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使用数据沿袭和可追溯性来优化发布潜力


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想要在高影响力期刊上发表文章吗?频繁、高影响力的出版物是研究人员展示其工作的最有力方式之一。它可以巩固研究人员的声誉,为合作和授予奖项成功打开大门。因此,加强高影响力的发表机会可以帮助早期职业生涯和已经建立的研究人员在他们所选择的领域取得成功。

准确和可访问的数据是维护科学期刊出版标准的关键,也是出版的关键因素。最近的一些论文面临撤稿,原因是糟糕的数据报告引发了不当行为的怀疑。1虽然撤稿并不总是表明研究欺诈,但与发表召回相关的耻辱可能会对研究人员的声誉产生怀疑。为了避免这种后果,建立最佳实践数据记录工作流程是至关重要的,它可以优化原始研究的发表潜力并支持成功。

本文概述了数据沿袭和可追溯性的关键原则,这是建立良好数据记录实践的两个重要因素。它探讨了如何利用电子实验室笔记本进行数据管理和共享来优化原始研究的发表潜力。

什么是数据沿袭?

在科学术语中,血统是指从一个共同祖先开始的后代序列。类似地,数据沿袭描述数据集从收集到发布的演变。数据沿袭通常包含分析、可视化或解释方面,并包括如何转换数据。它有助于评估数据质量,并允许跟踪和识别回溯源。2

数据沿袭与可追溯性

虽然谱系描述了数据集的演变,但可追溯性确保了信息追踪既合乎逻辑又健壮。就像警方调查中的证据保管链一样,数据可追溯性确保了信息可以通过研究阶段进行跟踪。良好的数据可追溯性可以包括明确的审批流程、数据输入的电子签名或数据输入的时间戳。这些实践确保信息的使用合乎道德、有效,并符合政府指导方针或行业标准。3.

图1:数据沿袭(蓝色)和数据可追溯性(黄色)在研究发表、合作和资助奖励成功中的作用。

数据沿袭和可追溯性一起确保了可发表结果的完整性和可重复性(图1)。它们不仅阐明了实验结果是如何获得的,而且还支持了发现的验证,并增加了研究人员的学术可信度。最近在高影响力期刊上发表的两篇论文因原始数据的获取问题而面临撤稿。1两篇论文共享了相同的数据源,但两篇论文的作者都无法访问原始文件。当无法追踪数据谱系时,对欺诈性不当行为的怀疑就会得到支持,作者的职业生涯就会受到严重的负面影响。4

科学不端行为并不总是意味着数据欺诈——它还可能包括未能报告重要的实验细节。1如果没有足够的数据沿袭和可追溯性,当细节在后续才变得相关时,有价值的信息可能会丢失。北美和欧洲的主要资助机构都独立发布了新政策来反映这一点,重点是良好的数据管理和共享实践。5认真的数据谱系和数据可追溯性有助于满足这些准则,通过减少不必要的实验重复来确保资金和最大限度地提高研究效率。

保持公平数据的重要性

FAIR指导原则强调,与科学出版物有关的所有数据和元数据必须是可查找的、可访问的、可互操作的和可重用的。实现公平数据是正确的数据管理的先决条件。确保研究项目的数据受到保护、可用和可信也是实现公平数据的关键。不同的工具通过将与研究相关的数据集中在一个地方、注释、可跟踪、可搜索、易于可视化和理解,有助于改善数据管理。6

可视化数据实验过程的工具

可视化实验过程是确保适当的完整性措施到位的最简单的方法之一。通过以可视化格式绘制研究任务和过程,科学家可以快速找到答案,并建立重要的验证步骤(例如,重复次数、对照、质量控制等)。可以捕获与每个步骤相关联的结果,确保不会错过关键信息。因此,支持可视化的工具可以帮助研究人员为他们的数据做出正确的选择,并阐明为什么做出了关键的研究决策。

电子实验室笔记本(eln)可以促进实验步骤以及沿袭和可追溯管道的可视化。因此,eln为研究人员提供了一个令人兴奋的机会,以优化他们的发表潜力,为合作做准备,并增加拨款奖励的成功。


什么是ELN?

eln是一种计算机软件包,旨在取代传统的纸质实验室笔记本。像纸质笔记本一样,eln用于记录协议信息、原始数据和实验观测。然而,许多包集成了额外的实验室管理、协议模板、库存管理和电子签名特性。


