再也不会踏进实验室:执行研究在云实验室
新云的模拟实验室设施卡内基梅隆大学。信贷:翡翠云实验室
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想象永远不必跋涉通过实验室的日常工作。与其花一天移液样本,修复破碎的工具,或者寻找缺失的数据在你的文件中,想象奉献你所有的时间来设计实验,解释结果,并推动你的研究。
几个世纪以来,科学家不得不扮演研究者的角色,实验室管理人员和技术人员。建设的时间和成本,操作,和维护实验室放慢他们的工作和他们充分探索研究问题的能力有限。云实验室绕过这些限制,让科学家们按照他们的想法没有经历的日常麻烦跑步,长袜,管理和维护一个实验室。
今天,装备的云实验室提供全面的功能,使研究人员能够执行任何基础实验,通过软件接口从分子生物学,生物化学,他们可以从任何地方访问。研究者只是船远程实验室样品,在线提交实验协议,并接受他们的结果在一个干净的和可用的格式。真正的云计算实验室可以完全取代物理实验室。他们提供无数的好处,从节约成本降低资本负担,增加吞吐量,和无与伦比的访问设备,为科学家在大学,制药公司和合同研究组织(CRO)世界各地。
推进学术研究
今天许多企业在云上运行,而现在,技术学术机构可以做同样的研究实验室。研究迁移到云的学术研究者提供了许多优点,从节约成本使他们培养新一代的更全面更好未来的科学家。
首先,云计算实验室为研究人员提供了有限的资助或实验室空间访问所需的仪器、设备推进他们的研究领域。加,其主要调查人员远程执行他们的研究,一所大学可以节省建设,维护和能源成本与物理实验室空间有关。此外,随着世界继续对抗COVID-19大流行,云实验室使学生、老师和行政人员不断学习和执行实验无缝地从家里。
或许更重要的是,访问云计算实验室学术机构可以提高他们的研究项目。卡内基梅隆大学建设 校园云计算实验室 现在科学研究减少障碍,使他们的学生和教员迅速把他们的想法带入实验室,遵循科学需要他们的地方。灵活性和访问,云实验室提供一个有吸引力的选择大学的方法寻求进一步提高资金和建立一个更有效的和有效的学习环境为学生。学生不仅可以从世界上任何地方访问实验室,但网上运行实验的过程使他们学习基本的编码和给他们更多的机会与数据科学家合作,向他们提供技能,在日益数字化的未来。
加速药物开发
制药公司也在寻求加速他们的研究和发展项目。他们的目标是将他们的产品尽快推向市场。
云计算实验室迅速加快药物开发的步伐。由于实验进行半自动运行,可以同时运行几个,一天24小时,一周7天。总的来说,这使得公司能够更快更多的实验运行,提高一个组织的能力发现和发展前景的候选药物。
近年来,公司从横寻求援助,希望加速他们的科学工作。在短期内,横将执行这项工作不到内部成本来处理它。然而,通过外包CRO公司委托的CRO的责任不仅执行他们的实验设计。这创造了更多的机会,无意中引入协议错误和运营商的偏见。
其他公司的集成和自动化实验大部分工作流来减少成本和增加再现性。这使制药公司保留所有权的实验执行,但这些产品的灵活性,限制一个科学家的能力,以适应不断变化的实验需求。云实验室提供最好的两种解决方案:科学家控制实验的各个方面,从设计到数据分析和报告,而不需要执行任何日常实验室工作或其他物流活动本身。
横可以受益于云计算实验室。通过云计算实验室执行他们的服务,他们可以加速自己的科学工作和交付成果制药客户更及时的方式。
解决再现性危机
因为2015年的一项研究认为 科学家们每年产生280亿美元的unreproducible临床前数据 、生命科学公司和大学世界各地跑发现危机的来源和识别方法来解决它。多年来,科学家已经发现了几个原因,包括不可靠的仪器,动力不足的数据集,描述不良研究协议,和不一致的记录方法,导致普遍的数据丢失。
许多公司和实验室开发了工具和策略,减轻一些再现性危机的原因。一些人致力于开发更精确的仪器而其他人已经开发出电子实验室笔记本(eln)和实验室信息管理系统(LIMS)减少摩擦让科学家准确、完全记录与实验相关的程序和数据。虽然这些零碎的解决方案解决一些危机的具体原因,阻碍了它们的直接需要科学家继续执行他们的实验。
民族解放军和LIMS提高可追溯性更可靠的观测和记录在实验室里科学家们在做什么。但云实验室从相反的方向接近的问题:平台允许科学家完全数字化设计和执行他们的实验。平台给科学家们提供了一个完整的命令集的每个变量和选择在实验室里,通过这组命令和通过设计实验,科学家必须,根据定义,完全的命令是有效的描述了他们的实验。这些命令驱动协议得到默认记录并存储在云上。因为每一个协议都有完全定义的命令集,研究人员可以很容易地多次执行相同的协议,建立完全可追踪性和可再生的工作流。这增加的力量数据集的概率,增加一个人的数据是有效的。云计算实验室的半自治的性质也减少了人为错误和偏见,可能会干扰实验结果。与独立的自动化解决方案不同的是,这些好处适用于整个范围和生命周期的一个实验。
此外,为了保证人员,他们的实验运行得当,云实验室联系所有相关数据(环境监测、仪器条件、样本数据、材料证书的分析,等等)回协议本身。这个过程也提高了再现性,因为科学家可以综合比较所有方面的一个协议与另一行代码。这使研究人员能够迅速排除不一致的结果,例如,确定两个实验中使用的试剂来自许多不同。
民主化与云计算实验室的科学研究
除了降低成本,加速药物开发,增加再现性,云计算实验室也使研究更具包容性。 因为研究人员不需要在实验室进行研究,科学家在世界各地获得最新的工具和技术。这不仅减少了π启动成本和公司但是还使实验室雇佣有才能的科学家无论他们住在哪里。大学甚至能够使用云实验室教育他们的学生遍布世界各地。例如,卡耐基-梅隆,位于宾夕法尼亚州匹兹堡市 自己的本科生实验运行 通过一个 cloud lab附近的旧金山 加州,学习如何执行研究。
总的来说,云计算实验室正在改善的研究是如何我们也只是刚刚开始看到的方式完成的。制药公司和大学将继续发现更多的好处云实验室采用更广泛的方法,用它来发现新的知识,造福人类。
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