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基因组学是如何塑造先进的疗法吗

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基因组学的兴起和先进的疗法

基因组学技术的崛起,在过去的二十年里使得整个人类基因的高通量审讯补。1为大约1500美元,现在可以确定染色体的序列,这就需要挖掘数据基因突变导致疾病和药物反应的影响。我们现在也可以询问整个人类外显子组,它揭示了哪些基因被积极转化为蛋白质产品在特定时间或特定条件下(如健康和患病的状态)。


基因组学技术是什么?

基因组学技术包括新一代测序(门店)DNA微阵列,基因编辑技术。上天不仅可以用于全外显子组和全基因组测序还测序和目标表观基因组学。DNA微阵列通常用于检测特定的基因变异,而基因编辑技术使科学家们能够修改一个有机体的基因组。几个基因编辑技术已经开发出来,CRISPR-Cas9是最著名的。2、3目前,目标总会在面板和单基因测试是最经常用于临床实践。1


这些技术也促进了人类疗法的出现一个全新的领域。这些“先进药品治疗”(ATMPs)为疾病的治疗提供重要的承诺和伤害,目前没有治愈。ATMPs包含三种类型的疗法:基于基因、细胞和组织工程药物。基因疗法包括合成基因片段进行治疗。细胞疗法包括细胞或组织被修改,然后引入身体治疗特定疾病。组织工程药物也含有细胞或组织,但这些被修改,使修复,再生或更换的组织。


在本文中,我们将看看不同ATMPs获得市场准入,和分享见解阿纳斯塔西娅博士明智乌木马登博士国家人类基因组研究所(NHGRI)的美国国立卫生研究院、美国——相同的组织领导人类基因组计划

第一个ATMPs

ATMPs第一个标记再生医学专门为联合修复。41997年,Carticel®Genzyme成为第一个食品及药物管理局批准ATMP,大约十年之前这个词成为标准化。Carticel®是一个细胞疗法用于膝盖关节软骨再生。它由软骨细胞称为软骨细胞培养从病人的组织样本,然后植入回病人。2009年,一个类似的产品ChondroCelect由TiGenix®是第一个ATMP被欧洲药品局(批准教育津贴在欧盟)。的第一个迹象基因组学信息将如何驱动ATMPs, ChondroCelect®使用基因表达分析的文化植入前增加成功的可能性。5

然而,在2016年,TiGenix撤回ChondroCelect®。这可能是由于竞争第三代®,组织工程版Carticel®批准了在2013年和2016年的EMA和FDA,分别。》®由软骨细胞培养的生物膜,然后植入。这一创新需要更少的复杂手术植入,使》®第一组织工程ATMP fda批准。然而,》®已经被标记为悬浮在欧洲市场关闭后欧盟生产基地。6

在肿瘤的影响genomics-guided ATMPs

除了不断的列表致癌基因,仍有许多罕见的遗传变异未知的意义。7与癌症筛查等变化和关联这些风险,预后和响应能力,批准或候选药物治疗与NGS-based技术仅仅是可行的。

“我相信整合基因组或外显子组测序在临床护理中最令人兴奋的发展genomics-guided疗法,因为变异往往发现,并不在当前基因组面板可能危及患者疾病或有助于了解最好的方法来治疗病人,”马登博士说。

此外,这样的检查可以发现预测生物标记的药物不良反应,这可能会降低药物毒性的负担。1这些信息正越来越多地用于分层患者在临床试验中提高临床疗效的几率,降低毒性,并最终得到监管部门的批准。7基因组学提供的这些好处,当然,也适用于非癌ATMPs。

事实上,基因组学技术关键在发现新的癌症治疗的机会;最大的比例ATMP应用程序和审批日期已经癌症疗法。8“精密肿瘤学”,它提供的概念是正确的药物在正确的时间正确的病人,是ATMP中固有的方法。9基因疗法ATMPs尤其适用于治疗癌症的早期阶段,当有更少的遗传变异的癌细胞,而对肿瘤细胞免疫治疗ATMPs最有效,往往更不稳定的基因组。

面临的挑战成功的当前和未来的ATMPs

尽管ATMPs的重大承诺,这个领域面临着许多困难。几个ATMPs从市场撤回批准后不久,尽管经过多年的努力和牺牲。事实上,仅在欧盟的~ 500 ATMPs进入临床试验在2009年至2017年之间,只有十收到营销授权,那些,只有6个仍在市场上。10这些花了20多年来培养。

ATMPs忍受报销挑战,严格的监管要求,和高成本的开发、制造、授权维修。11、12许多开发ATMPs罕见的或非常罕见疾病意味着需求低,单位成本高。此外,ATMP临床试验通常包括小样本大小和单组试验设计,导致支付的不确定性增加。8马登博士的评论:“我相信在这个领域发展的最大的挑战是学习需要什么样的证据级别影响临床指南。科学文献充满了基因组医学研究成功的结果,但供应商,机构,纳税人也经常需要证据的成本效益和通常不希望推迟从当前临床指南”。

此外,许多ATMPs需要样本病人之前生产(这意味着公司必须经常处理生物变异),生产高水平的专业知识,和一些需要高水平的手术技巧,以确保他们的成功。这些挑战都增加成本和商业风险增加。对于罕见疾病尤其是,阿纳斯塔西娅明智博士说,“最大的挑战之一genomic-guided n-of-1条件疗法是一个可伸缩的发展过程,允许其他开发工作的经验教训应用到新条件。”

