在药物发现表型筛选的作用

兴趣表型筛选作为小分子的一种手段药物发现近年来持续增长。不久前似乎更传统的表型,药理和生理方法被忽视靶向性的方法和基因组学开始采取中心舞台。当然,一旦一个制药公司采用基因组学方法,似乎每一个其他公司效仿。在ELRIG药物发现发布会上,主持人。Nessa凯里PraxisUnico国际主管,提出问题:“下一代哪里真正实用(药物)目标?”

幸运的是,有兴趣使用表型筛选作为一个替代靶向性筛选。¹有一个日益增长的好奇的潜在好处结合表型和基因数据,为了促进小分子药物发现。

尽管有很多强调靶向性药物发现,它实际上并没有转化为有效药物的批准。

这是通过分析药物发现的策略来支持来自美国食品和药物管理局(FDA)认为first-in-class的小分子药物发现,更多被确定使用表型筛查相比,靶向性。²

确定药物使用表型筛选候选人

与靶向性药物发现,表型筛选不依赖于知道特定药物的身份目标或其假设在疾病中的作用。这种方法有一个关键的好处在靶向性筛选,是其能力来捕获复杂的生物学机制,否则将无法实现。³增加细胞信号网络的理解参与一种疾病过程可以减少临床失败的数量通过识别因素意想不到的活动,毒性和缺乏有效性。⁴

”有一个丰富的信息在单个细胞出现细胞形态学和细胞核等细胞器的形态,信息来源于染色,从简单的核染料免疫细胞化学检测特定的蛋白质,甚至环境特性,比如如何在复杂的模式或决定细胞组织有自己的空间,”大卫。Danovi博士,主任HipSci细胞表现型,伦敦国王学院。

两个主要表型筛选方法

在活的有机体内化验

这些允许直接筛选的化合物在临床疾病模型。一个缺点是,这些模型通常是低吞吐量由于他们的错综复杂。更高的吞吐量大规模在活的有机体内表型屏幕开发并可以同时用于测试一组疾病。³虽然在某些情况下,这些可能不是商业或伦理上可行。

有一个选择。创新自动化表型筛选平台开发了镜子在活的有机体内环境在一个在体外设置,最终捕获通常从表演中获得的见解在活的有机体内化验。⁵可以跨多个屏幕化合物人类疾病模型,以高通量自动化方式无疑是一个“双赢”。安全性、有效性,⁶药效、毒性⁷和机制的行动都可以产生一个平台的信息,最终确定在一个系统镜像病人生理治疗的潜力。

基于单元的(在体外)化验

基于单元的(体外)分析提出一个重要的优势;即,这些可以很容易地适应自动化的高通量格式表型分析。³尽管已经有相当大的进步在表型细胞筛选工具仍有挑战与这种方法有关。这些包括验证“击中”,揭露这些热门的分子靶点,也称为目标反褶积。^8,9

细胞分析:优点和局限性

小型化:得到最出你的分析

有已知的实施障碍高通量的方法基于单元的分析,其中包括;成本、可用性的细胞和复杂的多步方法要求进行试验,所有因素方程。它引出了一个问题,如何提高可伸缩性的潜力分析吗?“高通量梦想。

采用1536孔格式打击其中的一些因素,降低总体成本,提高了识别的效率。然而,实现1536 -格式板块并不总是一帆风顺,必须注意保存试验数据质量和边缘效应等因素(恶化分析性能在高通量)需要在检查。^10,11

准确的分配和彻底洗板,绝不是唯一的因素,但的确很重要,是一个成功的关键因素分析。采用精确的分配和彻底的洗板技术,自动设置,允许您生成一个试验的好,一致的质量最终导致优化筛选结果。调剂和吸气时,派拉蒙,吸管提示高度仔细计算。很难达到高度一致的愿望意味着过多的液体可以留在盘子的底部的最后程序,留下剩余增长媒体,这是会影响细胞的生存能力。¹²另外,身高太靠近底部的一个愿望板也可以导致细胞层的扰动。给洗,另一种“自旋”最近的一篇论文Corin米勒等人取代愿望与离心去除增长媒体从他们在体外受体效力分析。¹³这种方法减轻担心吸管技巧可能会干扰测定。¹⁰

三维组织培养:代表在活的有机体内功效

三维(3 d)组织培养系统提供更精确的生理环境的优势,相对于二维(2 d)单层文化。虽然有价值,2 d细胞培养用于细胞筛选有局限性,限制能力反映的功效在活的有机体内环境中,这可能导致误导性的数据。¹⁴这当然是一个需要进一步的发展和进步,增加化合物的识别与进步临床发展的潜力。



“在组织文化本身有明确限制,其中一些(实际上我认为少数)被3 d解决文化的方法。壮观的图像可以获得先进的显微镜技术和这些通常不可能变成实际数据与一个像样的健壮的表型筛选吞吐量。另一方面,简单的图像分析时借给自己收购成千上万的特性,也不容易摔跤。繁琐的计算基础设施,很少有标准,难以掌握实验的重现性,例如,在不同的实验室主要做点工作。“大卫。Danovi博士,主任HipSci细胞表现型,伦敦国王学院。

表型筛选:我们要从这里去哪里?

尽管表型筛查确实有其局限性,几种方法已经在开发帮助克服这些挑战并优化其使用作为一个成功的小分子药物发现方法。

接近小心筛选技术和简化分析协议,适应高通量方法和仔细考虑哪些因素可能影响质量都应该帮助最大化你的筛查试验的成功。

这将是有趣的,看看表型筛选对小说的影响复苏药物发现,我们是否看到增加的百分比新分子实体识别使用表型方法在未来几年。

Refere生均

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