文章描述了预测结肠癌生存率的基因特征比

生物技术支持小组(BSG)和荷兰莱顿大学医学中心(LUMC)宣布在《癌症》杂志上发表一篇期刊文章。这是基于他们的共同目标，将BSG正在申请专利的血源性生物标志物基质液活检™板与LUMC开发的组织源性肿瘤基质比率(TSR)评分方法相关联。引文如下:

Ravensbergen, Cor J.，等。“基质液活检组包含基质-上皮基因标记比，与组织学肿瘤-基质比相关，并预测结肠癌的生存。”巨蟹座14.1(2022):163。

液体活检已经成为一种新的肿瘤表征方法，在样本可及性和组织异质性方面具有优势。然而，由于突变分析占主导地位，在液体活检研究中，肿瘤微环境在很大程度上仍未得到承认。基质液体活检™(SLB)蛋白质组学小组包括一组来自相互连接的基质途径(即凝固、补体、急性期炎症)的13种蛋白质，据信可以捕获指示癌症中紊乱全身反应的血浆蛋白质组学蓝图。因此，它包含了液体活检中肿瘤微环境(TME)室的重要性。在类似的情况下，组织学肿瘤-基质比(TSR)，一种由LUMC开发的基质衍生生物标志物，已被验证为各种原发肿瘤类型患者生存的独立预测因子。目前的工作通过整合来自公开存储库的单细胞和大量转录组学数据，提供了结肠癌中SLB蛋白质组学面板的探索性基因转录组学特征。

基质-上皮基因标记比，基于来自SLB组的基因，并根据其表达分为来源于基质-表型细胞或上皮-表型细胞。通过这种方式，与基质含量低的肿瘤相比，组织学上的基质含量高伴随基质相关途径的基因表达增加。本研究中描述的基因特征比被发现与先前的TSR研究有关，并显示出非常相似的预后表现。这些发现为临床实践中肿瘤间质的预后能力提供了进一步的分子证据。

除患者预后外，与低比值风险评分相比，高基因标记比值风险评分与微卫星不稳定性(MSI)比例增加相关。考虑到高比率风险评分组中MSI比例的增加，该特征比值可能是结肠癌免疫检查点抑制剂(ICI)治疗反应的预测指标，并应成为ICI治疗患者队列未来研究的主题。

目前的报告为蛋白质组学特征提供了第一个理论框架，当应用于液体活检时，蛋白质组学特征有可能作为肿瘤间质含量的指标。最终，SLB小组捕获的基质调节蛋白蓝图可能提供更精细的肿瘤分层和患者预后，并为可能有利于调节肿瘤微环境的治疗策略提供新的见解。

“这是一篇非常令人兴奋的文章，因为LUMC一直处于癌症微环境成分研究的前沿。虽然大多数癌症研究都集中在基因组突变上，但即使引入了免疫疗法，我们对个人主义对不受控制的细胞增殖的热情仍然知之甚少。因此，BSG着手回答，对于大多数(如果不是所有)癌症，无论原发肿瘤、分期或转移性疾病，血清中基质调节是否可测量。这一发现研究导致了我们正在申请专利的基质液体活检™蛋白质组生物标记物面板。现在，来自这个小组的基因在这篇非常引人注目的杂志文章中被研究了。这验证了液体活检和蛋白质组学表征癌症基质调节的有用性和潜在的临床应用价值，作为对患者进行最佳治疗方案分层的进一步方法。生物技术支持集团总裁兼创始人Swapan Roy博士说。

该研究的主要作者wilma Mesker博士(副教授)和来自莱顿大学医学中心的Cor Ravensbergen博士(高级医科学生)对此表示赞同，并进一步指出:“肿瘤间质微环境是上皮性癌症类型患者的重要预后参数。然而，组织染色只提供定性信息，并不能提供任何影响生存的特定细胞或蛋白质机制的见解。我们确实知道，原发肿瘤中有大量间质细胞的患者预后较差，对当前化疗、放疗和/或免疫治疗方案的反应更差。现在，在BSG基质液活检™面板的帮助下，我们的工作假设显示了基质条件作用如何影响生存的真实证据。我们将很快开始对患者血清的基质液活检™蛋白质面板进行LC-MS分析。从这一分析中，我们可以设想未来的治疗策略，可以潜在地调节肿瘤微环境，因为肿瘤间质比被发现与新辅助治疗的病理反应相关。这支持了肿瘤微环境影响治疗反应的观点。因此，我们可以开始思考如何调节基质条件作用来改善免疫肿瘤治疗，例如将“冷”肿瘤变成“热”肿瘤。因此，正如基于血液的基质液活检™小组所报告的那样，我们对将组织学肿瘤-基质比率与系统反应的生物标志物连接起来的前景感到非常兴奋。”