总会在研究中提高生产力
BioDatomics介绍公司的第一个商业产品在美国人类遗传学协会(ASHG) 2013年在波士顿会议。BioDT™是一个开源的下一代测序数据分析软件和服务,旨在解决现有的数据分析产品的缺陷发现通过提供更高的性能和一个直观的界面
我们采访了BioDatomics的联合创始人和首席营销官,艾伦Taffel在门店以及如何了解更多关于数据分析BioDT使更快的分析。
阿瑟:多大的瓶颈门店数据分析?
艾伦Taffel(在):数据分析是上天的瓶颈。现代基因组测序仪可以非常有效地取样和交付相关的数据作为FastQ或BAM文件。分析这些数据需要时间有三个原因:1)研究人员或bioinformaticians必须计划一个“工作流”,将执行所需的分析数据;2)工作流必须执行,这可能需要几天或几周;3)表格结果必须进一步分析以获得实际的见解。
阿瑟:分析大数据时用户面临的问题是什么?
:不少。专业技能是需要创建工作流和分析它们的执行的结果,这意味着bioinformaticians必须参与,可以是一种稀缺资源。同时,研究者可以更有效的如果他们能实时相互合作,但目前的分析平台,除了BioDT,没有这种能力。最后,因为大多数分析平台都是闭源,研究人员局限于一组有限的专有的工作流。
阿瑟:BioDT如何启用快速分析?
:除了允许研究人员和bioinformaticians创建和修改工作流程用一个简单的拖放界面,然后可视化结果而不是展示他们神秘的表,BioDT执行工作流比其他平台快100倍。这是通过专门的执行引擎,工作流分解成并行任务而不是一个长连环任务,结合Hadoop的大数据分析功能。
阿瑟:更快的数据分析支持什么?
:工作流,目前需要数天或数周在其他平台上可以在几个小时BioDT执行。
阿瑟:如何BioDT收到市场到目前为止,在ASHG怎么样?
:大多数BioDatomics展台的参观者ASHG最初怀疑BioDT代表一个真正的进步研究生产力。可以肯定地说,没有一个离开不服气。这种印象是出生在市场。Digicon, IT服务提供商美国政府(尤其是NIH)审视市场生物信息学分析平台,经过严格的评估选择BioDT。类似地,著名的j·克雷格·文特尔研究所,熟悉所有生物信息学平台,已经记录(见新闻稿)BioDT的赞誉。
艾伦Taffel说阿什利董事会,管理编辑技术网络。188金宝搏备用你可以找到阿什利Google +并遵循技术网络188金宝搏备用推特。