ELNs vs LIMS

实验室信息管理系统(LIMS)也提供了记录数据可追溯性信息的机会,然而,LIMS通常被设计用来记录结构化数据。由于eln允许用户记录非结构化数据,例如观察和分析,它们为许多学术实验室提供了比LIMS更大的优势。7一些eln和LIMS将具有审计跟踪、电子签名和时间戳等属性;这些特性可以确保可靠的可跟踪性和数据完整性。下面的图表概述了在选择ELN或LIMS时可能需要考虑的实验室。注意,这是广义的;不同的ELN和LIMS系统可能提供本图表中未包括的附加功能。

表1: ELN和LIMS的主要区别


在构建数据跟踪工作流时考虑到协作

合作是科学思想生命周期的关键;它使研究人员能够扩大他们的影响并获得有价值的资源。此外,与工业界的伙伴关系可以支持商业化,并引入新的想法,使公众受益。8选择正确的ELN,考虑到数据沿袭和可追溯性,可以使研究小组在合作和技术转让过程中的任何阶段都能发挥作用。此外,正确的ELN可以最大限度地减少花费在昂贵的重复实验上的时间,这些重复实验会延迟科学思想的发展。

SciNote ELN为研究人员在其职业生涯的任何阶段寻求合作提供了一个负担得起的数据文档解决方案。SciNote独特的项目/实验/任务结构和数据管理功能可以支持实验室的发展。无论数据是为演示、出版还是技术转让而准备的,SciNote都允许研究人员在设计工作流时考虑到知识交换。

使用SciNote,数据自动备份到云端,消除了物理损坏的风险,并确保信息始终可用以共享。谢天谢地,虽然火灾和水的破坏是罕见的,但在实验室环境中,它确实构成了重大风险。9SciNote保护数据安全,避免物理损坏或错误放置,从而破坏纸张或本地存储的电子记录。此外,由于数据集中在线存储,以及访问控制功能,当实验室成员离开时,信息永远不会丢失。这在科研领域尤其重要,因为科研人员和学生的流失是经常发生的,博士后的稀缺也是普遍现象。10SciNote可用于将项目和实验分配给小组成员,这意味着一旦有新成员加入小组,就可以根据专业知识分配重要任务。这种功能有助于研究顺利进行,并为快速变化的学术环境提供了一层保护。

SciNote现在还集成了protocols.io-为协议共享和方法优化设计的安全协同研究平台。科学家可以直接访问协议。io通过SciNote而不需要协议。io帐户。该特性使搜索和导入外部协议变得快速和简单。通过适当的认证,外部协议可以直接保存在研究人员自己的ELN中,节省时间并确保可追溯性。

数据沿袭、可追溯性和良好实践指南

遵循良好实践指南对于希望发表成果和/或保证资金的研究人员至关重要。由于数据沿袭和可追溯性是良好实验室和临床实践的基础,因此eln可用于支持合规性。

什么是良好的实验室操作规范

良好实践指南列出了流程和程序,如果遵循这些流程和程序,就会产生最佳和最合乎道德的结果。

良好实验室规范(GLP)是指为人类健康开发产品而制定的非临床安全和监管研究标准。这些原则确保在非临床安全性研究期间产生、处理和报告的任何数据都是高质量和完整的。11

eln如何支持GLP遵从性?

在美国,联邦法规(CFR)第21篇第11部分定义了确保电子签名和电子记录可靠和值得信赖的标准;只有获得授权的人员才能访问电子数据。12、13食品和药物管理局(FDA)的要求也转向电子数据提交,以简化临床数据审查。

关于良好数据管理和共享的政策总是会发生变化。例如,美国国家卫生研究院(NIH)最近发布了一项新的数据管理和共享政策,以更新当前的政策。14使用eln来组织数据沿袭和可追溯性,使研究人员能够快速响应可追溯性指南和数据共享政策的变化,并保护数据完整性。SciNote提供电子签名、审计跟踪、时间戳、用户角色和权限支持21 CFR第11部分规定的GLP合规要求,同时保持系统的灵活性和易于使用。

提高工作效率,节省时间

使用SciNote可以显著提高工作效率;在完成相同工作量的同时,个人每周可以节省大约9个小时(图2)。15项目报告可以自动生成,使该过程比手工方法快90%。此外,使用模板可以轻松地可视化项目和依赖项,使计划和调度速度提高80%。16SciNote还提供了额外的实验室管理工具,如库存管理,可以进一步减少花在日常任务上的时间,提高工作效率。

