现的癌症特异性特征。
这种新方法为组织活检提供了一种有前途的非侵入性替代方法。它从头到尾的成本约为50新元,而其他测序方法的成本最高可达1000新元。研究小组由周立峰助理教授领导,成员包括来自香港大学的研究人员新加坡国立大学生物医学工程系下设计与工程学院以及新加坡国立大学健康创新与技术研究所目前,该公司正在探索行业合作伙伴关系,将他们的技术推向市场。
“当你有一个50新元的测试时,它打开了很多途径,因为它是负担得起的,所以你可以定期进行测试,”助理教授Cheow说,指出他们的检测方法有可能用于常规癌症监测。
癌症的液体活检
目前的癌症检测方法要么缺乏敏感性,要么过于昂贵,无法用于常规筛查。我们血液中的DNA是一种遗传信息,它告诉我们的细胞如何合成蛋白质和其他重要的生物构件,它是由我们身体的不同器官产生的。癌细胞还会将DNA释放到血液中,通过分析血液样本,即液体活检,可以检测到DNA。然而,筛选样本中的所有遗传物质——一种被称为全基因组测序的方法——可能是昂贵的和劳动密集型的。
一些临床医生将目标锁定在无细胞DNA中的癌症特异性特征上,这几乎就像在一大群人中寻找特定的面孔,而不是检查每一个个体。然而,周助理教授解释说,即使这样的方法也可能不完美。他说:“一些患者的癌症特征可能看起来略有不同,从而使他们能够通过筛查过程。”
一种更灵敏的测试,而且价格很低
助理教授Cheow的团队发现了一种方法,可以丢弃患者DNA中无信息的部分,以锁定大多数癌症特异性生物标志物集中的位置。
我们的DNA由核苷酸分子组成:腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)。癌症特异性特征往往集中在基因组中C和G核苷酸高重复的区域,被称为CpG岛,它们只占我们基因组的1%左右。
“我们正在进行一些不相关的实验,我们的一名研究人员加热了一个样本,”助理教授Cheow说,他讲述了该团队意外发现的情况,即高温破坏了基因组中没有信息的部分,但CpG岛基本完好无损。这使得他们能够对剩余的基因组进行测序,并以市场平均价格的一小部分检测出癌症的存在。
他说:“与简单的蛋白质生物标记物测试相比,我们正在以几乎相同的成本获得一种更加敏感的检测方法。我们的方法实际上专注于对这些最重要的区域进行测序。”
使病人、医生和科学家受益
Heatrich-BS检测已经在新加坡国家癌症中心进行了试验,用于监测结直肠癌患者。通过将他们的血液分析结果与病人肿瘤大小的CT扫描结果进行比较,研究小组发现,随着时间的推移,在病人血液样本中检测到的癌症特异性DNA的数量与他们的肿瘤大小之间存在高度相关性。
邹助理教授说:“这样,医生可以监测病人对治疗的反应,并调整他们的治疗方案。”他还指出,他们的方法有可能适用于所有类型的癌症,因为他们都证明了用癌症特异性生物标志物富集CpG岛的特性。“这是一刀切,”他补充说。
这种检测方法还可能有助于加速未来的学术研究,帮助科学家以低成本研究不同类型的癌症,从而促进未来癌症诊断和治疗的发展。
助理教授Cheow和他的团队现在正在探索如何通过与制药和生物技术公司合作将他们的检测方法商业化,这些公司可以帮助将Heatrich-BS检测方法推向市场。他说:“我们对我们的结果感到兴奋,许可证的讨论正在进行中。”
参考:王文敏,王文敏,等。热选择可在无细胞DNA中实现高度可扩展的甲基组分析,用于癌症患者的无创监测。Sci副词.2022; 8 (36): eabn4030。doi:10.1126 / sciadv.abn4030
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