例如,媒体大肆报导基因疗法,Glybera®,它打破了定价记录每个病人治疗花费€110万,于2012年批准的EMA家族性脂蛋白脂酶缺乏。然而,在2017年,uniQure决定不更新营销授权,因为制造和授权维修成本高与低病人需求(1 - 2患者每百万)。13、14Glybera之前只规定一个个体被撤回。

ATMPs前方激动人心的时刻

若干举措,然而,最近提出了提高ATMPs批准的数量和商业成功。2018年10月,欧盟委员会和EMA培养未来ATMPs宣布共同行动计划。15EMA也鼓励ATMPs通过其优先发展的药物(主要)计划。

在英国,细胞和基因治疗弹射最近建立鼓励创新在细胞和基因治疗。16他们的资源包括1200平方米的实验室空间和超过£5100万的资金。英国政府也发起一个网络的形成先进的疗法治疗中心,以确保病人得到的好处ATMP创新通过国家卫生服务。17


在美国,FDA已经实现,其中,突破性的治疗指定,再生医学先进的治疗程序中,交互项目,新的指导在2018年7月发行专门为基因疗法。

许多ATMPs将达到市场很可能在不久的将来。尽管经常是有限的临床证据的内在ATMP发展,潜在高收益ATMPs提供将越来越多地强迫纳税人提供,和病人将继续施压,政客和政策制定者。8长期随访,投放市场研究,和托管协议可能都需要确保成功。如果不采取先发制人的行动,健康保险的可持续性可能进入平衡。毫无疑问,然而,基因组学技术将发挥着越来越重要的作用在发展中ATMPs和确保他们未来的成功。

引用:

1)锣,J。锅,K。Fakih, M。朋友,。、Salgia r .价值取向的基因组。Oncotarget。2018;9 (21):15792 - 15815。doi: 10.18632 / oncotarget.24353。

2)Fellmann C。高恩,人,林,Doudna,正当、玉米、J.E. CRISPR-Cas在药物发现和治疗的基石。自然评论。药物发现。2016年,16 (2):89 - 100。doi: 10.1038 / nrd.2016.238。

3)Baliou, S。Adamaki, M。Kyriakopoulos,。,等。CRISPR复杂的遗传疾病和癌症治疗工具(审查)。国际肿瘤学杂志。2018;53 (2):443 - 468。doi: 10.3892 / ijo.2018.4434。

4)毛,响亮的穆尼D.J.再生医学:当前的治疗方法和未来的发展方向。美国国家科学院院刊》上的美利坚合众国。2015;112 (47):14452 - 14459。doi: 10.1073 / pnas.1508520112。

5)Negoro, T。Takagaki, Y。菩提树,大仓酒店共同运营,H。、松山、a .趋势在关节软骨修复的细胞疗法的临床试验。NPJ再生医学。2018;3:17。doi: 10.1038 / s41536 - 018 - 0055 - 2。

6)关闭欧盟制造网站》。欧洲药品局,2014年11月19日。(https://www.ema.europa.eu/documents/referral/maci-article-20-procedure-closure-eu-manufacturing-site-maci_en.pdf)

7)伯,H.A.沙尔茨,第2Yu, P.P.评估价值的下一代测序在动态环境中测试。美国临床肿瘤学会教育书。2018;38:139 - 146。doi: 10.1200 / EDBK_200825。

8)汉娜,E。Remuzat C。Auquier, P。Toumi m .先进的治疗药品:当前和未来的展望。市场准入和卫生政策杂志》上。2016;4:10.3402 / jmahp.v4.31036。doi: 10.3402 / jmahp.v4.31036。

9)印度,V。Kurzrock, r .挑战精密肿瘤学时代的标准治疗模式。癌症的趋势。2018;4 (2):101 - 109。doi: 10.1016 / j.trecan.2017.12.004。

10)先进的治疗药品(ATMPs)和ATMP监管。欧洲药品局,2018年3月8日。(https://www.ema.europa.eu/documents/presentation/presentation-module-4-advanced-therapy-medicinal-products-atmps_en.pdf)

11)十个火腿,读取磁带Hoekman, J。连片,点Broekmans,托、Leufkens H.G.M.、Lungel平炉挑战高级治疗药用产品开发:公司在欧洲的一项调查。分子疗法。方法和临床开发。2018;11:121 - 130。doi: 10.1016 / j.omtm.2018.10.003。

12)Abou-El-Enein, M。Elsanhoury,。,Reinke, p .克服面临的挑战先进的疗法在欧盟市场。细胞干细胞。2016;19 (3):293 - 297。doi: 10.1016 / j.stem.2016.08.012。

13)uniQure宣布将不再谋求营销授权更新Glybera在欧洲。uniQure。2017年4月20日。(http://uniqure.com/GL_PR_Glybera%20withdrawal_FINAL_PDF.pdf)

14)脂蛋白脂酶缺乏(LPLD)。国家组织罕见疾病。(https://rarediseases.org/physician-guide/lipoprotein-lipase-deficiency-lpld/)

15)在欧洲先进的治疗的潜在药用产品。2018年8月健康欧罗巴。2。(https://www.healtheuropa.eu/potential-advanced-therapy-medicinal-products-europe/87548/)

16)汤普森,k细胞和基因疗法将彻底改变卫生保健系统。英国创新。2017年9月19日。(https://innovateuk.blog.gov.uk/2017/09/19/cell-and-gene-therapies-set-to-revolutionise-the-healthcare-system/)

17)麦凯,i t细胞癌症时光?英国创新。2018年9月3日。(https://innovateuk.blog.gov.uk/2018/09/03/t-cells-calling-t-ime-on-cancer/)


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娜塔莎Beeton-Kempen博士
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