图2:不使用SciNote和使用SciNote的每周工作量的时间比较(中位数/工作类别)。

结论

在科学研究中建立可靠的数据谱系和可追溯性工作流,可以节省时间,提高生产力,同时支持GLP合规。SciNote确保了易于数据访问和可视化,从而最大限度地减少了在昂贵的重复实验上浪费的时间,从而推迟了发表。通过支持数据共享和管理的最佳实践,SciNote促进了高影响力的出版、合作和资助奖励的成功。

了解更多关于ELN如何支持出版数据管理和拨款写作的信息。

参考文献

  1. Boetto E Golinelli D Carullo G,et al。科学研究中的欺诈行为以及如何可能地克服它们。医学伦理学doi: 10.1136 / medethics - 2020 - 106639
  2. 数据来源和沿袭:数据追踪的技术指南。第1部分数据共享支持中心。https://eudatasharing.eu/technical-aspects/data-provenance-part-1.2022年11月3日访问。
  3. 良好生产规范和良好分销规范指南:问题和答案。欧洲药品管理局。https://www.ema.europa.eu/en/human-regulatory/research-development/compliance/good-manufacturing-practice/guidance-good-manufacturing-practice-good-distribution-practice-questions-answers.2022年11月3日访问。
  4. 随着丑闻细节浮出,参与撤回《柳叶刀》研究的研究人员被终止教职。统计新闻。https://www.statnews.com/2020/06/07/researcher-involved-in-retracted-lancet-study-has-faculty-appointment-terminated-as-details-in-scandal-emerge/2020年6月7日发布。2022年11月3日访问。
  5. 研究数据管理指南:NIH 2023和欧盟委员会政策。SciNote。https://www.scinote.net/nih-2023-policies-whitepaper-overview-235524/发布于2022年1月19日。访问时间为2022年11月4日。
  6. 公平原则-研究人员的关键信息。SciNote。https://www.scinote.net/blog/fair-principles/发布于2022年7月6日。2022年11月3日访问。
  7. ELN, LIMS, cd, LES:有什么不同?188金宝搏备用技术网络。//www.dile1000.com/informatics/articles/eln-lims-cds-les-whats-the-difference-313834.2019年1月11日发布。2022年11月3日访问。
  8. 斯坎杜拉,A, Iammarino, S.与工业界的学术接触:研究质量和经验的作用。技术转让.2002; 47:1000 - 1036doi.org/10.1007/s10961 - 021 - 09867 - 0
  9. 防止科学实验室火灾。全国科学教学协会。https://www.nsta.org/blog/preventing-science-laboratory-fires.2019年2月27日发布。2022年11月3日访问。
  10. 伍尔斯顿C.实验室的领导们正努力解决博士后短缺的问题。自然.2022; 10。doi: 10.1038 / d41586 - 022 - 02781 - x
  11. 良好实验室规范(GLP)。组织
    经济合作与发展。https://www.oecd.org/chemicalsafety/testing/good-laboratory-practiceglp.htm.2022年11月3日访问。
  12. 第11部分,电子纪录;电子签名。范围和应用。美国食品和药物管理局。https://www.fda.gov/regulatory-information/search-fda-guidance-documents/part-11-electronic-records-electronic-signatures-scope-and-application.2018年8月24日出版。2022年11月3日访问。
  13. 规范:良好的临床实践和临床试验。美国食品和药物管理局。https://www.fda.gov/science-research/clinical-trials-and-human-subject-protection/regulations-good-clinical-practice-and-clinical-trials.2020年1月1日发布。2022年11月3日访问。
  14. 新的NIH数据共享政策2023 -为什么共享是关心。SciNote。https://www.scinote.net/blog/the-2023-nih-data-sharing-policy/.发布于2022年8月10日。2022年11月3日访问。
  15. 实现电子实验室笔记本时的投资回报。SciNote。https://www.scinote.net/blog/return-on-investment-when-implementing-an-eln-in-your-lab/.访问时间为2022年11月4日。
  16. 科学实验室的管理工作。SciNote。https://www.scinote.net/solutions-for-labs/managing-work/#creating-templates.发布于2022年10月6日。访问时间为2022年11月4日。
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