单细胞蛋白质组学提供了洞察细胞功能的分子机制,可以应用于健康和患病的细胞。IsoPlexis”使用单细胞蛋白质组学技术在全球范围内研究人员理解免疫细胞的复杂角色,特别是多功能细胞。在最近的一篇论文发表在细胞,公司的平台是受雇于研究人员旨在解开长COVID背后的风险因素。
我们赶上了肖恩·麦凯网的CEO和创始人之一,IsoPlexis,找出更多关于平台和单细胞功能蛋白质组学是如何导致我们对健康和疾病的理解。
凯蒂布莱顿(KB):单细胞蛋白质组学方法推进复杂疾病的理解?
肖恩·麦凯(SM):精密医学的进步,治疗越来越适合每个特定病人的个人需求。这些个性化的药物依赖于更高级的技术,提供了一个更高的分辨率和更深入的访问权在活的有机体内生物学创造持久的治疗对健康的影响。
基因组和表面标记分析,研究人员失踪的关键功能信息在蛋白质水平。传统的批量方法平均在所有细胞,失去关键细胞属性理解的反应患者的关键。
单细胞功能蛋白质组学揭示了重要功能细胞属性驾驶免疫反应,让研究人员获得更深的洞察策划的细胞反应在我们的身体。从本质上讲,更好地理解免疫细胞功能可以受益的理解和治疗各种各样的疾病。
安娜·麦克唐纳(AM):区分IsoPlexis从其他单细胞技术方法?
SM:我们的平台,包括IsoLight IsoSpark,标识“超级英雄细胞”通常会被忽略的流式细胞术和单细胞基因组学。我们正在调查免疫系统揭示独特的免疫生物标志物在一小部分高度多重的细胞,我们称之为“超级英雄细胞”。这些超级英雄细胞本质上是高度功能的免疫细胞,安排一个人如何回应治疗。多官能度被发现与高度与关键免疫的见解,如力量、持久性和长期反应的病人发表在各种研究。
首次IsoPlexis技术,我们可以识别和预测这些超级英雄细胞安排更早的免疫反应在临床过程中,通过功能蛋白质(如细胞因子、趋化因子、生长因子等)。通过这种方式,我们可以“调”免疫疗法和靶向治疗在细胞行为水平,这样他们更精确和个性化。
问:你能告诉我们更多有关吗功能细胞库和它是怎么形成的?什么是“超级英雄”和“大反派”细胞,和他们是如何确定?
SM:高度的功能细胞库是一个产业界首次映射功能,proteomically驱动细胞,惟一地标识IsoPlexis的平台,决定人体如何回应复杂的疾病和治疗。
这些细胞可以是“超级英雄细胞”(高度多重的细胞的预测能力,病人反应,生存,等等),或者“信心满满的细胞”(高度预测的多官能的细胞炎症、毒性、疾病进展,等等)。
通过识别全方位的罕见而重要的多官能的细胞,图书馆分类这些细胞是如何被用来预测细胞产品的功能属性和疫苗功效,预测和监控病人对治疗范围广泛的高影响期刊。
补充基因组数据用于映射人类细胞图谱、功能性细胞库增加了一层独特的蛋白质组学数据广泛的超免疫和肿瘤细胞类型IsoPlexis惟一确定的单细胞功能蛋白质组学。功能性细胞库提供桥利用独特的功能表型出现数据病人反应在活的有机体内临床前、平移和临床应用。
它是一种宝贵的资源在肿瘤学、免疫学、神经学、自身免疫性疾病和传染病以及细胞和基因治疗,靶向疗法等等。现在可以作为一个行业,literature-referenced,并持续更新资源利用独特的功能表型出现数据在各种细胞类型的产品生产和质量控制以及临床前、平移和临床应用。
KB:你能给我们研究发表在的概述细胞吗?关键的发现是什么?
SM:本文题为“多个因素预测早期急性COVID-19后遗症”,研究人员相关病人的症状与深入剖析blood-based生物标志物在COVID-19感染确定急性后遗症的发展的相关因素COVID-19 (PASC)。长COVID PASC是技术术语,即。,a range of new, returning or ongoing health problems people can experience four or more weeks following infection.
作者跟踪调查了309名患者从最初的临床诊断急性疾病,早期康复生成2 - 3个月post-diagnosis识别因素导致长COVID早期,如频率增加信心满满的免疫细胞的子集。
KB:你能告诉我们如何IsoPlexis单细胞功能蛋白质组学平台帮助识别不同的免疫细胞和炎症的存在COVID多久?
SM:IsoPlexis的单细胞蛋白质组学提供了一个独特的评估分析的功能影响不同的细胞在多个时间点和先天和适应性免疫反应之间的相互作用,导致长COVID效应函数或炎症。
IsoPlexis蛋白质组学发现之间的关联,“大反派”T细胞的频率增加子集1型、2型和中间极化endotypes PASC和疾病的严重程度在恢复期。单细胞功能数据也证明了“大反派”单核细胞在恢复期的病人与健康受试者相比,与所有四个可识别endotypes PASC,表明单核细胞的影响持续炎症恢复期。
KB:现在的研究已经确定了四个endotypes COVID-19急性后遗症,这些信息可以被用来塑造治疗策略如何?
SM:通过了解信心满满的细胞炎症疾病如COVID-19开车,我们可以将这些知识应用到更广泛的炎性疾病的关键挑战,如对疾病进展或识别潜在的治疗目标。我们的平台曾被用于促进疫苗研发以及了解移植排斥反应的机制,细胞因子释放综合征和毒性,自身免疫性炎症。
KB:除了COVID-19,其他疾病和应用领域单细胞功能蛋白质组学中获益?
SM:我们的单细胞功能蛋白质组学应用于免疫监视和免疫健康是至关重要的。功能性单细胞分析我们的平台已经发表在几项研究中我们读出独特预测病人属性在癌症免疫学等研究领域,细胞疗法,自身免疫性炎症等。
最近的两自然医学论文展示的独特效用IsoPlexis的单细胞蛋白质组学平台,预测新细胞疗法的效力,包括嵌合抗原受体(汽车)t细胞在血液癌症肿瘤浸润淋巴细胞对实体肿瘤(尖)。的最大挑战之一,在改善细胞免疫药物疗法是准确地理解这些生活工作,尽早。通过这两个高影响力出版物,研究人员利用我们独特的单细胞蛋白质组学分析,更好地了解如何CAR-Ts和尖功能,从而导致提高评估质量、强度和耐久性。
此外,我们的平台确认blood-based生物标志物与病人反应和无进展生存的2期临床试验结合检查点和小说- 2受体激动剂治疗,发表在《临床肿瘤学》杂志上。
KB:什么你想说的吗?
SM:我们最近Duomic介绍,这为研究人员提供了独特的能力来识别基因表达谱的高功能的超级英雄和大细胞。第一次,研究人员可以捕获功能蛋白质组学和基因表达相同的单个细胞。这使研究人员深入到基因司机的“超级”细胞,与应用程序:
- 揭示的遗传司机车T细胞创建下一代疗法更有效和持久
- 分析细胞剧目,加速对免疫系统的理解和能力开发新的疗法
- 重新编码基因和基因通路驾驶治疗抵抗和肿瘤进展
肖恩·麦凯说凯蒂布莱顿,科学文案和安娜·麦克唐纳科学作家技术网络。188金宝搏备用
