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微阵列技术的进步有史以来最大的会议


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微阵列技术的发展会议,第四选择生物科学AMT事件,在巴塞罗那举行7 - 8,2008年参加了,有超过400名参与者,大约40参展商和一个完整的为期两天的计划。

事件发生在设备齐全的加泰罗尼亚国会宫在巴塞罗那,和附近的酒店Rey Juan Carlos。

同时“芯片实验室”和“生物技术的发展”会议在邻近的房间举行。

三个交易日处理“芯片诊断”、“微阵列技术”和“组织微阵列”,将在下面描述。也有一个广泛的和有很多人参加的海报部分。

•微阵列诊断会话(一天)包括有用的市场机会和趋势概述(Steven Bodovitz BioPerspectives,肯尼思•克鲁尔BioTechTelligence),强调多路复用的积极开发诊断和他们相当强劲验收(从开发人员和潜在用户)的调查,虽然强调需要有效的后续研究和广泛的医师教育。

详细讨论了潜在的分子诊断次市场,积极前景个性化治疗与疾病易感性的研究。概述DNA阵列技术和临床问题的诊断(Bertrand约旦,Marseille-Nice Genopole)讨论了不同类别的测试(基因分型与表达式分析),并表示他们接受相对较慢的原因——缺乏证据的临床实用程序在很多情况下,以及成本问题。

这个会话然后提出了几个品种的数组诊断:诊断全息阵列宪法异常(卡Szuhai,莱顿大学医学中心),在更换分析在临床实践中,CNV(拷贝数变异)分析使用瓷砖数组(赫伯特•奥尔生物医学研究所,巴塞罗那),microrna的数组和必要的步骤来获得有意义的结果(Miltenyi Stefan野生生物技术)。

Towia Liberman(贝斯以色列医学中心,哈佛)讨论了从表达式分析过渡到生物标记,和一个有用的概述非编码rna (microrna之外)是由Antje Kretzschmar(莱比锡弗劳恩霍夫研究所)。Schulze Label-free血型检定被Holger(爱丁堡大学)和迈克尔·Tainsky(韦恩州立大学医学院)显示面板的使用在癌症的肿瘤抗原检测自身抗原;他还详细的困难在获得生物标志物提供足够的敏感性和特异性。

李维Gheber(本-古里安大学)描述的初始步骤便携式排列生物传感器和精密加工技术的发展。会话还包括企业介绍:薇罗尼卡Mainfroid(埃普多夫)和彼得•罗伯茨(Febit生物医学),后者强调极端的灵活性Geniom microrna的系统研究。其他公司介绍(在其他会话)描述了Arrayjet高通量打印系统(伊恩•坎迪娅·迈克威廉),和英杰公司努力开发协议允许arrayCGH实验使用从石蜡包埋组织样本中提取的DNA(厄尼Guzman)。

•微阵列技术会议(一天早上)主要是致力于蛋白质微阵列。演讲由托马斯·乔斯(图宾根大学)显示已经存在的各种系统,倡导尽可能使用现成的技术。

“反相”蛋白质阵列(细胞或组织溶解产物发现然后探测特定的抗体)讨论了Ulrike Korf (DKFZ,海德堡),使用红外染料数组调查癌症、蛋白表达和约翰·奥斯汀(Aushon生物系统公司)显示实销系统制造的优点的数组”很难发现“实体如蛋白质或细胞溶解产物。

塔季扬娜Nasedkina(恩格尔哈德研究所(莫斯科)描述广泛采用临床诊断(俄罗斯联邦内)的凝胶垫阵列系统最初由安德烈Mirzabekov开发。

最后,史蒂夫·布莱尔(犹他大学)给了一个非常有趣的(如果有点可怕)讲多路复用的复杂性和陷阱在微阵列杂交,提高严重怀疑究竟是测量在一些实验…

•最后(下午)会议是围绕组织微阵列,临床上重要的应用程序(错误地)似乎是技术含量较低,很少深入讨论。分析组织阵列后反应与特定的抗体(免疫组织化学)是手动完成的劳动和花费时间的方式,并试图满足许多挑战:自动化数据非常复杂和人类专家的判断似乎是绝对必要的。

斯蒂芬·休伊特(NCI, NIH)强调了这种方法对癌症诊断和预后的重要性,并坚持较高的相关性相比,基因表达的蛋白质生物标记物的签名。一个现实的方法来组织阵列的自动化程序被住奥谢(SlidePath有限公司),强调部分自动化和协助专家的重要性,而不是试图取代他。非常先进的图像分析程序开发的定义(慕尼黑)约翰内斯·齐默尔曼所示,相当惊人的例子。

人类蛋白质图谱计划由弗雷德里克Ponten(乌普萨拉大学)。这个项目目前每年生产3000高度特定的人类蛋白质的抗体(80年团队的同事),使其广泛使用。这个非常有用的任务是在删除一个主要街区蛋白质阵列研究和生物标志物的发现,即有限的可用性良好的抗体。

总之,这总体上是好的,有益的和活泼的会议,非常有价值得到一个更新当前的技术和项目以及临床应用也很有用,当然,对于网络和业务讨论。委托混合(学术界、一半一半行业)很好,尽管它将吸引更多的高层次学术科学家很高兴。

在未来的版本,包括一个或两个可能是明智的会谈讨论应用程序的数组是竞争与下一代测序方法,这将有助于看到这两种技术各自的优点和缺点。

在组织方面,日程安排很好,非常密集的同时仍然允许足够的时间讨论和观看展览的海报。如果可能的话,最好是将商业展览的海报区域——这将进一步加强互动。该组织于完美的,提供一个开放的无线网络连接以开会为由欢迎补充。

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