启用深度测序

集成DNA技术(IDT)最近延长了它的门店面板的投资组合xGen®遗传疾病面板和xGen Pan-Cancer面板。这些新产品加入xGen AML小组在去年年底发布。

了解更多最新增加IDT产品线我们采访了易卜拉欣Jivanjee门店产品经理踊跃参与。

阿瑟:你能告诉我更多关于xGen遗传疾病面板和xGen Pan-Cancer面板吗?

易卜拉欣Jivanjee (IJ): xGen®遗传性疾病和Pan-Cancer电池板的biotin-modified寡核苷酸池用于有针对性的下一代测序。这些寡核苷酸作为xGen出售封锁探针,通常长120核苷酸,旨在结合DNA片段组成的基因感兴趣的研究人员。遗传性疾病面板包含超过100000 xGen封锁探测器,目标4503个基因和180个snp与遗传性疾病相关。Pan-Cancer小组目标12 127个基因与肿瘤类型。这些电池板使更深层次的覆盖率在测序,为临床应用提供更大的敏感性。

阿瑟:他们如何补充当前IDT产品线?

IJ:这两个新面板解决独特的问题。CLIA实验室,外显子组测序获得广泛使用快照的疾病导致突变。然而,这种方法的缺点是,大多数基因的外显子组不相关的诊断或治疗疾病,导致浪费数据(增加成本,但降低效率)。遗传性疾病面板平衡外显子组测序的好处与自定义面板测序的成本效益。Pan-Cancer面板提供一个稍微不同的目的。踊跃参与,每个探测器分别合成为质量控制和评估,使研究人员很容易添加更多的探测到现有的面板。我们看到当前Pan-Cancer面板作为发展的起点全面、肿瘤特定小组因为研究人员可以通过添加自定义探测目标基因相关的特定癌症接受调查。

阿瑟:xGen遗传疾病面板设计与艾莫利大学遗传学合作,这种合作使发展如何?

IJ: IDT科学家设计的探针和协议面板。然而,我们依赖于埃默里遗传学实验室的专业知识在临床测序为我们提供一个策划的基因列表。埃默里遗传学的科学家们也踊跃参与提供了反馈功能的性能。

AB。的发展xGen Pan-Cancer面板是基于发现的癌症基因组图谱(TCGA)网络,那么,TCGA到底扮演了什么样的角色在这个发展?

IJ:基因被确定,TCGA的出版物。我们也与关键成员TCGA的网络验证我们的面板。举个例子,我们的第一个TCGA-based小组针对急性髓系白血病是由华盛顿大学基因组研究所广泛使用,TCGA网络的一员。

阿瑟:IDT发射了第一门店面板,xGen AML面板,2013年10月。有收到这是怎么接待充当司机添加进一步的产品范围吗?

IJ:我们已收到良好的反馈来自工业和学术界的研究人员。我们兴奋华盛顿大学AML采纳专家组的鉴定和监测疾病进展的患者。华盛顿大学的科学家们提出这些数据在第15届AGBT海报(基因组生物学和技术的进步)会议在2014年2月。

易卜拉欣Jivanjee说阿什利董事会,管理编辑技术网络。188金宝搏备用你可以找到阿什利Google +并遵循技术网络188金宝搏备用推特。